245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2047 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2047  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  669    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0745441  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2373  NMT1/THI5-like domain-containing protein  75.94 
 
 
330 aa  513  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.163906 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1466  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  75.74 
 
 
326 aa  488  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3461  ABC transporter substrate binding protein (nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate)  70.9 
 
 
330 aa  486  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0179  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  74.1 
 
 
326 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.907617  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1812  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  74.1 
 
 
326 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.661868  normal  0.196706 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0343  NMT1/THI5-like domain-containing protein  67.58 
 
 
332 aa  456  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.010021  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6030  putative ABC transporter, substrate binding protein  66.67 
 
 
329 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1374  NMT1/THI5 like domain protein  68.83 
 
 
329 aa  443  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.353892  normal  0.853253 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2699  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  64.69 
 
 
335 aa  434  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.428468  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1493  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  71.48 
 
 
328 aa  436  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.140791  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3298  NMT1/THI5 like domain protein  64.31 
 
 
323 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1730  NMT1/THI5-like domain-containing protein  66.99 
 
 
329 aa  434  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.524252  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1084  NMT1/THI5 like domain protein  66.78 
 
 
334 aa  427  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00229881  normal  0.0195344 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2049  NMT1/THI5 like domain protein  66.56 
 
 
334 aa  427  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3043  NMT1/THI5 like domain protein  64.62 
 
 
323 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3456  hypothetical protein  60.13 
 
 
336 aa  392  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  58.64 
 
 
336 aa  378  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4039  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  40.37 
 
 
343 aa  249  5e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24150  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  39.3 
 
 
382 aa  205  7e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481096  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1437  NMT1/THI5 like domain protein  38.59 
 
 
378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.608485 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2098  NMT1/THI5 like domain protein  38.29 
 
 
359 aa  187  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2573  NMT1/THI5 like domain protein  37.98 
 
 
385 aa  181  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.946083 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1882  NMT1/THI5 like domain-containing protein  35.24 
 
 
361 aa  180  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.4783 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1528  ABC transporter substrate-binding protein  37.5 
 
 
357 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2024  NMT1/THI5 like domain protein  36.53 
 
 
344 aa  162  7e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2205  ABC transporter substrate-binding protein  34.27 
 
 
324 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0856  hypothetical protein  32.56 
 
 
342 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.028683  normal  0.870914 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1033  hypothetical protein  32.56 
 
 
342 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.152767  normal  0.375545 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1583  NMT1/THI5 like domain protein  32.35 
 
 
338 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  29.37 
 
 
674 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  29.96 
 
 
375 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.96 
 
 
1075 aa  108  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 
915 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  29.57 
 
 
778 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  30.33 
 
 
686 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  32.94 
 
 
360 aa  100  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1821  diguanylate cyclase  28.83 
 
 
821 aa  98.6  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.67 
 
 
1238 aa  98.2  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  26.77 
 
 
1065 aa  97.4  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2979  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.64 
 
 
323 aa  95.9  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0694  ABC transporter substrate-binding protein  29.89 
 
 
333 aa  93.6  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0728  ABC transporter substrate-binding protein  29.89 
 
 
333 aa  93.6  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.245129  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.89 
 
 
333 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0940  ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  27.37 
 
 
335 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3508  twin-arginine translocation pathway signal  29.23 
 
 
342 aa  91.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276709  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2599  ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  27.74 
 
 
335 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  29.12 
 
 
330 aa  90.5  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0882  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.67 
 
 
333 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  29.5 
 
 
333 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.5 
 
 
333 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0805  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.5 
 
 
333 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5096200000000002e-46 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0638  ABC transporter, substrate-binding protein  29.5 
 
 
333 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.7 
 
 
333 aa  90.1  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3213  ABC transporter, periplasmic binding component-related protein  29.44 
 
 
342 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.357764  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0615  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.2 
 
 
333 aa  89.7  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0638  ABC transporter, substrate-binding protein  29.12 
 
 
333 aa  88.6  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2758  NMT1/THI5 like domain protein  28.09 
 
 
354 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512132  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  27.08 
 
 
856 aa  87.8  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2591  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.46 
 
 
337 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.329095 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2101  NMT1/THI5 like domain protein  32.49 
 
 
327 aa  87.8  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.95 
 
 
344 aa  87.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2975  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.64 
 
 
336 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.459543  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3032  twin-arginine translocation pathway signal  27.69 
 
 
348 aa  87  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000338526  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3667  hypothetical protein  28 
 
 
335 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3755  twin-arginine translocation pathway signal  29 
 
 
344 aa  85.9  9e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  24 
 
 
593 aa  85.9  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6283  NMT1/THI5 like domain protein  29.39 
 
 
381 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1721  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.17 
 
 
328 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal  0.736062 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3812  NMT1/THI5 like domain protein  29.27 
 
 
365 aa  84  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3755  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.09 
 
 
335 aa  84  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.58 
 
 
1004 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5087  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.13 
 
 
342 aa  82.8  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2040  NMT1/THI5 like domain protein  29.46 
 
 
328 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3204  membrane lipoprotein lipid attachment site  29.45 
 
 
336 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0443411  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2297  NMT1/THI5 like domain protein  27.54 
 
 
312 aa  82  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  28.28 
 
 
721 aa  80.9  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4758  NMT1/THI5 like domain protein  29.05 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2012  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.23 
 
 
343 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452501  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1093  NMT1/THI5 like domain protein  28.03 
 
 
328 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000718314  normal  0.110975 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  27.59 
 
 
775 aa  79  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2868  NMT1/THI5 like domain protein  26.37 
 
 
364 aa  78.6  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.51119  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1265  ABC transporter periplasmic-binding protein  26.56 
 
 
314 aa  79  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.5 
 
 
1004 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.15 
 
 
342 aa  77  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5201  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.04 
 
 
345 aa  76.3  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0909  NMT1/THI5 like domain protein  27.57 
 
 
311 aa  75.9  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0643839  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2065  NMT1/THI5 like domain protein  27.34 
 
 
327 aa  75.9  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411496  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3549  ABC transporter substrate-binding protein  26.67 
 
 
339 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0306  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 
331 aa  75.5  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0667  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.03 
 
 
329 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0670  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  26.52 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1934  NLPA lipoprotein  26.38 
 
 
329 aa  74.7  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0436  NMT1/THI5 like protein  27.18 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0451  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.18 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  26.49 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0027  twin-arginine translocation pathway signal  25.51 
 
 
365 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  28.8 
 
 
342 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1222  NMT1/THI5 like domain protein  26.07 
 
 
360 aa  73.9  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0213  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.84 
 
 
322 aa  73.2  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>