67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1255 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1255  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  100 
 
 		 326 aa  646    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.113577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2597  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  98.47 
 
 		 326 aa  639    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0591189  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1926  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  85.06 
 
 		 328 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0900124  normal  0.764974 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2079  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  62.18 
 
 		 342 aa  395  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0408  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.38 
 
 		 438 aa  61.6  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0469  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.38 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3594  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.34 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0893  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  27.93 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.471336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5608  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  22.55 
 
 		 327 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.88884 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0790  NlpA lipoprotein  25.64 
 
 		 327 aa  53.9  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0097  NLPA lipoprotein  28.43 
 
 		 328 aa  53.1  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1460  twin-arginine translocation pathway signal  25.32 
 
 		 348 aa  52.8  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00145692  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4189  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  31.25 
 
 		 338 aa  52.8  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.623523 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14770  NLPA lipoprotein  26.56 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2108  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 341 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3755  twin-arginine translocation pathway signal  24.9 
 
 		 344 aa  50.4  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3036  sulfonate ABC transporter, periplamic sulfonate-binding protein  25.11 
 
 		 338 aa  50.4  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2255  NMT1/THI5 like domain protein  26.81 
 
 		 340 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5981  ABC transporter substrate-binding protein  27.97 
 
 		 311 aa  50.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1647  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  27.32 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  26.6 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1859  ABC transport system substrate-binding protein  27.05 
 
 		 330 aa  49.3  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5664  hypothetical protein  26.64 
 
 		 372 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  27.61 
 
 		 349 aa  49.3  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0589  putative signal peptide protein  25.47 
 
 		 355 aa  48.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.66482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2659  NMT1/THI5 like domain protein  30.34 
 
 		 324 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535056  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1573  extracellular solute-binding protein  25.09 
 
 		 326 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.817202  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2782  NLPA lipoprotein  23.33 
 
 		 319 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0743027  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0952  putative substrate-binding component of ABC transporter  26.7 
 
 		 332 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0791916  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4169  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  31.33 
 
 		 331 aa  47.4  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.555902 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  26.43 
 
 		 343 aa  47  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2750  sulfonate/taurine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  24.51 
 
 		 340 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1901  NMT1/THI5 like domain protein  27.01 
 
 		 353 aa  47  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44550  ABC transporter periplasmic component  27.59 
 
 		 371 aa  46.6  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1377  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.12 
 
 		 329 aa  46.2  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358866  hitchhiker  0.00572107 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  23.87 
 
 		 340 aa  45.8  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5234  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate family transporter, periplasmic ligand binding protein  24.88 
 
 		 361 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  26.12 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0878  hypothetical protein  25.85 
 
 		 329 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0057402  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  26.12 
 
 		 349 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6066  ABC transporter substrate-binding protein  24.64 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0938445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2789  NLPA lipoprotein  22.94 
 
 		 360 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0520  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.65 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5419  NMT1/THI5 like domain protein  29.53 
 
 		 345 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2431  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  27.6 
 
 		 373 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946473  normal  0.133086 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7504  ABC transporter substrate-binding protein  25 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.776958 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3060  lipoprotein, putative  23.72 
 
 		 340 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3602  conserved hypothetical signal peptide protein  26.7 
 
 		 349 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6433  ABC transport system substrate-binding protein  28.21 
 
 		 340 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6160  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.77 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.419436 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5927  ABC transport system substrate-binding protein  28.21 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0806  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  20.71 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.488938  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5562  ABC transport system substrate-binding protein  28.21 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575813  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34300  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  23.7 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1116  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.21 
 
 		 330 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 		 347 aa  43.9  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2645  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  25.37 
 
 		 320 aa  43.9  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.202001  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3018  NMT1/THI5 like domain protein  33.11 
 
 		 342 aa  43.5  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2272  putative signal peptide protein  21.94 
 
 		 349 aa  43.5  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3908  ABC transport system substrate-binding protein  23.24 
 
 		 336 aa  43.5  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.074485  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2283  NLPA lipoprotein  23.1 
 
 		 341 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000054697  unclonable  0.00000000025197 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3280  putative signal peptide protein  26.14 
 
 		 349 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3333  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 		 341 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27190  hypothetical protein  20.39 
 
 		 376 aa  43.1  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6455  ABC transporter substrate-binding protein  24.53 
 
 		 314 aa  43.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.871345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1430  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.88 
 
 		 314 aa  42.7  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0406  NMT1/THI5 like domain protein  25.71 
 
 		 334 aa  42.4  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>