267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0038 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  100 
 
 
336 aa  687    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3461  ABC transporter substrate binding protein (nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate)  65.96 
 
 
330 aa  422  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6030  putative ABC transporter, substrate binding protein  63.47 
 
 
329 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1466  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  65.58 
 
 
326 aa  408  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2373  NMT1/THI5-like domain-containing protein  63.64 
 
 
330 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.163906 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1730  NMT1/THI5-like domain-containing protein  63.55 
 
 
329 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.524252  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1084  NMT1/THI5 like domain protein  63.75 
 
 
334 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00229881  normal  0.0195344 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2049  NMT1/THI5 like domain protein  64.05 
 
 
334 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0179  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  63.69 
 
 
326 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.907617  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1812  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  63.69 
 
 
326 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.661868  normal  0.196706 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1374  NMT1/THI5 like domain protein  61.28 
 
 
329 aa  386  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.353892  normal  0.853253 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0343  NMT1/THI5-like domain-containing protein  58.18 
 
 
332 aa  381  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.010021  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1493  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  63.81 
 
 
328 aa  382  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.140791  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3456  hypothetical protein  56.8 
 
 
336 aa  380  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2047  hypothetical protein  58.64 
 
 
326 aa  378  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0745441  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2699  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  53.85 
 
 
335 aa  358  8e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.428468  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3298  NMT1/THI5 like domain protein  54.88 
 
 
323 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3043  NMT1/THI5 like domain protein  55.02 
 
 
323 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4039  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  38.27 
 
 
343 aa  234  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2098  NMT1/THI5 like domain protein  36.95 
 
 
359 aa  202  6e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1882  NMT1/THI5 like domain-containing protein  37.07 
 
 
361 aa  196  4.0000000000000005e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.4783 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1437  NMT1/THI5 like domain protein  35.28 
 
 
378 aa  190  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.608485 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24150  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  36.42 
 
 
382 aa  188  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481096  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1528  ABC transporter substrate-binding protein  38.18 
 
 
357 aa  186  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2205  ABC transporter substrate-binding protein  37.26 
 
 
324 aa  182  9.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2024  NMT1/THI5 like domain protein  36.88 
 
 
344 aa  170  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2573  NMT1/THI5 like domain protein  31.82 
 
 
385 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.946083 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0856  hypothetical protein  39.68 
 
 
342 aa  157  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.028683  normal  0.870914 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1033  hypothetical protein  39.29 
 
 
342 aa  157  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.152767  normal  0.375545 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1583  NMT1/THI5 like domain protein  31.47 
 
 
338 aa  140  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 
915 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  29.15 
 
 
674 aa  122  9e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.32 
 
 
1238 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  30 
 
 
360 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  30.19 
 
 
686 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  28.39 
 
 
375 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  29.83 
 
 
775 aa  102  9e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  29.94 
 
 
311 aa  100  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  26.87 
 
 
593 aa  99.8  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  27.92 
 
 
856 aa  99.8  6e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  26.67 
 
 
1065 aa  99.4  8e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.41 
 
 
1004 aa  98.6  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  29.24 
 
 
330 aa  98.2  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.8 
 
 
342 aa  97.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.86 
 
 
1075 aa  96.3  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  28.46 
 
 
778 aa  96.3  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2101  NMT1/THI5 like domain protein  30.38 
 
 
327 aa  95.5  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3110  twin-arginine translocation pathway signal  28.83 
 
 
346 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2012  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.24 
 
 
343 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452501  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0213  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  28.17 
 
 
322 aa  93.2  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0204  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.17 
 
 
322 aa  93.2  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0280  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.12 
 
 
322 aa  92.8  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.58 
 
 
1004 aa  92.8  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.27 
 
 
344 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  28.7 
 
 
340 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1821  diguanylate cyclase  30.65 
 
 
821 aa  90.1  5e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2702  diguanylate cyclase  26.51 
 
 
794 aa  89.4  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564678  normal  0.658888 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3125  NMT1/THI5-like domain-containing protein  31.69 
 
 
311 aa  89.4  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4758  NMT1/THI5 like domain protein  29.91 
 
 
328 aa  88.6  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0363  putative sulfonate/nitrate/taurine transport system substrate-binding protein  28.18 
 
 
317 aa  87.8  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3936  NMT1/THI5 like domain protein  27.85 
 
 
336 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3563  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.18 
 
 
322 aa  87.4  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.087558  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2375  ABC transporter substrate-binding protein  26.72 
 
 
312 aa  87.4  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1265  ABC transporter periplasmic-binding protein  28.4 
 
 
314 aa  87  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  29.84 
 
 
342 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3213  ABC transporter, periplasmic binding component-related protein  27.52 
 
 
342 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.357764  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0425  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.88 
 
 
332 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0368  ABC transporter substrate-binding protein  26.88 
 
 
332 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0358  ABC transporter, substrate-binding protein  26.88 
 
 
332 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0355  ABC transporter, substrate-binding protein  26.88 
 
 
332 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4877  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.88 
 
 
332 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0494  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.88 
 
 
332 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0382  ABC transporter substrate-binding protein  26.88 
 
 
332 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0036  NlpA lipoprotein  28.03 
 
 
323 aa  84.7  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3647  NMT1/THI5 like domain protein  27.63 
 
 
336 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0447  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.88 
 
 
332 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2040  NMT1/THI5 like domain protein  26.33 
 
 
328 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3032  twin-arginine translocation pathway signal  26.28 
 
 
348 aa  84.3  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000338526  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3667  hypothetical protein  24.82 
 
 
335 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2591  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.21 
 
 
337 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.329095 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3508  twin-arginine translocation pathway signal  28.74 
 
 
342 aa  82.8  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276709  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0492  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  26.88 
 
 
332 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  26.69 
 
 
721 aa  82  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0436  NMT1/THI5 like protein  29.15 
 
 
316 aa  82.4  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0451  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.15 
 
 
316 aa  82.4  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0694  ABC transporter substrate-binding protein  26.9 
 
 
333 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1093  NMT1/THI5 like domain protein  25.42 
 
 
328 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000718314  normal  0.110975 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0728  ABC transporter substrate-binding protein  26.9 
 
 
333 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.245129  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0363  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.91 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1721  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.42 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal  0.736062 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0371  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.74 
 
 
332 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3655  NLPA lipoprotein  26.78 
 
 
311 aa  80.9  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0027  twin-arginine translocation pathway signal  28.94 
 
 
365 aa  80.9  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  26.46 
 
 
333 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1934  NLPA lipoprotein  27.72 
 
 
329 aa  80.1  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2758  NMT1/THI5 like domain protein  27.16 
 
 
354 aa  80.1  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512132  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0489  hypothetical protein  26.59 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.57 
 
 
333 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2979  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.52 
 
 
323 aa  79.7  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0306  twin-arginine translocation pathway signal  32.79 
 
 
331 aa  79.3  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>