More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1075 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1075  NMT1/THI5 like domain-containing protein  100 
 
 		 325 aa  652    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.469481 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0815  NMT1/THI5 like domain protein  79.94 
 
 		 321 aa  509  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0363  putative sulfonate/nitrate/taurine transport system substrate-binding protein  46.86 
 
 		 317 aa  254  2.0000000000000002e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  38.74 
 
 		 360 aa  245  6e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2733  NMT1/THI5 like domain protein  36.6 
 
 		 349 aa  198  7.999999999999999e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.546218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2388  NMT1/THI5-like domain-containing protein  34 
 
 		 348 aa  198  9e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2762  membrane lipoprotein lipid attachment site  36.27 
 
 		 347 aa  194  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  34.21 
 
 		 342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2052  NMT1/THI5 like domain protein  33.78 
 
 		 340 aa  146  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.0508257 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  26.89 
 
 		 330 aa  103  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  29.64 
 
 		 328 aa  97.4  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0492  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  26.33 
 
 		 332 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.07 
 
 		 1075 aa  96.7  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0447  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.04 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0371  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.89 
 
 		 332 aa  95.1  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0368  ABC transporter substrate-binding protein  26.04 
 
 		 332 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0358  ABC transporter, substrate-binding protein  26.04 
 
 		 332 aa  94.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0355  ABC transporter, substrate-binding protein  26.04 
 
 		 332 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0494  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.04 
 
 		 332 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0382  ABC transporter substrate-binding protein  26.04 
 
 		 332 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0425  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.04 
 
 		 332 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4877  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.04 
 
 		 332 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  25.97 
 
 		 342 aa  93.6  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0363  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.74 
 
 		 332 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5087  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.13 
 
 		 342 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.34 
 
 		 331 aa  91.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3117  NMT1/THI5 like domain protein  29.45 
 
 		 331 aa  91.3  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1642  NMT1/THI5 like domain protein  29.32 
 
 		 338 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.604576 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0451  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.77 
 
 		 316 aa  89.7  6e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0436  NMT1/THI5 like protein  24.77 
 
 		 316 aa  89.7  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0615  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.27 
 
 		 333 aa  89  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  28.46 
 
 		 343 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.6 
 
 		 333 aa  87.4  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.44 
 
 		 333 aa  87  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1861  NMT1/THI5 like domain protein  26.73 
 
 		 339 aa  86.7  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  24.13 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0694  ABC transporter substrate-binding protein  24.29 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0638  ABC transporter, substrate-binding protein  24.13 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0728  ABC transporter substrate-binding protein  24.29 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.245129  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0882  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.13 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3755  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.5 
 
 		 335 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.13 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0805  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.13 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5096200000000002e-46 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3874  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.27 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 915 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0638  ABC transporter, substrate-binding protein  23.81 
 
 		 333 aa  84  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3204  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.71 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0443411  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0667  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.71 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6053  NMT1/THI5 like domain protein  28 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184042  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3110  twin-arginine translocation pathway signal  24.91 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  25.85 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.3 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2065  NMT1/THI5 like domain protein  23.26 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411496  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0036  NlpA lipoprotein  28.23 
 
 		 323 aa  79  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0706  putative secreted protein  27.9 
 
 		 345 aa  77.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.9 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.09 
 
 		 1238 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0619  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  25.75 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2034  NMT1/THI5 like domain protein  23.25 
 
 		 347 aa  76.3  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.599976  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3032  twin-arginine translocation pathway signal  28.24 
 
 		 348 aa  75.5  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000338526  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3812  NMT1/THI5 like domain protein  27.3 
 
 		 365 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  24.79 
 
 		 856 aa  74.7  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  27.47 
 
 		 778 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  25.85 
 
 		 1065 aa  73.6  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3737  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  25.6 
 
 		 353 aa  73.6  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457967  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2205  ABC transporter substrate-binding protein  25.99 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0670  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  26.3 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2979  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.79 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  28.82 
 
 		 686 aa  72  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1097  NMT1/THI5 like domain protein  26.73 
 
 		 322 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0236053  normal  0.472572 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3755  twin-arginine translocation pathway signal  25.31 
 
 		 344 aa  72  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24150  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  25.7 
 
 		 382 aa  72  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0834  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.35 
 
 		 336 aa  72  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.576945  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4256  NMT1/THI5 like domain protein  25.73 
 
 		 351 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0797632  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  26.52 
 
 		 593 aa  72.4  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3508  twin-arginine translocation pathway signal  26.28 
 
 		 342 aa  72  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276709  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5403  hypothetical protein  24.57 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164568  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0666  NMT1/THI5 like domain protein  25.51 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1821  diguanylate cyclase  28.15 
 
 		 821 aa  71.2  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1717  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.18 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  25.95 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1395  NMT1/THI5 like domain-containing protein  30.61 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.311199 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4670  NMT1/THI5 like domain protein  25.4 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4669  NMT1/THI5 like domain protein  28.83 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0955  hypothetical protein  26.42 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3655  NLPA lipoprotein  27.83 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.84 
 
 		 1004 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1461  hypothetical protein  24.9 
 
 		 314 aa  69.3  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0893  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25 
 
 		 346 aa  68.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2297  NMT1/THI5 like domain protein  26.89 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3936  NMT1/THI5 like domain protein  25.68 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3647  NMT1/THI5 like domain protein  26.67 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2758  NMT1/THI5 like domain protein  28.63 
 
 		 354 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512132  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2349  NMT1/THI5 like domain protein  24.43 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4595  NMT1/THI5 like domain protein  23.93 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2036  NMT1/THI5 like domain protein  25.87 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.756885 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1522  hypothetical protein  24.9 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1486  NMT1/THI5 like domain protein  24.76 
 
 		 355 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2680  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  25.85 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  23.89 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>