204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1887 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1887  NMT1/THI5 like domain protein  100 
 
 
319 aa  640    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.50224  normal  0.0288593 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1642  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  45.54 
 
 
335 aa  265  7e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456194  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  47.04 
 
 
311 aa  251  1e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0909  NMT1/THI5 like domain protein  46.37 
 
 
311 aa  250  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0643839  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1934  NLPA lipoprotein  44.62 
 
 
329 aa  249  5e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3125  NMT1/THI5-like domain-containing protein  42.11 
 
 
311 aa  249  6e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3655  NLPA lipoprotein  45.65 
 
 
311 aa  242  5e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0280  NMT1/THI5-like domain-containing protein  39.41 
 
 
322 aa  243  5e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0036  NlpA lipoprotein  42.71 
 
 
323 aa  238  8e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0204  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.72 
 
 
322 aa  236  3e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0213  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  40.72 
 
 
322 aa  236  4e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0489  hypothetical protein  37.66 
 
 
315 aa  224  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2375  ABC transporter substrate-binding protein  37.29 
 
 
312 aa  218  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000866  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter substrate-binding component  36.81 
 
 
316 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06841  nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components  36.81 
 
 
337 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0646  ABC transporter, substrate-binding protein  38.78 
 
 
311 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.714673  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2299  ABC transporter, substrate-binding protein  38.78 
 
 
311 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0813032 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0586  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  38.97 
 
 
309 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891954  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2297  NMT1/THI5 like domain protein  33.91 
 
 
312 aa  160  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  36.1 
 
 
328 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0615  NMT1/THI5-like domain-containing protein  33.63 
 
 
333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  30.2 
 
 
333 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0638  ABC transporter, substrate-binding protein  30.9 
 
 
333 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0805  putative ABC transporter, substrate-binding protein  30.9 
 
 
333 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5096200000000002e-46 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  30.59 
 
 
333 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  30.9 
 
 
333 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0882  putative ABC transporter, substrate-binding protein  31.86 
 
 
333 aa  123  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0638  ABC transporter, substrate-binding protein  30.47 
 
 
333 aa  122  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0694  ABC transporter substrate-binding protein  30.47 
 
 
333 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0728  ABC transporter substrate-binding protein  30.47 
 
 
333 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.245129  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  31.42 
 
 
333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1642  NMT1/THI5 like domain protein  32.66 
 
 
338 aa  116  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.604576 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3204  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.71 
 
 
336 aa  90.1  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0443411  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0447  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.68 
 
 
332 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0368  ABC transporter substrate-binding protein  24.68 
 
 
332 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0358  ABC transporter, substrate-binding protein  24.68 
 
 
332 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0355  ABC transporter, substrate-binding protein  24.68 
 
 
332 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0494  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.68 
 
 
332 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0382  ABC transporter substrate-binding protein  24.68 
 
 
332 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0425  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.68 
 
 
332 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4877  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.68 
 
 
332 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0363  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.73 
 
 
332 aa  86.7  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0451  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.74 
 
 
316 aa  85.1  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0477  NMT1/THI5 like domain protein  22.54 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0436  NMT1/THI5 like protein  26.74 
 
 
316 aa  85.1  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0492  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  22.84 
 
 
332 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0243  ABC transporter, permease protein, putative  27.51 
 
 
587 aa  84  0.000000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0371  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.46 
 
 
332 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4256  NMT1/THI5 like domain protein  26.56 
 
 
351 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0797632  normal  0.637243 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08009  thiamine biosynthesis protein (Eurofung)  21.28 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504438  normal  0.187766 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  24.71 
 
 
342 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0655  NMT1/THI5-like protein  27.57 
 
 
350 aa  72.8  0.000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.09 
 
 
344 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  26.09 
 
 
336 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1730  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.51 
 
 
329 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.524252  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2049  NMT1/THI5 like domain protein  29.58 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1222  NMT1/THI5 like domain protein  25.32 
 
 
360 aa  69.7  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33535  predicted protein  24.69 
 
 
357 aa  69.7  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1461  hypothetical protein  20.8 
 
 
314 aa  69.3  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30906  predicted protein  20.32 
 
 
339 aa  68.9  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.407472  normal  0.0307188 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1084  NMT1/THI5 like domain protein  29.58 
 
 
334 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00229881  normal  0.0195344 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.76 
 
 
1075 aa  68.9  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1522  hypothetical protein  20.8 
 
 
314 aa  68.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  27.59 
 
 
778 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3117  NMT1/THI5 like domain protein  22.67 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3456  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2040  NMT1/THI5 like domain protein  29.22 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  26.22 
 
 
674 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1721  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.37 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal  0.736062 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1075  NMT1/THI5 like domain-containing protein  26.15 
 
 
325 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.469481 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3936  NMT1/THI5 like domain protein  27.63 
 
 
336 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3461  ABC transporter substrate binding protein (nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate)  26.27 
 
 
330 aa  64.3  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0121  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  25.83 
 
 
356 aa  63.9  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2065  NMT1/THI5 like domain protein  22.66 
 
 
327 aa  63.9  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411496  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2795  NMT1/THI5 like domain protein  27.6 
 
 
357 aa  63.9  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001037 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2591  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.81 
 
 
337 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.329095 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0878  NMT1/THI5 like domain protein  22.15 
 
 
339 aa  63.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000508636  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0834  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.59 
 
 
336 aa  63.5  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.576945  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1882  NMT1/THI5 like domain-containing protein  27.71 
 
 
361 aa  62.8  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.4783 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0815  NMT1/THI5 like domain protein  28.46 
 
 
321 aa  62.8  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3110  twin-arginine translocation pathway signal  28.09 
 
 
346 aa  62.4  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  23.9 
 
 
340 aa  62.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3456  hypothetical protein  24.15 
 
 
336 aa  62  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1093  NMT1/THI5 like domain protein  28.77 
 
 
328 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000718314  normal  0.110975 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1821  diguanylate cyclase  23.37 
 
 
821 aa  62  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  24.5 
 
 
360 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2098  NMT1/THI5 like domain protein  28.96 
 
 
359 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4758  NMT1/THI5 like domain protein  30.19 
 
 
328 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1265  ABC transporter periplasmic-binding protein  26.81 
 
 
314 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1444  NMT1/THI5-like protein  28.46 
 
 
318 aa  61.2  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.477186 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0667  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.7 
 
 
329 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2373  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.28 
 
 
330 aa  60.5  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.163906 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3298  NMT1/THI5 like domain protein  25.67 
 
 
323 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0670  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  21.74 
 
 
328 aa  59.7  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6358  putative sulfonate ABC transporter, substrate-binding protein  28.26 
 
 
324 aa  59.3  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2012  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.85 
 
 
343 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452501  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6030  putative ABC transporter, substrate binding protein  24.43 
 
 
329 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0465  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  28.8 
 
 
347 aa  58.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.176308  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0889  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  30.09 
 
 
390 aa  58.2  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.390575  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0343  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.03 
 
 
332 aa  58.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.010021  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3647  NMT1/THI5 like domain protein  25.28 
 
 
336 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>