81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2079 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2079  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  100 
 
 		 342 aa  688    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2597  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  61.81 
 
 		 326 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0591189  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1255  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  61.81 
 
 		 326 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.113577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1926  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  61.81 
 
 		 328 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0900124  normal  0.764974 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14770  NLPA lipoprotein  28.22 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0437  extracellular solute-binding protein family 3  26.18 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0271798  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2431  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  26.86 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946473  normal  0.133086 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2272  putative signal peptide protein  23.78 
 
 		 349 aa  56.2  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5664  hypothetical protein  24.21 
 
 		 372 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0893  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  26.16 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.471336  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  27.66 
 
 		 349 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  27.7 
 
 		 349 aa  53.9  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2255  NMT1/THI5 like domain protein  27.46 
 
 		 340 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2477  NMT1/THI5 like domain protein  28.28 
 
 		 331 aa  53.9  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1460  twin-arginine translocation pathway signal  22.35 
 
 		 348 aa  53.1  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00145692  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  26.95 
 
 		 349 aa  53.1  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2108  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 341 aa  52.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  27.62 
 
 		 333 aa  52.8  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2334  putative signal peptide protein  24.39 
 
 		 344 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6066  ABC transporter substrate-binding protein  26 
 
 		 342 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0938445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1820  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.11 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1647  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  27.5 
 
 		 324 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1430  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.91 
 
 		 314 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3755  twin-arginine translocation pathway signal  24.9 
 
 		 344 aa  50.8  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0167  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  23.87 
 
 		 385 aa  51.2  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4669  NMT1/THI5 like domain protein  25.73 
 
 		 335 aa  50.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5799  twin-arginine translocation pathway signal  23.97 
 
 		 349 aa  50.4  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0833  ABC transporter, substrate binding protein  32.39 
 
 		 335 aa  50.4  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4215  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.14 
 
 		 330 aa  50.1  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  27.37 
 
 		 347 aa  49.3  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5608  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  21.93 
 
 		 327 aa  49.3  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.88884 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1675  putative signal peptide protein  23.32 
 
 		 371 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.88323 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1395  NMT1/THI5 like domain-containing protein  25.96 
 
 		 339 aa  48.5  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.311199 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2620  NMT1/THI5 like domain protein  25 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.985405  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 347 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3333  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2834  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.32 
 
 		 283 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.654997  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3737  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  29.55 
 
 		 353 aa  47.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457967  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2789  NLPA lipoprotein  22.47 
 
 		 360 aa  47  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1901  NMT1/THI5 like domain protein  26.38 
 
 		 353 aa  47.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6311  putative ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  31.39 
 
 		 311 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.794983  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3265  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  24.76 
 
 		 336 aa  47  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000349224 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0589  putative signal peptide protein  28.17 
 
 		 355 aa  46.2  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.66482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1529  putative substrate-binding component of ABC transporter  26.6 
 
 		 348 aa  46.6  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0408  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.96 
 
 		 438 aa  46.2  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0465  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  27.43 
 
 		 347 aa  46.2  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.176308  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0469  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.29 
 
 		 340 aa  45.8  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27190  hypothetical protein  20.6 
 
 		 376 aa  45.8  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0041  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.05 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.487407 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3279  hypothetical protein  27.08 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000646762  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6160  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.27 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.419436 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3036  sulfonate ABC transporter, periplamic sulfonate-binding protein  24.87 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  31.58 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4189  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.29 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.623523 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0806  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  26.79 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.488938  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44550  ABC transporter periplasmic component  25.68 
 
 		 371 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0266  NMT1/THI5 like domain protein  29.37 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.312265  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3755  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.52 
 
 		 335 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1573  extracellular solute-binding protein  23.37 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.817202  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3607  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.57 
 
 		 351 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3159  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.41 
 
 		 346 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0714  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  27.73 
 
 		 357 aa  44.3  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.924005  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5419  NMT1/THI5 like domain protein  28.77 
 
 		 345 aa  44.3  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2055  phosphonate ABC transporter, periplasmic phosphonate-binding protein  28.77 
 
 		 285 aa  44.3  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34300  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  25.18 
 
 		 319 aa  43.9  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0288  NMT1/THI5 like domain protein  27.46 
 
 		 327 aa  43.9  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133462  hitchhiker  0.0000957197 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2375  ABC transporter substrate-binding protein  29.79 
 
 		 312 aa  43.9  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1144  NMT1/THI5 like domain protein  22.44 
 
 		 357 aa  43.9  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.144377  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0406  NMT1/THI5 like domain protein  23.45 
 
 		 334 aa  43.5  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1390  NMT1/THI5 like domain protein  23.41 
 
 		 346 aa  43.1  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.530017  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5981  ABC transporter substrate-binding protein  26.57 
 
 		 311 aa  43.5  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0057  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  22.48 
 
 		 341 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2052  NMT1/THI5 like domain protein  37.5 
 
 		 340 aa  43.5  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.0508257 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0354  NMT1/THI5 like domain protein  26.92 
 
 		 316 aa  43.5  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3081  NMT1/THI5 like domain protein  24.47 
 
 		 326 aa  43.1  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3098  hypothetical protein  27.61 
 
 		 364 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.616034 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3594  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.7 
 
 		 340 aa  43.1  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0695  extracellular solute-binding protein  24.87 
 
 		 283 aa  43.1  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0777245  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0791  phosphonate ABC transporter, periplasmic phosphonate-binding protein, putative  24.87 
 
 		 283 aa  42.7  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2205  ABC transporter substrate-binding protein  28.89 
 
 		 324 aa  42.7  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>