More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2638 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2638  ABC sulfonate transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
279 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950643  hitchhiker  0.0000361652 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  92.11 
 
 
279 aa  502  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  68.83 
 
 
286 aa  335  3.9999999999999995e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.67 
 
 
294 aa  314  8e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136656  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.21 
 
 
265 aa  268  7e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1385  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.44 
 
 
284 aa  268  8.999999999999999e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0616622  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4139  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  52.89 
 
 
275 aa  265  7e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000314222  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.61 
 
 
265 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19570  ABC transporter permease  51.37 
 
 
262 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.61 
 
 
265 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  0.0445843 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.81 
 
 
265 aa  258  6e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0722896  normal  0.022026 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.6 
 
 
265 aa  258  8e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.82 
 
 
264 aa  255  5e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0355  putative ABC aliphatic sulfonates transporter, permease subunit  48.82 
 
 
264 aa  255  5e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1453  alkanesulfonate transporter permease subunit  50.2 
 
 
263 aa  255  6e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.37 
 
 
268 aa  255  7e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.21 
 
 
264 aa  254  8e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1684  ABC transporter permease  50.98 
 
 
262 aa  254  9e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5412  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50 
 
 
260 aa  253  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.210037  hitchhiker  0.00191971 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.38 
 
 
272 aa  250  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.334714  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.78 
 
 
302 aa  247  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0528102 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.98 
 
 
264 aa  247  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.43 
 
 
272 aa  247  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.612608  normal  0.0470724 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.38 
 
 
315 aa  246  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.57 
 
 
264 aa  246  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.050552  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.29 
 
 
263 aa  246  4e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.21 
 
 
263 aa  244  8e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.2 
 
 
270 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0183453  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.86 
 
 
260 aa  236  2e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000143494  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4705  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  50.2 
 
 
270 aa  236  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.8 
 
 
270 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.8 
 
 
270 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0890555  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.8 
 
 
270 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.8 
 
 
270 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.4 
 
 
283 aa  235  6e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4875  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  49.81 
 
 
265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746085  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.8 
 
 
262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5468  ABC transporter membrane spanning protein (aliphatic sulphonate)  50 
 
 
284 aa  232  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165676  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.2 
 
 
273 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.5369  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5315  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  49.43 
 
 
265 aa  232  6e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1338  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.59 
 
 
260 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.011116 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1867  ABC transporter permease  49.59 
 
 
272 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.21 
 
 
284 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.27836  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.25 
 
 
273 aa  229  5e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2712  sulfonate ABC transporter permease  44.4 
 
 
282 aa  228  6e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2920  sulfonate ABC transporter permease protein  44.4 
 
 
282 aa  228  6e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2500  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  49.8 
 
 
268 aa  228  9e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1279  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.63 
 
 
272 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88893  normal  0.0504928 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2492  ABC aliphatic sulfonates transporter, innermembrane subunit  48.18 
 
 
280 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.773133 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.65 
 
 
268 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.22 
 
 
300 aa  227  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0833403  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.67 
 
 
278 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.37818 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1238  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  49.8 
 
 
273 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.466833  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.77 
 
 
286 aa  226  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1990  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  49.8 
 
 
273 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.088895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0780  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  49.8 
 
 
273 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.175921  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.98 
 
 
280 aa  226  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1724  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  49.8 
 
 
273 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0381  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  49.8 
 
 
273 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.410212  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.77 
 
 
282 aa  225  6e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0101223 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.54 
 
 
281 aa  225  7e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0683  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.34 
 
 
268 aa  224  8e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.473028  normal  0.58692 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30490  aliphatic sulfonate ABC transporter permease protein  51.65 
 
 
264 aa  224  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.168678  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.41 
 
 
264 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.154719 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.38 
 
 
278 aa  224  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1837  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  49.39 
 
 
269 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.669476  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1776  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49 
 
 
294 aa  224  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.34 
 
 
289 aa  223  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1822  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  48.99 
 
 
269 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.59 
 
 
270 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.150226 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00938  alkanesulfonate transporter subunit  51.24 
 
 
263 aa  223  4e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.028081  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.24 
 
 
263 aa  223  4e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.753275  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1036  alkanesulfonate transporter permease subunit  51.24 
 
 
263 aa  223  4e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0685931  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00945  hypothetical protein  51.24 
 
 
263 aa  223  4e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2662  alkanesulfonate transporter permease subunit  51.24 
 
 
263 aa  223  4e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.629834  normal  0.0100847 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1043  alkanesulfonate transporter permease subunit  51.24 
 
 
263 aa  223  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3599  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.36 
 
 
292 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0649453  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
292 aa  222  6e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.780897  normal  0.0430449 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1096  alkanesulfonate transporter permease subunit  50.83 
 
 
263 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00432775  normal  0.422148 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.79 
 
 
283 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189471  normal  0.0804385 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2185  alkanesulfonate transporter permease subunit  50.83 
 
 
264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.11182  normal  0.890131 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1975  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50.83 
 
 
267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.59364  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2959  sulfonate ABC transporter, permease protein, putative  44.17 
 
 
284 aa  220  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.132224  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.08 
 
 
297 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.283538  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.45 
 
 
271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0409101  normal  0.884011 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2663  alkanesulfonates transport system permease; sulfonate ABC transporter, permease  45.26 
 
 
282 aa  218  7e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2919  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  43.33 
 
 
282 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.35916e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2640  alkanesulfonates transport system permease; sulfonate ABC transporter, permease  45.26 
 
 
282 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.67 
 
 
280 aa  217  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.59 
 
 
259 aa  217  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00307443  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1380  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  42.97 
 
 
277 aa  216  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21600  aliphatic sulfonates ABC transporter, inner membrane component  43.93 
 
 
284 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
283 aa  212  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258867  hitchhiker  0.00000636426 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0250  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.37 
 
 
280 aa  211  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2313  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  44.54 
 
 
282 aa  210  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.797662  hitchhiker  0.00000011817 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2930  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  45.26 
 
 
282 aa  209  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1340  aliphatic sulfonate ABC transporter transmembrane protein  50.2 
 
 
264 aa  209  5e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0574559  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.53 
 
 
279 aa  208  8e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25857  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1796  sulfonate ABC transporter, permease protein, putative  44.16 
 
 
285 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0116  membrane protein  48.71 
 
 
281 aa  202  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0935043  hitchhiker  0.000854026 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>