142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0589 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0589  putative signal peptide protein  100 
 
 
355 aa  703    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.66482  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2272  putative signal peptide protein  50.65 
 
 
349 aa  341  1e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863816  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2334  putative signal peptide protein  48.69 
 
 
344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  50 
 
 
340 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4899  twin-arginine translocation pathway signal  54.05 
 
 
361 aa  333  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.992021  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2648  putative signal peptide protein  53.63 
 
 
353 aa  330  3e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00493903 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  46.51 
 
 
349 aa  323  3e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  46.22 
 
 
349 aa  322  5e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  47.74 
 
 
349 aa  317  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1460  twin-arginine translocation pathway signal  47.59 
 
 
348 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00145692  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  49.35 
 
 
347 aa  311  9e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  45.37 
 
 
347 aa  311  9e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1675  putative signal peptide protein  45.4 
 
 
371 aa  309  5.9999999999999995e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.88323 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0955  NMT1/THI5-like domain-containing protein  47.39 
 
 
345 aa  287  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830268  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2357  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  47.71 
 
 
345 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0182931  normal  0.0423673 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1964  NMT1/THI5-like domain-containing protein  43.36 
 
 
344 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1830  NMT1/THI5 like domain protein  46.79 
 
 
345 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223893  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3159  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  43.66 
 
 
346 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1390  NMT1/THI5 like domain protein  44.59 
 
 
346 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.530017  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  37.58 
 
 
338 aa  227  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3589  NMT1/THI5-like domain-containing protein  36.09 
 
 
346 aa  223  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3279  hypothetical protein  36.6 
 
 
332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000646762  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0284  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  34.77 
 
 
346 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1057  extracellular solute-binding protein family 3  37.58 
 
 
332 aa  206  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1431  extracellular solute-binding protein  37.06 
 
 
332 aa  206  7e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2108  extracellular solute-binding protein  37.22 
 
 
341 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3333  extracellular solute-binding protein  36.5 
 
 
341 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2255  NMT1/THI5 like domain protein  37.34 
 
 
340 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6066  ABC transporter substrate-binding protein  36.36 
 
 
342 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0938445  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2258  NMT1/THI5 like domain protein  35.23 
 
 
340 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0036  NMT1/THI5-like domain-containing protein  32.89 
 
 
334 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2680  hypothetical protein  32.24 
 
 
364 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254313  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3272  hypothetical protein  32.24 
 
 
337 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0251  hypothetical protein  32.24 
 
 
337 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368343  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5343  putative ABC transporter, substrate-binding protein  30.62 
 
 
337 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.524159 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1855  hypothetical protein  32.24 
 
 
337 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0945611  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0038  hypothetical protein  32.24 
 
 
337 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0038  hypothetical protein  32.24 
 
 
337 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2697  hypothetical protein  32.24 
 
 
337 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3116  ABC transporter, substrate-binding protein  30.94 
 
 
336 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.60563  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3118  ABC transporter, substrate-binding protein  30.94 
 
 
336 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.671223  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4150  NMT1/THI5 like domain protein  31.37 
 
 
334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4038  NMT1/THI5 like domain protein  31.37 
 
 
334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21044  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3218  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  31.48 
 
 
334 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0035  hypothetical protein  31.8 
 
 
337 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5063  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.32 
 
 
337 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  32.79 
 
 
333 aa  172  7.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0035  NMT1/THI5-like domain-containing protein  31.48 
 
 
334 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4038  NMT1/THI5 like domain protein  30.29 
 
 
356 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2254  extracellular solute-binding protein  36.6 
 
 
336 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0026  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  31.48 
 
 
334 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0036  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  31.48 
 
 
334 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0034  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  31.48 
 
 
334 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3512  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.65 
 
 
345 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0053  NMT1/THI5-like domain-containing protein  31.48 
 
 
334 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3602  conserved hypothetical signal peptide protein  33.33 
 
 
349 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3280  putative signal peptide protein  33.33 
 
 
349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3327  ABC transporter substrate binding protein  29.14 
 
 
303 aa  162  8.000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3959  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.04 
 
 
336 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1529  putative substrate-binding component of ABC transporter  28.24 
 
 
348 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4035  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate family transporter, periplasmic ligand binding protein  28.71 
 
 
339 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3391  putative signal peptide protein  32.03 
 
 
328 aa  155  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0495  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.1 
 
 
339 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106589  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0952  putative substrate-binding component of ABC transporter  28.12 
 
 
332 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0791916  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5603  ABC transporter substrate-binding protein  26.07 
 
 
376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.069875  normal  0.939883 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0229  NMT1/THI5 like domain protein  25.47 
 
 
391 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  29.81 
 
 
343 aa  67.4  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1690  twin-arginine translocation pathway signal  29.32 
 
 
363 aa  62.4  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.525847  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1570  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 
353 aa  60.1  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2645  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  27.5 
 
 
320 aa  60.1  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.202001  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1134  NMT1/THI5 like domain protein  26.12 
 
 
365 aa  59.3  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1814  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.19 
 
 
322 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.641284  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1820  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  23.61 
 
 
327 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6455  ABC transporter substrate-binding protein  26.11 
 
 
314 aa  57  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.871345  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4935  NMT1/THI5 like domain protein  27.8 
 
 
377 aa  57  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0962986  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2277  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.87 
 
 
313 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191617  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2525  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.87 
 
 
321 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.610523  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2570  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.87 
 
 
321 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5156  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  27.59 
 
 
350 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1144  NMT1/THI5 like domain protein  23.08 
 
 
357 aa  53.5  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.144377  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2720  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 
325 aa  53.5  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1430  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.55 
 
 
314 aa  53.1  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2562  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.32 
 
 
321 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4555  NMT1/THI5 like domain protein  19.84 
 
 
337 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2859  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  24.66 
 
 
317 aa  50.8  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23743  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8277  ABC transport system substrate-binding protein  28 
 
 
336 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0627957 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34300  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  25.23 
 
 
319 aa  50.4  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2575  hypothetical protein  18.83 
 
 
336 aa  50.8  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.225151  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4613  NMT1/THI5-like domain-containing protein  18.75 
 
 
335 aa  50.4  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1047  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 
322 aa  50.4  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0288  NMT1/THI5 like domain protein  28.24 
 
 
327 aa  50.1  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133462  hitchhiker  0.0000957197 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3922  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  23.53 
 
 
346 aa  49.7  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.679528  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3062  putative lipoprotein  18.57 
 
 
340 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188548  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0105  NMT1/THI5 like domain protein  30 
 
 
314 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.318497  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2079  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.17 
 
 
342 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0337  putative ABC transporter, substrate-binding protein  17.98 
 
 
335 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3060  lipoprotein, putative  18.57 
 
 
340 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3175  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.09 
 
 
367 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.311198  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2683  hypothetical protein  24.66 
 
 
349 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.857311  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  29.34 
 
 
297 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>