More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2051 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
266 aa  499  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.913641  normal  0.0426886 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.92 
 
 
271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.11 
 
 
275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0877  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.78 
 
 
260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112184  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.08 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.48 
 
 
267 aa  145  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.549296  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.55 
 
 
283 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0441349  normal  0.902161 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.82 
 
 
270 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 
281 aa  142  8e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.44 
 
 
246 aa  138  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.85 
 
 
277 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0283642  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.25 
 
 
254 aa  136  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.63161  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06840  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system permease component  35.57 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3118  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.1 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000865  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter transmembrane component  35.57 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.08 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.21 
 
 
257 aa  132  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116723  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1578  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.82 
 
 
274 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000362296  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13670  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  35.25 
 
 
249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2376  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  34.39 
 
 
265 aa  125  5e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.77 
 
 
261 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
258 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1076  ABC transporter-like protein  39.15 
 
 
488 aa  123  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.276573 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4887  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.53 
 
 
267 aa  122  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19510  ABC transporter permease  39.09 
 
 
274 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0817  ABC transporter related protein  40 
 
 
492 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.309085  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2545  binding-protein-dependent transport system protein  31.78 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240068  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.82 
 
 
302 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.033554  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.89 
 
 
273 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4268  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.96 
 
 
282 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0113678 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.66 
 
 
268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.223421 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.47 
 
 
259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.318112 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.49 
 
 
254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.62 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.77 
 
 
274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
273 aa  119  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0493  putative ABC transporter, permease protein  29.69 
 
 
257 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2084  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.36 
 
 
260 aa  119  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.566245  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5061  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.81 
 
 
293 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.877762  normal  0.739003 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0491  ABC transporter, permease protein, putative  29.69 
 
 
257 aa  119  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0367  ABC transporter permease  29.69 
 
 
265 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0357  ABC transporter, permease  29.69 
 
 
265 aa  119  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1679  ABC transporter permease  38.27 
 
 
274 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.451747  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5341  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.06 
 
 
293 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.7364 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0424  putative ABC transporter, permease protein  29.69 
 
 
257 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0381  ABC transporter permease  29.69 
 
 
257 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.85 
 
 
250 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.19 
 
 
258 aa  118  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.90454  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0446  putative ABC transporter, permease protein  29.26 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.26 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4878  putative ABC transporter, permease protein  29.26 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  38.85 
 
 
286 aa  116  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.42 
 
 
268 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.59 
 
 
258 aa  115  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3330  ABC transporter membrane spanning protein  28.68 
 
 
295 aa  115  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.730487  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.84 
 
 
253 aa  115  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3877  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.18 
 
 
282 aa  115  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.901388  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0354  ABC transporter, permease  29.26 
 
 
265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.13 
 
 
281 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0476  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.74 
 
 
249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0202  ABC transporter, permease protein  35.93 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.18 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.283078  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0211  ABC transporter, permease protein  35.93 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0488  putative binding protein-dependent transport system, membrane component  41.56 
 
 
272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.970837  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000457845  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.88 
 
 
256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.75 
 
 
317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0255815  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7629  putative ABC transporter permease protein  33.19 
 
 
282 aa  112  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0784  putative ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.605831  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.22 
 
 
294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136656  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4547  putative ABC transporter, permease protein  32.92 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.113137  normal  0.441246 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1140  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
255 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.86 
 
 
276 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960786  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.72 
 
 
279 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.86 
 
 
276 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0881  putative ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00328051  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1169  putative ABC transporter permease protein  32.72 
 
 
279 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.05 
 
 
276 aa  109  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.936191 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.37 
 
 
256 aa  109  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.68 
 
 
258 aa  109  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0347556  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 
278 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7650  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  38.1 
 
 
247 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621765  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0797  ABC transporter, permease protein, putative  33.33 
 
 
250 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.36 
 
 
278 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.37818 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.25 
 
 
253 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.17 
 
 
243 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
255 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.62 
 
 
297 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.283538  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.44 
 
 
247 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0693  ABC transporter permease  32.5 
 
 
250 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0637  ABC transporter, permease  32.5 
 
 
250 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0727  ABC transporter permease  32.5 
 
 
250 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363276  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.44 
 
 
280 aa  106  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0794658  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0804  putative ABC transporter, permease protein  32.5 
 
 
250 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22036e-46 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  35.22 
 
 
285 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0637  ABC transporter, permease  32.5 
 
 
250 aa  106  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  35.37 
 
 
279 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2515  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.85 
 
 
282 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313862  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2638  ABC sulfonate transporter, inner membrane subunit  34.93 
 
 
279 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950643  hitchhiker  0.0000361652 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.81 
 
 
259 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>