More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3142 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
264 aa  507  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.32312  normal  0.0411868 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.78 
 
 
300 aa  245  6e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000896674  normal  0.103005 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.7 
 
 
453 aa  236  4e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17280  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  47.89 
 
 
325 aa  235  5.0000000000000005e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.158115  normal  0.544115 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.99 
 
 
317 aa  228  6e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0255815  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2281  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.57 
 
 
281 aa  228  9e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695693  normal  0.331928 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2867  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.08 
 
 
277 aa  135  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.06 
 
 
283 aa  128  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0441349  normal  0.902161 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 
268 aa  126  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.223421 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.15 
 
 
250 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.42 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0637  ABC transporter, permease  29.92 
 
 
250 aa  116  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3414  ATP-binding protein of ABC transporter  35.2 
 
 
280 aa  116  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0693  ABC transporter permease  29.92 
 
 
250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4547  putative ABC transporter, permease protein  30.45 
 
 
251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.113137  normal  0.441246 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0727  ABC transporter permease  29.92 
 
 
250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363276  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0804  putative ABC transporter, permease protein  29.92 
 
 
250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22036e-46 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0637  ABC transporter, permease  29.92 
 
 
250 aa  115  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.33 
 
 
283 aa  115  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0784  putative ABC transporter, permease protein  31.02 
 
 
250 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.605831  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.61 
 
 
251 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.52 
 
 
294 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0881  putative ABC transporter, permease protein  30.2 
 
 
251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00328051  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3871  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.19 
 
 
280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.208081  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0797  ABC transporter, permease protein, putative  31.88 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
275 aa  113  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0253714  normal  0.258175 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0801  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  30.49 
 
 
298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745387  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1625  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.63 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0792607  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.63 
 
 
267 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.417353 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.95 
 
 
284 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.65192 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3210  ABC transporter, permease protein  33.63 
 
 
267 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.51 
 
 
288 aa  109  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.173855  normal  0.365472 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1263  ABC transporter permease  31.56 
 
 
262 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.165267 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
277 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0283642  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.84 
 
 
264 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0240883  normal  0.166534 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.07 
 
 
253 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2038  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.84 
 
 
264 aa  106  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.17 
 
 
298 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.433007  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.16 
 
 
287 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00381914  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.58 
 
 
267 aa  106  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.318809  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1719  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.84 
 
 
264 aa  105  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3562  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
263 aa  104  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.120198  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.44 
 
 
274 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3118  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.02 
 
 
284 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3552  ABC transporter membrane spanning protein  29.6 
 
 
285 aa  102  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0625026  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2015  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  32.77 
 
 
252 aa  102  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2545  binding-protein-dependent transport system protein  29.73 
 
 
287 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240068  normal  0.521676 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 
375 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.149558 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.55 
 
 
257 aa  99.8  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116723  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.84 
 
 
375 aa  99.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0877  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.5 
 
 
260 aa  99.4  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112184  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.77 
 
 
261 aa  98.6  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0333  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.35 
 
 
278 aa  97.8  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3166  ABC transporter, inner membrane subunit  29.96 
 
 
281 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
273 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.76 
 
 
281 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.36 
 
 
281 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.89 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0817  ABC transporter related protein  32.91 
 
 
492 aa  97.4  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.309085  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.1 
 
 
254 aa  97.1  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.63161  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.96 
 
 
278 aa  96.3  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.54 
 
 
253 aa  95.9  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.283078  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0258  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.89 
 
 
274 aa  95.5  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.750925 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.52 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1164  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.68 
 
 
260 aa  94.7  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233018 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2064  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.54 
 
 
254 aa  95.1  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00112586  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.71 
 
 
281 aa  95.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.55 
 
 
285 aa  94.7  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13305  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4887  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.17 
 
 
267 aa  94.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.5 
 
 
273 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3460  ABC transporter membrane spanning protein  31.25 
 
 
288 aa  94  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02100  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  29.79 
 
 
308 aa  94.4  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.02 
 
 
265 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000457845  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29 
 
 
259 aa  93.2  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657833 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.14 
 
 
270 aa  93.2  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0354  ABC transporter, permease  27.07 
 
 
265 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6031  putative ABC transporter, permease protein  31.25 
 
 
325 aa  92.8  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.26 
 
 
286 aa  92.4  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113814  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2084  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.97 
 
 
260 aa  92  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.566245  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0491  ABC transporter, permease protein, putative  27.07 
 
 
257 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.15 
 
 
272 aa  91.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.025765  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.73 
 
 
268 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0381  ABC transporter permease  27.07 
 
 
257 aa  91.3  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0424  putative ABC transporter, permease protein  27.07 
 
 
257 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.96 
 
 
268 aa  91.7  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.333865  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0427  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
279 aa  91.7  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.61 
 
 
299 aa  91.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.99 
 
 
258 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1076  ABC transporter-like protein  30.73 
 
 
488 aa  91.7  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.276573 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0367  ABC transporter permease  27.07 
 
 
265 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0357  ABC transporter, permease  27.07 
 
 
265 aa  90.9  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0446  putative ABC transporter, permease protein  26.64 
 
 
257 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0493  putative ABC transporter, permease protein  27.07 
 
 
257 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.25 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.49 
 
 
272 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0435  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.41 
 
 
250 aa  90.1  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4878  putative ABC transporter, permease protein  26.64 
 
 
255 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06840  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system permease component  29.24 
 
 
266 aa  90.1  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1260  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.63 
 
 
252 aa  90.1  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.21476  normal  0.0147088 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.84 
 
 
255 aa  89.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>