More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4888 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  100 
 
 
343 aa  699    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  27.78 
 
 
360 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2762  membrane lipoprotein lipid attachment site  29.59 
 
 
347 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2388  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.34 
 
 
348 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.1 
 
 
342 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0815  NMT1/THI5 like domain protein  30.8 
 
 
321 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0815  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  30.42 
 
 
326 aa  97.4  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7630  hypothetical protein  31.31 
 
 
363 aa  95.1  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  27.47 
 
 
311 aa  89  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0489  hypothetical protein  29.37 
 
 
315 aa  87.8  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2297  NMT1/THI5 like domain protein  30.38 
 
 
312 aa  87  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1075  NMT1/THI5 like domain-containing protein  28.46 
 
 
325 aa  87  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.469481 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1934  NLPA lipoprotein  26.33 
 
 
329 aa  87  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  25.29 
 
 
674 aa  85.9  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06841  nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components  26.81 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2375  ABC transporter substrate-binding protein  27.55 
 
 
312 aa  84.3  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  25.08 
 
 
328 aa  84  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1820  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.3 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000866  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter substrate-binding component  28.3 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1152  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.48 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2733  NMT1/THI5 like domain protein  26.52 
 
 
349 aa  80.1  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.546218  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0586  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.24 
 
 
309 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891954  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  32.47 
 
 
349 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  32.47 
 
 
349 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3655  NLPA lipoprotein  28 
 
 
311 aa  78.6  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0646  ABC transporter, substrate-binding protein  27.24 
 
 
311 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.714673  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3117  NMT1/THI5 like domain protein  26.45 
 
 
331 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3456  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2299  ABC transporter, substrate-binding protein  27.24 
 
 
311 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0813032 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3906  WD-40 repeat-containing protein  24.69 
 
 
343 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3168  ABC transporter, periplasmic binding protein  24.69 
 
 
343 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1642  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  27.41 
 
 
335 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456194  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4513  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.71 
 
 
335 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4526  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.76 
 
 
336 aa  75.5  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.600337  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0363  putative sulfonate/nitrate/taurine transport system substrate-binding protein  26.47 
 
 
317 aa  75.5  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0036  NlpA lipoprotein  25.97 
 
 
323 aa  75.5  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1941  NMT1/THI5 family protein  28.84 
 
 
337 aa  74.7  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000780337 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2967  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  27.31 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  33.93 
 
 
338 aa  75.1  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2330  NMT1/THI5 like domain-containing protein  26.13 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  25.1 
 
 
330 aa  74.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  23.91 
 
 
342 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  24.22 
 
 
340 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1444  NMT1/THI5-like protein  27.19 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.477186 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  33.94 
 
 
349 aa  73.2  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0666  NMT1/THI5 like domain protein  24.57 
 
 
359 aa  73.2  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  27.86 
 
 
686 aa  73.2  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0213  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  26.38 
 
 
322 aa  72.8  0.000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 
915 aa  72  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0204  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.38 
 
 
322 aa  72.4  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3204  membrane lipoprotein lipid attachment site  23.68 
 
 
336 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0443411  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3737  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  25.95 
 
 
353 aa  72  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457967  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3032  twin-arginine translocation pathway signal  24.71 
 
 
348 aa  72.4  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000338526  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2312  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  29.74 
 
 
328 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.355114  hitchhiker  0.0000000431055 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3755  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.21 
 
 
335 aa  71.6  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2931  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  29.74 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5012  ABC transporter substrate-binding protein  25.48 
 
 
343 aa  71.2  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0589  putative signal peptide protein  29.81 
 
 
355 aa  70.9  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.66482  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2920  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  26.57 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10374e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2641  alkanesulfonates-binding protein  26.57 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.245447  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  32.94 
 
 
347 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3083  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.75 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261971  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5731  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.43 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  32.43 
 
 
347 aa  70.1  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5352  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.43 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5441  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.43 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.558403 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2758  NMT1/THI5 like domain protein  27.59 
 
 
354 aa  70.1  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512132  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3062  putative lipoprotein  28.92 
 
 
340 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188548  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2052  NMT1/THI5 like domain protein  26.48 
 
 
340 aa  69.7  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.0508257 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2713  sulfonate ABC transporter sulfonate-binding protein  26.57 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.38086  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2921  sulfonate ABC transporter sulfonate-binding protein  26.57 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3110  twin-arginine translocation pathway signal  29.21 
 
 
346 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  32.28 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2960  sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein, putative  26.57 
 
 
328 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.641077  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.07 
 
 
1075 aa  69.3  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2599  ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  26.45 
 
 
335 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3060  lipoprotein, putative  29.27 
 
 
340 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  24.49 
 
 
778 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0769  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.91 
 
 
354 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2664  alkanesulfonates-binding protein  29.23 
 
 
328 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760849  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2975  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.22 
 
 
336 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.459543  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1057  extracellular solute-binding protein family 3  32.93 
 
 
332 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227515  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0280  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.22 
 
 
322 aa  68.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.28 
 
 
1238 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2065  NMT1/THI5 like domain protein  23.81 
 
 
327 aa  68.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411496  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0667  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.56 
 
 
329 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6283  NMT1/THI5 like domain protein  26.17 
 
 
381 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3594  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.44 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.2 
 
 
331 aa  68.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1964  NMT1/THI5-like domain-containing protein  33.76 
 
 
344 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4899  twin-arginine translocation pathway signal  29.09 
 
 
361 aa  67.4  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.992021  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0909  NMT1/THI5 like domain protein  27.23 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0643839  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2986  NMT1/THI5 like domain protein  25.28 
 
 
354 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0955  hypothetical protein  26.34 
 
 
349 aa  67  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08009  thiamine biosynthesis protein (Eurofung)  26.5 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504438  normal  0.187766 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0363  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.19 
 
 
332 aa  67  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0466  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  30.77 
 
 
330 aa  67  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1431  extracellular solute-binding protein  32.93 
 
 
332 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3098  hypothetical protein  23.47 
 
 
364 aa  66.6  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1390  NMT1/THI5 like domain protein  32.48 
 
 
346 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.530017  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5087  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.9 
 
 
342 aa  66.6  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>