204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2575 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2575  hypothetical protein  100 
 
 
336 aa  683    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.225151  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0878  hypothetical protein  67.48 
 
 
329 aa  471  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0057402  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4555  NMT1/THI5 like domain protein  59.4 
 
 
337 aa  435  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1836  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transport systems, periplasmic component  57.53 
 
 
340 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11510  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  48.96 
 
 
336 aa  357  9.999999999999999e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000048144  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2293  membrane lipoprotein lipid attachment site  49.7 
 
 
336 aa  353  2e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1347  NMT1/THI5-like domain-containing protein  50.76 
 
 
330 aa  345  5e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2782  ABC transporter substrate-binding protein  48.79 
 
 
332 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4901  putative ABC transporter, substrate-binding protein  46.11 
 
 
335 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0337  putative ABC transporter, substrate-binding protein  46.41 
 
 
335 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4900  putative ABC transporter, substrate-binding protein  44.91 
 
 
335 aa  317  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4533  ABC transporter, substrate-binding protein  45.21 
 
 
335 aa  317  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4514  ABC transporter, substrate-binding protein  45.21 
 
 
335 aa  316  4e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4921  putative ABC transporter, substrate-binding protein  45.21 
 
 
335 aa  316  4e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3454  ABC transporter, substrate-binding protein  45.35 
 
 
334 aa  316  5e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4613  NMT1/THI5-like domain-containing protein  44.91 
 
 
335 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4935  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  46.27 
 
 
325 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4675  ABC transporter substrate-binding protein  45.62 
 
 
338 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5036  ABC transporter substrate-binding protein  45.96 
 
 
325 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.647768  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1474  hypothetical protein  33.83 
 
 
332 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000729086  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.81 
 
 
364 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000374426  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2556  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transport systems, periplasmic component  31.23 
 
 
365 aa  156  6e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0652  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  52.27 
 
 
261 aa  97.1  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 
340 aa  96.3  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2778  NMT1/THI5 like domain protein  25.38 
 
 
325 aa  92.4  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2272  putative signal peptide protein  25.9 
 
 
349 aa  91.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863816  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  26.8 
 
 
349 aa  88.6  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
347 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2258  NMT1/THI5 like domain protein  28.46 
 
 
340 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 
347 aa  87.4  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1964  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.05 
 
 
344 aa  86.3  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3279  hypothetical protein  28.06 
 
 
332 aa  85.9  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000646762  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2254  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 
336 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1675  putative signal peptide protein  24.28 
 
 
371 aa  83.6  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.88323 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0955  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.09 
 
 
345 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830268  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  25.2 
 
 
349 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  25.2 
 
 
349 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25 
 
 
338 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2334  putative signal peptide protein  24.77 
 
 
344 aa  80.9  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0619  NMT1/THI5 like domain protein  24.57 
 
 
339 aa  80.5  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4150  NMT1/THI5 like domain protein  23.93 
 
 
334 aa  79.3  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1830  NMT1/THI5 like domain protein  24.8 
 
 
345 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223893  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4038  NMT1/THI5 like domain protein  23.93 
 
 
334 aa  79.3  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21044  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1460  twin-arginine translocation pathway signal  25.78 
 
 
348 aa  79  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00145692  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2357  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.4 
 
 
345 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0182931  normal  0.0423673 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0284  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  27.2 
 
 
346 aa  75.5  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1180  putative ABC transporter, periplasmic protein  22.32 
 
 
323 aa  75.9  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3159  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23 
 
 
346 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1390  NMT1/THI5 like domain protein  23.9 
 
 
346 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.530017  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1057  extracellular solute-binding protein family 3  24.11 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1431  extracellular solute-binding protein  23.86 
 
 
332 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2108  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 
341 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2648  putative signal peptide protein  23.05 
 
 
353 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00493903 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3589  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.93 
 
 
346 aa  70.9  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3333  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 
341 aa  70.5  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1032  putative aliphatic sulfonate binding protein precursor  26.93 
 
 
327 aa  69.7  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1981  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  27.81 
 
 
335 aa  69.3  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169392  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0494  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.38 
 
 
333 aa  67.8  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.547109  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3083  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.52 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261971  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6066  ABC transporter substrate-binding protein  26.36 
 
 
342 aa  67  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0938445  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2255  NMT1/THI5 like domain protein  24.52 
 
 
340 aa  65.9  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0806  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  24.04 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.488938  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1172  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.04 
 
 
358 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.811616  normal  0.138153 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3602  conserved hypothetical signal peptide protein  21.67 
 
 
349 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3512  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.17 
 
 
345 aa  63.2  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4899  twin-arginine translocation pathway signal  20.75 
 
 
361 aa  62.8  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.992021  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3116  ABC transporter, substrate-binding protein  26.92 
 
 
336 aa  62  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.60563  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1144  NMT1/THI5 like domain protein  25.69 
 
 
357 aa  61.6  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.144377  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.78 
 
 
331 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3327  ABC transporter substrate binding protein  26.53 
 
 
303 aa  60.8  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419883  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2205  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  27.69 
 
 
332 aa  60.8  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142056  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3118  ABC transporter, substrate-binding protein  27.27 
 
 
336 aa  60.8  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.671223  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3280  putative signal peptide protein  21.67 
 
 
349 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3391  putative signal peptide protein  18.88 
 
 
328 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0851  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.96 
 
 
328 aa  59.3  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0219644  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1486  NMT1/THI5 like domain protein  22.88 
 
 
355 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.28 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3571  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25.58 
 
 
357 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0952  putative substrate-binding component of ABC transporter  25.51 
 
 
332 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0791916  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2330  NMT1/THI5 like domain-containing protein  23.35 
 
 
314 aa  57  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5343  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.9 
 
 
337 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.524159 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1148  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  23.7 
 
 
308 aa  55.5  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000156737  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5063  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.9 
 
 
337 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2683  hypothetical protein  28.07 
 
 
349 aa  54.7  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.857311  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0667  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.83 
 
 
329 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0495  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.13 
 
 
339 aa  53.9  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106589  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4035  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate family transporter, periplasmic ligand binding protein  23.78 
 
 
339 aa  53.9  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4301  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  25.27 
 
 
365 aa  53.1  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.389589  hitchhiker  0.0000586034 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0490  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  23.04 
 
 
299 aa  53.1  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000043628  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1411  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  24.88 
 
 
320 aa  52.8  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.214398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1814  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.44 
 
 
322 aa  52.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.641284  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1529  putative substrate-binding component of ABC transporter  22.56 
 
 
348 aa  52.8  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0436  NMT1/THI5 like protein  25.61 
 
 
316 aa  52.8  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0451  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.61 
 
 
316 aa  52.8  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0036  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.35 
 
 
334 aa  52.8  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  28.96 
 
 
311 aa  52.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3218  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  23.48 
 
 
334 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2047  hypothetical protein  34.81 
 
 
326 aa  52.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0745441  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5419  NMT1/THI5 like domain protein  23.05 
 
 
345 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  21.88 
 
 
333 aa  52.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>