More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5321 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 285 aa  552  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  80.65 
 
 		 279 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  83.08 
 
 		 279 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  79.21 
 
 		 279 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  86.32 
 
 		 279 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  80.88 
 
 		 279 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  61.11 
 
 		 284 aa  328  7e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  61.11 
 
 		 284 aa  328  7e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  61.11 
 
 		 284 aa  328  7e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  68 
 
 		 279 aa  326  3e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.746145 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  61.97 
 
 		 275 aa  302  5.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  68.42 
 
 		 275 aa  302  5.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  61.97 
 
 		 275 aa  302  5.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  61.97 
 
 		 275 aa  302  5.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.42 
 
 		 275 aa  301  7.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  68.02 
 
 		 275 aa  300  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  68.4 
 
 		 275 aa  298  9e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  62.22 
 
 		 272 aa  297  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0280  taurine transporter subunit  67.61 
 
 		 275 aa  297  1e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  67.61 
 
 		 275 aa  297  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2133  taurine ABC transporter, permease protein  66.08 
 
 		 283 aa  295  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0620  permease component of taurine ABC transporter  66.08 
 
 		 253 aa  295  8e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00192231  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  66.67 
 
 		 283 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1580  taurine ABC transporter, permease protein  66.67 
 
 		 253 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477521  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0396  taurine transporter subunit  62.32 
 
 		 275 aa  294  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  66.08 
 
 		 283 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  66.67 
 
 		 285 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0802  taurine ABC transporter, permease protein  64.44 
 
 		 283 aa  293  3e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207449  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12960  taurine ABC transporter permease  62.59 
 
 		 272 aa  285  8e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299757  normal  0.321121 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2535  putative taurine ABC transporter, permease protein  62.7 
 
 		 282 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4371  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.47 
 
 		 306 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0692  ABC taurine transporter, inner membrane subunit  56.88 
 
 		 306 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000618741  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.34 
 
 		 275 aa  261  6.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0877464 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.28 
 
 		 275 aa  257  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197989  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.74 
 
 		 282 aa  255  5e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0049  ABC taurine transporter, binding protein inner membrane component  53.39 
 
 		 330 aa  246  4e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0656508 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1470  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  53.07 
 
 		 301 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0085  taurine ABC transporter inner membrane protein  53.11 
 
 		 283 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.135193 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.58 
 
 		 306 aa  236  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4207  ABC taurine transporter, inner membrane subunit  53.75 
 
 		 289 aa  229  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.15 
 
 		 289 aa  229  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.085274 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7166  taurine uptake ABC transporter permease protein  52.31 
 
 		 261 aa  227  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.37 
 
 		 296 aa  227  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.201741 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2477  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.18 
 
 		 289 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0948255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.32 
 
 		 293 aa  226  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.46 
 
 		 289 aa  224  9e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6225  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  48.75 
 
 		 320 aa  220  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5576  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.8 
 
 		 284 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4284  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.44 
 
 		 272 aa  218  7.999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0949532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1488  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.89 
 
 		 280 aa  214  9e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.106569  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.39 
 
 		 321 aa  209  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.905374 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0761  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.4 
 
 		 412 aa  209  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.43 
 
 		 255 aa  202  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.17 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438311 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.17 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.17 
 
 		 269 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.36 
 
 		 257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.16 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.31 
 
 		 284 aa  186  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.780444  normal  0.280504 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.96 
 
 		 430 aa  178  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00472137  normal  0.430362 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4060  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.56 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.6 
 
 		 262 aa  176  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.577279 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  40.07 
 
 		 286 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1323  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  43.44 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0560082 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 		 286 aa  171  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.453695  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1503  taurine ABC transporter, permease protein  41.7 
 
 		 288 aa  170  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.51 
 
 		 264 aa  169  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.154719 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5517  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.66 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16627  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1684  ABC transporter permease  39.83 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19570  ABC transporter permease  38.08 
 
 		 262 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.01 
 
 		 283 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.13 
 
 		 291 aa  165  6.9999999999999995e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.13 
 
 		 268 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.55 
 
 		 300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0833403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.35 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.780897  normal  0.0430449 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  36.82 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.32 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.66 
 
 		 278 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.37818 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.11 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 		 288 aa  161  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.08 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1867  ABC transporter permease  36.4 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.22 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3459  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.22 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0101223 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.06 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.30868 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.36 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258867  hitchhiker  0.00000636426 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.08 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  0.0445843 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.08 
 
 		 265 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0722896  normal  0.022026 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5315  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  36.82 
 
 		 265 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.08 
 
 		 265 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4875  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.24 
 
 		 265 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.13 
 
 		 284 aa  159  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.27836  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1975  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.82 
 
 		 267 aa  159  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.59364  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2748  sulfonate/taurine ABC transporter permease  40.28 
 
 		 274 aa  158  9e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947189  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 		 297 aa  158  9e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.283538  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5412  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.08 
 
 		 260 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.210037  hitchhiker  0.00191971 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.14 
 
 		 281 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>