More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5419 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5419  NMT1/THI5 like domain protein  100 
 
 
345 aa  695    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1820  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  41.69 
 
 
327 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34300  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  38.39 
 
 
319 aa  240  2.9999999999999997e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4669  NMT1/THI5 like domain protein  42.95 
 
 
335 aa  216  5e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1814  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  34.5 
 
 
322 aa  192  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.641284  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2477  NMT1/THI5 like domain protein  32.84 
 
 
331 aa  172  7.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0457  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  31.38 
 
 
333 aa  169  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  32.29 
 
 
297 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3083  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  33.45 
 
 
328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261971  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2330  NMT1/THI5 like domain-containing protein  30.79 
 
 
314 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0288  NMT1/THI5 like domain protein  30.1 
 
 
327 aa  122  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133462  hitchhiker  0.0000957197 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5731  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.65 
 
 
329 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5352  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  30.36 
 
 
329 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5441  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  30.36 
 
 
329 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.558403 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5981  ABC transporter substrate-binding protein  28.81 
 
 
311 aa  86.7  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0105  NMT1/THI5 like domain protein  28.08 
 
 
314 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.318497  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0383  NlpA lipoprotein  27.49 
 
 
312 aa  80.1  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391974  normal  0.191867 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5799  twin-arginine translocation pathway signal  29.69 
 
 
349 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1144  NMT1/THI5 like domain protein  27.76 
 
 
357 aa  75.9  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.144377  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2105  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 
347 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109451  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7861  hypothetical protein  23.4 
 
 
381 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491165  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1743  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  28.67 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00139756  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1901  NMT1/THI5 like domain protein  28 
 
 
353 aa  67.8  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1423  extracellular solute-binding protein family 3  27.6 
 
 
326 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1262  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.6 
 
 
326 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.302787 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4355  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  29.82 
 
 
334 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000418029  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  26.86 
 
 
349 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2537  putative taurine ABC transporter, substrate binding protein  31.4 
 
 
330 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237782  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  25.24 
 
 
778 aa  63.9  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2620  NMT1/THI5 like domain protein  25.86 
 
 
328 aa  63.5  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.985405  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4052  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.5 
 
 
354 aa  63.5  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.577447 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0229  NMT1/THI5 like domain protein  24.23 
 
 
391 aa  63.2  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0354  NMT1/THI5 like domain protein  29.65 
 
 
316 aa  63.2  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1075  NMT1/THI5 like domain-containing protein  27.95 
 
 
325 aa  63.2  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.469481 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2172  putative nitrate transporter component, nrtA  23.51 
 
 
460 aa  62.8  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.210639  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0292  ABC transporter nitrate-binding protein  22.51 
 
 
451 aa  62.8  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2782  NLPA lipoprotein  25.28 
 
 
319 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0743027  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  24.54 
 
 
375 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  26.12 
 
 
349 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0622  NMT1/THI5 like domain protein  28.04 
 
 
338 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 
340 aa  61.6  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3542  NLPA lipoprotein  23.1 
 
 
313 aa  61.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0144  twin-arginine translocation pathway signal  23.59 
 
 
413 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2834  twin-arginine translocation pathway signal  23.19 
 
 
411 aa  60.8  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.960299 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  25.77 
 
 
349 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0308  twin-arginine translocation pathway signal  23.39 
 
 
414 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2673  putative ABC transporter, substrate binding protein  30.81 
 
 
326 aa  59.7  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416834  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1981  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  26.14 
 
 
335 aa  59.7  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169392  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.92 
 
 
338 aa  59.7  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0392  NMT1/THI5 like domain protein  23.59 
 
 
351 aa  59.7  0.00000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1212  NMT1/THI5 like domain protein  26.52 
 
 
326 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0153956  normal  0.631224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7504  ABC transporter substrate-binding protein  27.59 
 
 
333 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.776958 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3487  twin-arginine translocation pathway signal  24.86 
 
 
408 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.847198 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  25.68 
 
 
342 aa  58.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0027  twin-arginine translocation pathway signal  31.75 
 
 
365 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2254  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 
336 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3297  putative sulfonate ABC transporter, periplasmic-binding protein  26.44 
 
 
338 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432728  normal  0.264629 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3279  hypothetical protein  24.88 
 
 
332 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000646762  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2107  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  23.05 
 
 
529 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.287431  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1134  NMT1/THI5 like domain protein  24.54 
 
 
365 aa  58.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2283  NLPA lipoprotein  23.73 
 
 
341 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000054697  unclonable  0.00000000025197 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0406  NMT1/THI5 like domain protein  24.69 
 
 
334 aa  58.2  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0815  NMT1/THI5 like domain protein  28.14 
 
 
321 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3869  twin-arginine translocation pathway signal  24.86 
 
 
408 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0223785 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0097  NLPA lipoprotein  29.49 
 
 
328 aa  57.4  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3795  twin-arginine translocation pathway signal  24.86 
 
 
408 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.296999 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4038  NMT1/THI5 like domain protein  28.83 
 
 
334 aa  57  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21044  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25 
 
 
1075 aa  57  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4150  NMT1/THI5 like domain protein  28.83 
 
 
334 aa  57  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2357  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.91 
 
 
345 aa  57  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0182931  normal  0.0423673 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3641  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  27.13 
 
 
333 aa  56.6  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105087  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1570  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 
353 aa  56.6  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5319  taurine ABC transporter, periplasmic taurine-binding protein  30.05 
 
 
325 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5515  extracellular solute-binding protein family 3  26.34 
 
 
333 aa  56.2  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.467837  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3755  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.6 
 
 
335 aa  55.8  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  30.41 
 
 
343 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0481  NMT1/THI5 like domain protein  28.05 
 
 
327 aa  55.8  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4058  twin-arginine translocation pathway signal  28.99 
 
 
329 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1830  NMT1/THI5 like domain protein  25.91 
 
 
345 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223893  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3045  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  35.09 
 
 
329 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0526  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.75 
 
 
324 aa  55.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44550  ABC transporter periplasmic component  26.29 
 
 
371 aa  55.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4526  NMT1/THI5-like domain-containing protein  31.14 
 
 
336 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.600337  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0449  NMT1/THI5 like domain protein  28.42 
 
 
327 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2795  NMT1/THI5 like domain protein  27.16 
 
 
357 aa  54.7  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001037 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  27.05 
 
 
328 aa  55.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13660  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  25.1 
 
 
349 aa  54.3  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2789  NLPA lipoprotein  27.07 
 
 
360 aa  54.3  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3454  ABC transporter, substrate-binding protein  23.02 
 
 
334 aa  54.3  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2206  putative nitrate transporter component, NrtA  21.38 
 
 
457 aa  54.3  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4555  NMT1/THI5 like domain protein  22.5 
 
 
337 aa  53.9  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5599  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.7 
 
 
335 aa  53.9  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2222  taurine ABC transporter, periplasmic taurine-binding protein  28.21 
 
 
336 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0622  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  28.21 
 
 
336 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0123615  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  20.78 
 
 
1065 aa  53.5  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2135  taurine ABC transporter, periplasmic taurine-binding protein  28.21 
 
 
336 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611131  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0033  sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein, putative  23.96 
 
 
417 aa  53.1  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3742  twin-arginine translocation pathway signal  21.31 
 
 
467 aa  53.1  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0256  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  33.33 
 
 
325 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.208502 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>