More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3166 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007494  RSP_3166  ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
281 aa  554  1e-157  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  98.22 
 
 
281 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2545  binding-protein-dependent transport system protein  70.55 
 
 
287 aa  387  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240068  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.3 
 
 
261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.83 
 
 
281 aa  161  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.41 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.223421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.83 
 
 
273 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.41 
 
 
273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1169  putative ABC transporter permease protein  40.89 
 
 
279 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
277 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0283642  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
274 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.03 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116723  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
254 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.63161  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.8 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.318809  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7629  putative ABC transporter permease protein  32.76 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7650  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  41.05 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621765  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3093  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.57 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 
254 aa  129  6e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.157809 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.3 
 
 
246 aa  129  6e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0784  putative ABC transporter, permease protein  33.85 
 
 
250 aa  129  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.605831  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.6 
 
 
258 aa  129  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121812  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.3 
 
 
257 aa  128  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0637  ABC transporter, permease  33.46 
 
 
250 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0881  putative ABC transporter, permease protein  34.11 
 
 
251 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00328051  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.11 
 
 
251 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4547  putative ABC transporter, permease protein  34.11 
 
 
251 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.113137  normal  0.441246 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.7 
 
 
253 aa  126  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0637  ABC transporter, permease  33.07 
 
 
250 aa  125  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0693  ABC transporter permease  33.07 
 
 
250 aa  125  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0727  ABC transporter permease  33.07 
 
 
250 aa  125  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363276  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0804  putative ABC transporter, permease protein  33.07 
 
 
250 aa  125  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22036e-46 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0797  ABC transporter, permease protein, putative  33.46 
 
 
250 aa  125  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3210  ABC transporter, permease protein  33.94 
 
 
267 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3118  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.46 
 
 
284 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.98 
 
 
250 aa  122  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
267 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.417353 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.89 
 
 
270 aa  122  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.5 
 
 
253 aa  122  6e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000865  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter transmembrane component  34.02 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.39 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.99 
 
 
272 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.025765  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2703  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.51 
 
 
263 aa  120  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.88688  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1719  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.4 
 
 
264 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06840  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system permease component  32.8 
 
 
266 aa  119  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2099  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.19 
 
 
306 aa  119  7e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.79 
 
 
272 aa  119  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0666  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.25 
 
 
272 aa  119  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2038  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.6 
 
 
264 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.71 
 
 
281 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0354  ABC transporter, permease  31.62 
 
 
265 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.15 
 
 
283 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0441349  normal  0.902161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0240883  normal  0.166534 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.6 
 
 
322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.167871 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0491  ABC transporter, permease protein, putative  31.2 
 
 
257 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0367  ABC transporter permease  31.2 
 
 
265 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0357  ABC transporter, permease  31.2 
 
 
265 aa  116  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0381  ABC transporter permease  31.2 
 
 
257 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2084  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
260 aa  117  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.566245  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0424  putative ABC transporter, permease protein  31.2 
 
 
257 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0493  putative ABC transporter, permease protein  31.2 
 
 
257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.03 
 
 
250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.65 
 
 
453 aa  116  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0476  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.07 
 
 
249 aa  116  5e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 
272 aa  115  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4887  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
267 aa  115  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4878  putative ABC transporter, permease protein  31.62 
 
 
255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.76 
 
 
362 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0877  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.92 
 
 
260 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112184  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02100  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  27.55 
 
 
308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 
329 aa  112  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6031  putative ABC transporter, permease protein  30.15 
 
 
325 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
256 aa  112  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0801  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  32.51 
 
 
298 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745387  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.52 
 
 
256 aa  112  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0446  putative ABC transporter, permease protein  31.2 
 
 
257 aa  112  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1373  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.85 
 
 
303 aa  112  9e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.674946  normal  0.833857 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
289 aa  112  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.239724 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.63 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.318112 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1625  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.61 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0792607  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.75 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1834  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.41 
 
 
268 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.101401  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.17 
 
 
243 aa  110  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.07 
 
 
258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3460  ABC transporter membrane spanning protein  30.95 
 
 
288 aa  109  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.41 
 
 
281 aa  108  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58323  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.12 
 
 
254 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.22 
 
 
265 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000457845  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.15 
 
 
259 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657833 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2015  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  32.35 
 
 
252 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4214  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.16 
 
 
281 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1263  ABC transporter permease  31.87 
 
 
262 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.165267 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1076  ABC transporter-like protein  29.96 
 
 
488 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.276573 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.42 
 
 
280 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0794658  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5406  ABC transporter membrane spanning protein  31.47 
 
 
251 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.408693  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.21 
 
 
274 aa  106  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.240571  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.08 
 
 
259 aa  106  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.805205  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.67 
 
 
317 aa  106  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0255815  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2867  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
277 aa  106  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>