256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2986 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2986  NMT1/THI5 like domain protein  100 
 
 
354 aa  726    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0769  NMT1/THI5-like domain-containing protein  84.75 
 
 
354 aa  624  1e-178  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7630  hypothetical protein  45.99 
 
 
363 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3098  hypothetical protein  30.79 
 
 
364 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3124  NMT1/THI5-like domain-containing protein  32.56 
 
 
362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.45434  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3175  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.49 
 
 
367 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.311198  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1170  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  24.71 
 
 
356 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0662412  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2543  putative binding protein  27.27 
 
 
352 aa  83.2  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.721383 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2108  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2255  NMT1/THI5 like domain protein  27.32 
 
 
340 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3333  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  26.58 
 
 
360 aa  73.9  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3168  ABC transporter, periplasmic binding protein  25.83 
 
 
343 aa  73.2  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3906  WD-40 repeat-containing protein  25.83 
 
 
343 aa  73.2  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4526  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.36 
 
 
336 aa  72.4  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.600337  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3667  hypothetical protein  31.36 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.32 
 
 
336 aa  69.7  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  25.28 
 
 
343 aa  67.8  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1757  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  26.55 
 
 
346 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.502422  normal  0.0158469 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4513  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.57 
 
 
335 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4355  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  26.9 
 
 
334 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000418029  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2219  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  26.11 
 
 
341 aa  64.3  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0766615  normal  0.160433 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4593  NMT1/THI5 like domain protein  26.55 
 
 
335 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4459  NMT1/THI5 like domain protein  26.55 
 
 
335 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0725563  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4151  NMT1/THI5-like domain-containing protein  33.88 
 
 
344 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814935  normal  0.147422 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4336  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.29 
 
 
344 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379972  normal  0.507879 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3263  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.66 
 
 
344 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0622389  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3678  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  33.88 
 
 
344 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.987849 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  22.71 
 
 
342 aa  62  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4112  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  25.22 
 
 
344 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4254  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  25.22 
 
 
344 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000917513  normal  0.0818305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6066  ABC transporter substrate-binding protein  26.51 
 
 
342 aa  60.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0938445  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3812  NMT1/THI5 like domain protein  27.41 
 
 
365 aa  60.5  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 
340 aa  60.1  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0646  ABC transporter, substrate-binding protein  26.45 
 
 
311 aa  59.7  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.714673  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2299  ABC transporter, substrate-binding protein  26.45 
 
 
311 aa  59.3  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0813032 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3391  putative signal peptide protein  25.48 
 
 
328 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2673  putative ABC transporter, substrate binding protein  26.52 
 
 
326 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416834  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  27.03 
 
 
349 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  27.03 
 
 
349 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2165  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  28.28 
 
 
345 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5127  Fis family transcriptional regulator  24.56 
 
 
325 aa  58.9  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.295645  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6283  NMT1/THI5 like domain protein  24.9 
 
 
381 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2960  sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein, putative  26.32 
 
 
328 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.641077  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2641  alkanesulfonates-binding protein  26.32 
 
 
328 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.245447  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0586  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.81 
 
 
309 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891954  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3869  NMT1/THI5 like domain protein  29.66 
 
 
337 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.478553  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2967  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  26.32 
 
 
328 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2664  alkanesulfonates-binding protein  26.32 
 
 
328 aa  57.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760849  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  28 
 
 
347 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.2 
 
 
331 aa  57.4  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2312  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  25 
 
 
328 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.355114  hitchhiker  0.0000000431055 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0363  putative sulfonate/nitrate/taurine transport system substrate-binding protein  24.84 
 
 
317 aa  57.4  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1430  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.31 
 
 
314 aa  57.4  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0036  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.11 
 
 
334 aa  57  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0117  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.33 
 
 
347 aa  57  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  28 
 
 
347 aa  57  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2931  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  24.18 
 
 
328 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  25.68 
 
 
349 aa  55.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2680  hypothetical protein  25.47 
 
 
364 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2920  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  25.91 
 
 
328 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10374e-18 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0251  hypothetical protein  25.47 
 
 
337 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368343  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2697  hypothetical protein  25.47 
 
 
337 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0035  hypothetical protein  25.47 
 
 
337 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2272  putative signal peptide protein  25.15 
 
 
349 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863816  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0053  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.99 
 
 
334 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0038  hypothetical protein  25.47 
 
 
337 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0026  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  25.55 
 
 
334 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0038  hypothetical protein  25.47 
 
 
337 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1855  hypothetical protein  25.47 
 
 
337 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0945611  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2713  sulfonate ABC transporter sulfonate-binding protein  25.91 
 
 
328 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.38086  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2921  sulfonate ABC transporter sulfonate-binding protein  25.91 
 
 
328 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.53 
 
 
342 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3272  hypothetical protein  25.47 
 
 
337 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3755  twin-arginine translocation pathway signal  23.08 
 
 
344 aa  54.7  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4165  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.73 
 
 
331 aa  54.3  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0994431  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0036  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  25.55 
 
 
334 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0034  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  25.55 
 
 
334 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3508  twin-arginine translocation pathway signal  23.38 
 
 
342 aa  54.7  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276709  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0035  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.55 
 
 
334 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1999  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.52 
 
 
331 aa  53.9  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  25 
 
 
333 aa  53.9  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3362  TRAP transporter solute receptor TAXI family protein  30.84 
 
 
332 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0884862  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1675  putative signal peptide protein  26.09 
 
 
371 aa  53.9  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.88323 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2516  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25.34 
 
 
336 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445481  normal  0.551196 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3218  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  24.67 
 
 
334 aa  53.1  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1444  NMT1/THI5-like protein  21.66 
 
 
318 aa  53.1  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.477186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4052  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.06 
 
 
354 aa  53.1  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.577447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2334  putative signal peptide protein  25.15 
 
 
344 aa  53.1  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2052  NMT1/THI5 like domain protein  22.33 
 
 
340 aa  52.8  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.0508257 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1678  hypothetical protein  23.26 
 
 
334 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2516  putative alkanesulfonate ABC transporter, substrate binding protein  28.78 
 
 
344 aa  52.8  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4186  putative ABC transporter, substrate-binding protein  38.75 
 
 
480 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.917027  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2622  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  29.69 
 
 
341 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000404129  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3347  putative ABC transporter, substrate-binding protein  37.5 
 
 
480 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636052  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2788  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.79 
 
 
336 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0498257  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1460  twin-arginine translocation pathway signal  23.75 
 
 
348 aa  52.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00145692  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2160  ABC sulfate ester transporter, periplasmic ligand binding protein  24.63 
 
 
355 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.486423  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2283  TRAP transporter solute receptor, TAXI family  31.03 
 
 
320 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3602  conserved hypothetical signal peptide protein  23.08 
 
 
349 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>