55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1926 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1926  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  100 
 
 		 328 aa  649    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0900124  normal  0.764974 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2597  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  85.71 
 
 		 326 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0591189  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1255  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  85.06 
 
 		 326 aa  537  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.113577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2079  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  62.18 
 
 		 342 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0893  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  30.18 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.471336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0408  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.81 
 
 		 438 aa  62.4  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0469  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.81 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3594  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.69 
 
 		 340 aa  59.3  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0097  NLPA lipoprotein  32.65 
 
 		 328 aa  53.1  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3036  sulfonate ABC transporter, periplamic sulfonate-binding protein  25.91 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5608  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  20.97 
 
 		 327 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.88884 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4189  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.23 
 
 		 338 aa  50.4  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.623523 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0952  putative substrate-binding component of ABC transporter  25.82 
 
 		 332 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0791916  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3755  twin-arginine translocation pathway signal  24.78 
 
 		 344 aa  50.4  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5664  hypothetical protein  27.2 
 
 		 372 aa  49.7  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0260  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 		 331 aa  48.9  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.388479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14770  NLPA lipoprotein  25.85 
 
 		 315 aa  48.5  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0041  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.11 
 
 		 338 aa  48.5  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.487407 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34300  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  25.19 
 
 		 319 aa  48.9  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1460  twin-arginine translocation pathway signal  23.38 
 
 		 348 aa  48.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00145692  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0833  ABC transporter, substrate binding protein  28.21 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5981  ABC transporter substrate-binding protein  30.11 
 
 		 311 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0589  putative signal peptide protein  24.64 
 
 		 355 aa  47  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.66482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4169  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  28.19 
 
 		 331 aa  46.2  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.555902 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0878  hypothetical protein  21.75 
 
 		 329 aa  46.2  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0057402  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0666  NMT1/THI5 like domain protein  32.52 
 
 		 359 aa  46.2  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2375  ABC transporter substrate-binding protein  27.59 
 
 		 312 aa  46.2  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6160  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.07 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.419436 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1431  extracellular solute-binding protein  29.27 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0451  NMT1/THI5 like domain protein  31.13 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  normal  0.0280986 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  25.37 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1859  ABC transport system substrate-binding protein  28.98 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2659  NMT1/THI5 like domain protein  29.17 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535056  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36967  predicted protein  27.97 
 
 		 307 aa  45.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.177714  normal  0.228714 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2055  phosphonate ABC transporter, periplasmic phosphonate-binding protein  28.57 
 
 		 285 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0909  NMT1/THI5 like domain protein  32.43 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0643839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  25.37 
 
 		 349 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  27.17 
 
 		 333 aa  44.3  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1647  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  26.39 
 
 		 324 aa  44.3  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  25.37 
 
 		 349 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0229  NMT1/THI5 like domain protein  24.91 
 
 		 391 aa  43.5  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1901  NMT1/THI5 like domain protein  24.82 
 
 		 353 aa  43.5  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2165  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  27.06 
 
 		 345 aa  43.5  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2349  NMT1/THI5 like domain protein  28.17 
 
 		 333 aa  43.5  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  26.24 
 
 		 343 aa  43.5  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0154  extracellular solute-binding protein, family 3  29.25 
 
 		 323 aa  43.5  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0520  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.03 
 
 		 323 aa  43.5  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2535  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system protein  33.85 
 
 		 333 aa  43.1  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2782  NLPA lipoprotein  26.71 
 
 		 319 aa  42.7  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0743027  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13660  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  25.56 
 
 		 349 aa  42.7  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1047  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 		 322 aa  42.7  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3922  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.61 
 
 		 346 aa  42.4  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.679528  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2108  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 341 aa  42.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2477  NMT1/THI5 like domain protein  24.83 
 
 		 331 aa  42.4  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3908  ABC transport system substrate-binding protein  24.85 
 
 		 336 aa  42.4  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.074485  normal  0.0880082 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>