228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3737 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3737  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  100 
 
 		 353 aa  694    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457967  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2680  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  83.29 
 
 		 353 aa  560  1e-158  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0955  hypothetical protein  63.58 
 
 		 349 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3755  NMT1/THI5-like domain-containing protein  40.76 
 
 		 335 aa  268  8e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2599  ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  36.86 
 
 		 335 aa  222  7e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0940  ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  36.54 
 
 		 335 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2975  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  36.93 
 
 		 336 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.459543  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1941  NMT1/THI5 family protein  32.9 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000780337 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1097  NMT1/THI5-like domain-containing protein  33.75 
 
 		 362 aa  178  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.93236 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1395  NMT1/THI5 like domain-containing protein  32.62 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.311199 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1093  twin-arginine translocation pathway signal  32.61 
 
 		 346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0392  twin-arginine translocation pathway signal  30.95 
 
 		 352 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00263227 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2129  hypothetical protein  33.44 
 
 		 341 aa  161  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1138  NMT1/THI5-like domain-containing protein  31.21 
 
 		 345 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.847412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3959  NMT1/THI5 like domain protein  31.29 
 
 		 344 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3969  NMT1/THI5 like domain protein  30.14 
 
 		 346 aa  153  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3607  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.34 
 
 		 351 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1084  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  30.23 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1136  NMT1/THI5-like domain-containing protein  31.51 
 
 		 351 aa  139  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.618524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.17 
 
 		 336 aa  92.8  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5403  hypothetical protein  25.68 
 
 		 329 aa  92.4  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164568  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0622  NMT1/THI5 like domain protein  27.33 
 
 		 338 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.28 
 
 		 342 aa  90.9  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  24.92 
 
 		 328 aa  88.6  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1861  NMT1/THI5 like domain protein  26.2 
 
 		 339 aa  87  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.24 
 
 		 344 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 915 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0619  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  25.96 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2297  NMT1/THI5 like domain protein  26.1 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  26.36 
 
 		 330 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5087  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.53 
 
 		 342 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  27.16 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  27.31 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1075  NMT1/THI5 like domain-containing protein  25.6 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.469481 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1486  NMT1/THI5 like domain protein  22.07 
 
 		 355 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  26.6 
 
 		 686 aa  73.2  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  25 
 
 		 333 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  23.51 
 
 		 340 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.48 
 
 		 1238 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2205  ABC transporter substrate-binding protein  23.67 
 
 		 324 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30906  predicted protein  23.62 
 
 		 339 aa  72.4  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.407472  normal  0.0307188 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.56 
 
 		 333 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0638  ABC transporter, substrate-binding protein  25 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1461  hypothetical protein  25.11 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0615  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.81 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1522  hypothetical protein  25.11 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0805  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5096200000000002e-46 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0815  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  26.56 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  27 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0638  ABC transporter, substrate-binding protein  24.63 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  24.32 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0882  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.27 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0694  ABC transporter substrate-binding protein  25 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0728  ABC transporter substrate-binding protein  25 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.245129  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3032  twin-arginine translocation pathway signal  30.13 
 
 		 348 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000338526  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.94 
 
 		 1075 aa  68.9  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2349  NMT1/THI5 like domain protein  26.92 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4595  NMT1/THI5 like domain protein  25.86 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3812  NMT1/THI5 like domain protein  25.26 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5201  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.45 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2065  NMT1/THI5 like domain protein  22.64 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411496  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1528  ABC transporter substrate-binding protein  26.51 
 
 		 357 aa  66.2  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0893  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.09 
 
 		 346 aa  65.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2762  membrane lipoprotein lipid attachment site  28.62 
 
 		 347 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0666  NMT1/THI5 like domain protein  25.23 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3456  hypothetical protein  25.26 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0343  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.99 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.010021  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  22.37 
 
 		 674 aa  63.2  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3508  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276709  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2388  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.64 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6283  NMT1/THI5 like domain protein  25.78 
 
 		 381 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6030  putative ABC transporter, substrate binding protein  25.08 
 
 		 329 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0213  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  27.75 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3878  membrane lipoprotein lipid attachment site  25.84 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0204  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.75 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08009  thiamine biosynthesis protein (Eurofung)  23.87 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504438  normal  0.187766 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3110  twin-arginine translocation pathway signal  20.21 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0856  hypothetical protein  25.81 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.028683  normal  0.870914 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0670  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  25.32 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2733  NMT1/THI5 like domain protein  28.38 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.546218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0646  ABC transporter, substrate-binding protein  26.8 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.714673  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2277  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.13 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191617  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2299  ABC transporter, substrate-binding protein  26.8 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0813032 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1173  NMT1/THI5 like domain protein  25.83 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0956705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2047  hypothetical protein  25.51 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0745441  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0667  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.09 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  26.13 
 
 		 778 aa  59.3  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1934  NLPA lipoprotein  30 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0767  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  32.69 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.250566 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  26.11 
 
 		 593 aa  58.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3563  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.55 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.087558  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1033  hypothetical protein  25.09 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.152767  normal  0.375545 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3755  twin-arginine translocation pathway signal  24.03 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0280  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.11 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0036  NlpA lipoprotein  22.51 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  22.93 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0586  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.48 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891954  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>