More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0036 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0036  NlpA lipoprotein  100 
 
 		 323 aa  659    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3655  NLPA lipoprotein  66.21 
 
 		 311 aa  435  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0909  NMT1/THI5 like domain protein  66.22 
 
 		 311 aa  428  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0643839  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0213  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  59.43 
 
 		 322 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0280  NMT1/THI5-like domain-containing protein  59.43 
 
 		 322 aa  400  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0204  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  59.12 
 
 		 322 aa  398  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1642  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  59.93 
 
 		 335 aa  369  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456194  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  59.8 
 
 		 311 aa  359  4e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0646  ABC transporter, substrate-binding protein  55.67 
 
 		 311 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.714673  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2299  ABC transporter, substrate-binding protein  55.67 
 
 		 311 aa  354  8.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0813032 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1934  NLPA lipoprotein  52.94 
 
 		 329 aa  345  5e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0586  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  56.06 
 
 		 309 aa  344  8.999999999999999e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0489  hypothetical protein  50.66 
 
 		 315 aa  323  3e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2375  ABC transporter substrate-binding protein  49.49 
 
 		 312 aa  310  2e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000866  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter substrate-binding component  49.48 
 
 		 316 aa  305  6e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06841  nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components  49.13 
 
 		 337 aa  304  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3125  NMT1/THI5-like domain-containing protein  47.44 
 
 		 311 aa  290  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2297  NMT1/THI5 like domain protein  42.46 
 
 		 312 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1887  NMT1/THI5 like domain protein  42.12 
 
 		 319 aa  229  5e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.50224  normal  0.0288593 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0615  NMT1/THI5-like domain-containing protein  31.99 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  34.39 
 
 		 328 aa  160  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  35.32 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  35.62 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0638  ABC transporter, substrate-binding protein  35.32 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  35.32 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0805  putative ABC transporter, substrate-binding protein  35.32 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5096200000000002e-46 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0882  putative ABC transporter, substrate-binding protein  35.43 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  35.32 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0638  ABC transporter, substrate-binding protein  34.89 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0694  ABC transporter substrate-binding protein  34.89 
 
 		 333 aa  155  7e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0728  ABC transporter substrate-binding protein  34.89 
 
 		 333 aa  155  7e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.245129  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1642  NMT1/THI5 like domain protein  33.8 
 
 		 338 aa  155  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.604576 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1522  hypothetical protein  27.46 
 
 		 314 aa  129  9.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30906  predicted protein  27.61 
 
 		 339 aa  127  3e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.407472  normal  0.0307188 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1461  hypothetical protein  27.11 
 
 		 314 aa  126  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08009  thiamine biosynthesis protein (Eurofung)  26.3 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504438  normal  0.187766 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0436  NMT1/THI5 like protein  26.33 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0451  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.33 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2330  thiamine biosynthesis protein, putative  27.65 
 
 		 303 aa  113  5e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0477  NMT1/THI5 like domain protein  27.97 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1444  NMT1/THI5-like protein  27.59 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.477186 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0878  NMT1/THI5 like domain protein  28.37 
 
 		 339 aa  106  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000508636  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3204  membrane lipoprotein lipid attachment site  25.08 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0443411  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  26.17 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0243  ABC transporter, permease protein, putative  23.25 
 
 		 587 aa  98.6  1e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4877  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.74 
 
 		 332 aa  99  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0363  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.56 
 
 		 332 aa  96.7  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0425  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.05 
 
 		 332 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0492  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  26.05 
 
 		 332 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0368  ABC transporter substrate-binding protein  26.05 
 
 		 332 aa  96.7  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0358  ABC transporter, substrate-binding protein  26.05 
 
 		 332 aa  96.7  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0355  ABC transporter, substrate-binding protein  26.05 
 
 		 332 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0382  ABC transporter substrate-binding protein  26.05 
 
 		 332 aa  96.7  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0494  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.05 
 
 		 332 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3647  NMT1/THI5 like domain protein  30.56 
 
 		 336 aa  96.3  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0447  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.05 
 
 		 332 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1222  NMT1/THI5 like domain protein  27.47 
 
 		 360 aa  96.3  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3936  NMT1/THI5 like domain protein  31.09 
 
 		 336 aa  95.9  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3117  NMT1/THI5 like domain protein  27.16 
 
 		 331 aa  94.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0371  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.03 
 
 		 332 aa  94  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  29.08 
 
 		 336 aa  90.5  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  27.41 
 
 		 360 aa  89.4  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2065  NMT1/THI5 like domain protein  21.72 
 
 		 327 aa  86.7  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411496  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.58 
 
 		 336 aa  86.7  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1152  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.59 
 
 		 340 aa  86.3  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0667  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.1 
 
 		 329 aa  85.9  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1730  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.63 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.524252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.81 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3461  ABC transporter substrate binding protein (nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate)  24.83 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33535  predicted protein  27.8 
 
 		 357 aa  82  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0670  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  24.27 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  26.67 
 
 		 778 aa  81.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1084  NMT1/THI5 like domain protein  27.5 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00229881  normal  0.0195344 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0121  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  26.89 
 
 		 356 aa  81.3  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1075  NMT1/THI5 like domain-containing protein  27.99 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.469481 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4256  NMT1/THI5 like domain protein  23.6 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0797632  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1669  NMT1/THI5 like domain protein  25.61 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.833326  normal  0.535701 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0343  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.81 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.010021  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3456  hypothetical protein  26 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2049  NMT1/THI5 like domain protein  27.85 
 
 		 334 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1941  NMT1/THI5 like domain protein  25.78 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.876036  hitchhiker  0.000270678 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3508  twin-arginine translocation pathway signal  26.99 
 
 		 342 aa  78.2  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276709  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3110  twin-arginine translocation pathway signal  27.02 
 
 		 346 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6030  putative ABC transporter, substrate binding protein  27.17 
 
 		 329 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3018  NMT1/THI5 like domain protein  27.72 
 
 		 342 aa  77.8  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0392  NMT1/THI5 like domain protein  25.77 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5403  hypothetical protein  25.27 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164568  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13660  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  23.1 
 
 		 349 aa  77  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2573  NMT1/THI5 like domain protein  29.61 
 
 		 385 aa  75.5  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.946083 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  29.87 
 
 		 686 aa  75.1  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6283  NMT1/THI5 like domain protein  26.97 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3874  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.36 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  25.97 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2047  hypothetical protein  26.95 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0745441  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  25.61 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2373  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.45 
 
 		 330 aa  73.9  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.163906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3812  NMT1/THI5 like domain protein  28.86 
 
 		 365 aa  73.6  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2591  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.08 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.329095 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0655  NMT1/THI5-like protein  26.88 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3147  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.55 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>