192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0469 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0469  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  100 
 
 
340 aa  689    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0408  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  99.41 
 
 
438 aa  682    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3594  NMT1/THI5-like domain-containing protein  83.24 
 
 
340 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3036  sulfonate ABC transporter, periplamic sulfonate-binding protein  54.57 
 
 
338 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7504  ABC transporter substrate-binding protein  35.16 
 
 
333 aa  176  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.776958 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0490  NMT1/THI5 like domain protein  27.82 
 
 
355 aa  87  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0466  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  27.59 
 
 
330 aa  62.8  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1830  NMT1/THI5 like domain protein  29.15 
 
 
345 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223893  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  25 
 
 
343 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14770  NLPA lipoprotein  22.74 
 
 
315 aa  61.6  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1134  NMT1/THI5 like domain protein  26.62 
 
 
365 aa  60.5  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0035  hypothetical protein  28.5 
 
 
337 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2357  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.15 
 
 
345 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0182931  normal  0.0423673 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2680  hypothetical protein  29.06 
 
 
364 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254313  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1255  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.38 
 
 
326 aa  60.1  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.113577  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2597  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.38 
 
 
326 aa  59.7  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0591189  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3272  hypothetical protein  28.77 
 
 
337 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  27.52 
 
 
349 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0251  hypothetical protein  28.77 
 
 
337 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368343  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1855  hypothetical protein  28.77 
 
 
337 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0945611  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0038  hypothetical protein  28.77 
 
 
337 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0038  hypothetical protein  28.77 
 
 
337 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2697  hypothetical protein  28.77 
 
 
337 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1647  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  23.95 
 
 
324 aa  58.5  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  26.15 
 
 
349 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0955  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.75 
 
 
345 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0830268  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4896  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.74 
 
 
346 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2789  NLPA lipoprotein  27.15 
 
 
360 aa  57.8  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  25.69 
 
 
349 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0815  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  22.83 
 
 
326 aa  57  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3391  putative signal peptide protein  30.11 
 
 
328 aa  57  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1926  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.11 
 
 
328 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0900124  normal  0.764974 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0844  ABC transporter substrate-binding protein  24.86 
 
 
345 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.317801 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3959  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.59 
 
 
336 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4035  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate family transporter, periplasmic ligand binding protein  29.41 
 
 
339 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0288  NMT1/THI5 like domain protein  25.19 
 
 
327 aa  55.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133462  hitchhiker  0.0000957197 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2713  sulfonate ABC transporter sulfonate-binding protein  24.36 
 
 
328 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.38086  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4165  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.48 
 
 
331 aa  55.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0994431  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2921  sulfonate ABC transporter sulfonate-binding protein  24.36 
 
 
328 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  24.28 
 
 
340 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2920  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  24.36 
 
 
328 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10374e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2960  sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein, putative  24.89 
 
 
328 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.641077  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2931  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  24.54 
 
 
328 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1144  NMT1/THI5 like domain protein  24.65 
 
 
357 aa  54.3  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.144377  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2312  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  24.91 
 
 
328 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.355114  hitchhiker  0.0000000431055 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3512  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.94 
 
 
345 aa  54.3  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2664  alkanesulfonates-binding protein  24.54 
 
 
328 aa  53.9  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760849  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1529  putative substrate-binding component of ABC transporter  26.29 
 
 
348 aa  53.9  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  21.54 
 
 
333 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2641  alkanesulfonates-binding protein  25 
 
 
328 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.245447  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0495  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.82 
 
 
339 aa  53.5  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106589  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  21.78 
 
 
333 aa  53.5  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.04 
 
 
344 aa  53.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4038  NMT1/THI5 like domain protein  27.18 
 
 
356 aa  53.1  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0306  twin-arginine translocation pathway signal  24.66 
 
 
331 aa  53.1  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2967  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  24.26 
 
 
328 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  21.54 
 
 
333 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5343  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.34 
 
 
337 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.524159 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0638  ABC transporter, substrate-binding protein  21.54 
 
 
333 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0882  putative ABC transporter, substrate-binding protein  21.47 
 
 
333 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 
340 aa  52.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  21.47 
 
 
333 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0638  ABC transporter, substrate-binding protein  21.85 
 
 
333 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5799  twin-arginine translocation pathway signal  22.74 
 
 
349 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3110  twin-arginine translocation pathway signal  26.76 
 
 
346 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2564  putative ABC transporter, periplasmic subunit  29 
 
 
334 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365629 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0805  putative ABC transporter, substrate-binding protein  21.54 
 
 
333 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5096200000000002e-46 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1859  ABC transport system substrate-binding protein  27.86 
 
 
330 aa  50.8  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5063  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.74 
 
 
337 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  27.56 
 
 
328 aa  50.8  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3083  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  19.73 
 
 
328 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261971  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1084  NMT1/THI5 like domain protein  31.54 
 
 
334 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00229881  normal  0.0195344 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0790  NlpA lipoprotein  29 
 
 
327 aa  50.4  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.62 
 
 
915 aa  50.4  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3159  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.07 
 
 
346 aa  50.4  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06841  nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components  28.29 
 
 
337 aa  50.1  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1999  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.12 
 
 
331 aa  50.4  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0167  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  27.78 
 
 
385 aa  50.1  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0694  ABC transporter substrate-binding protein  21.54 
 
 
333 aa  50.1  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  27.17 
 
 
336 aa  50.1  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0728  ABC transporter substrate-binding protein  21.54 
 
 
333 aa  50.1  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.245129  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000866  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter substrate-binding component  28.29 
 
 
316 aa  49.7  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0615  NMT1/THI5-like domain-containing protein  20.99 
 
 
333 aa  49.7  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  29.3 
 
 
347 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4355  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  27.98 
 
 
334 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000418029  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1730  NMT1/THI5-like domain-containing protein  31.3 
 
 
329 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.524252  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0451  NMT1/THI5 like domain protein  25.46 
 
 
349 aa  49.3  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  normal  0.0280986 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1390  NMT1/THI5 like domain protein  28.06 
 
 
346 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.530017  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08009  thiamine biosynthesis protein (Eurofung)  36.54 
 
 
341 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504438  normal  0.187766 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2283  NLPA lipoprotein  25.24 
 
 
341 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000054697  unclonable  0.00000000025197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8277  ABC transport system substrate-binding protein  24.17 
 
 
336 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0627957 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2098  NMT1/THI5 like domain protein  29.25 
 
 
359 aa  48.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0878  hypothetical protein  36.23 
 
 
329 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0057402  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5012  ABC transporter substrate-binding protein  31.11 
 
 
343 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2049  NMT1/THI5 like domain protein  29.84 
 
 
334 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3602  conserved hypothetical signal peptide protein  27.65 
 
 
349 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1861  NMT1/THI5 like domain protein  26.52 
 
 
339 aa  47.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2219  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  31.22 
 
 
341 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0766615  normal  0.160433 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4359  twin-arginine translocation pathway signal  27.12 
 
 
331 aa  47.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2375  ABC transporter substrate-binding protein  25.41 
 
 
312 aa  47.8  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>