48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6311 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6311  putative ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  100 
 
 		 311 aa  631  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.794983  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3159  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.84 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1390  NMT1/THI5 like domain protein  29.84 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.530017  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1964  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.4 
 
 		 344 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  24.34 
 
 		 349 aa  53.1  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3454  ABC transporter, substrate-binding protein  33.11 
 
 		 334 aa  50.1  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0337  putative ABC transporter, substrate-binding protein  31.84 
 
 		 335 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  24.34 
 
 		 349 aa  49.7  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  24.34 
 
 		 349 aa  49.3  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0284  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  26.24 
 
 		 346 aa  49.3  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4533  ABC transporter, substrate-binding protein  32.43 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3589  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.7 
 
 		 346 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2778  NMT1/THI5 like domain protein  21.75 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4901  putative ABC transporter, substrate-binding protein  32.43 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4900  putative ABC transporter, substrate-binding protein  32.43 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2254  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5036  ABC transporter substrate-binding protein  32.43 
 
 		 325 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.647768  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4675  ABC transporter substrate-binding protein  32.43 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2172  putative nitrate transporter component, nrtA  33.88 
 
 		 460 aa  47.8  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.210639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3769  nitrate transporter, putative  28.25 
 
 		 407 aa  47.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4921  putative ABC transporter, substrate-binding protein  32.43 
 
 		 335 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3972  ABC transporter nitrate-binding protein  28.18 
 
 		 471 aa  47.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2334  putative signal peptide protein  24.79 
 
 		 344 aa  47.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.643163  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3279  hypothetical protein  22.37 
 
 		 332 aa  47.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000646762  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4514  ABC transporter, substrate-binding protein  32.43 
 
 		 335 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4899  twin-arginine translocation pathway signal  23.61 
 
 		 361 aa  47  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.992021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  23.58 
 
 		 333 aa  47  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2079  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.65 
 
 		 342 aa  47  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  22.37 
 
 		 340 aa  46.6  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4613  NMT1/THI5-like domain-containing protein  31.76 
 
 		 335 aa  46.6  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2963  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  25.33 
 
 		 341 aa  46.6  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0954314  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4038  NMT1/THI5 like domain protein  25 
 
 		 356 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1347  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.16 
 
 		 330 aa  46.6  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4935  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  31.76 
 
 		 325 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1057  extracellular solute-binding protein family 3  28.12 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227515  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1563  sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein SsuA  21.27 
 
 		 348 aa  45.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000779716 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1431  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 		 332 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.633528 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2782  ABC transporter substrate-binding protein  23.88 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1304  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  26 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165264  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2206  putative nitrate transporter component, NrtA  25.52 
 
 		 457 aa  44.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1460  twin-arginine translocation pathway signal  21.59 
 
 		 348 aa  43.9  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00145692  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2258  NMT1/THI5 like domain protein  22.97 
 
 		 340 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2108  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 341 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 347 aa  43.1  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4818  ABC transporter nitrate-binding protein  31.4 
 
 		 456 aa  42.7  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191179  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4669  NMT1/THI5 like domain protein  26.55 
 
 		 335 aa  42.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2255  NMT1/THI5 like domain protein  25.75 
 
 		 340 aa  42.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2617  ABC transporter nitrate-binding protein  31.71 
 
 		 454 aa  42.4  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0708468 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>