292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1395 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1395  NMT1/THI5 like domain-containing protein  100 
 
 
339 aa  674    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.311199 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0392  twin-arginine translocation pathway signal  50.79 
 
 
352 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00263227 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1097  NMT1/THI5-like domain-containing protein  48.76 
 
 
362 aa  305  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.93236 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3959  NMT1/THI5 like domain protein  48 
 
 
344 aa  291  8e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1093  twin-arginine translocation pathway signal  47.25 
 
 
346 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3755  NMT1/THI5-like domain-containing protein  43.31 
 
 
335 aa  276  5e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2129  hypothetical protein  44.51 
 
 
341 aa  275  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1138  NMT1/THI5-like domain-containing protein  45.83 
 
 
345 aa  270  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.847412  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2599  ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  40.19 
 
 
335 aa  247  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2975  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  40.86 
 
 
336 aa  245  8e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.459543  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0940  ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  39.87 
 
 
335 aa  245  8e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3607  NMT1/THI5-like domain-containing protein  37.22 
 
 
351 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1941  NMT1/THI5 family protein  37.95 
 
 
337 aa  208  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000780337 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3737  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  32.44 
 
 
353 aa  191  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457967  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3969  NMT1/THI5 like domain protein  36.31 
 
 
346 aa  190  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0955  hypothetical protein  35.48 
 
 
349 aa  189  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1136  NMT1/THI5-like domain-containing protein  35.14 
 
 
351 aa  182  7e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.618524  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1084  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  34.97 
 
 
340 aa  178  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2680  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  33.55 
 
 
353 aa  177  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  29.77 
 
 
340 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0622  NMT1/THI5 like domain protein  30.5 
 
 
338 aa  129  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3110  twin-arginine translocation pathway signal  30.89 
 
 
346 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4269  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.97 
 
 
341 aa  112  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933987  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3878  membrane lipoprotein lipid attachment site  28.22 
 
 
339 aa  112  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5403  hypothetical protein  28.1 
 
 
329 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164568  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.71 
 
 
331 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0619  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  23.64 
 
 
336 aa  99.4  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1861  NMT1/THI5 like domain protein  23.42 
 
 
339 aa  97.1  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4595  NMT1/THI5 like domain protein  29.41 
 
 
323 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.03 
 
 
336 aa  94  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2349  NMT1/THI5 like domain protein  26.05 
 
 
333 aa  93.6  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7652  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  24.18 
 
 
332 aa  90.9  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422947  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 
915 aa  90.1  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  27.18 
 
 
328 aa  90.1  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.99 
 
 
344 aa  88.6  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1486  NMT1/THI5 like domain protein  22.48 
 
 
355 aa  85.9  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1075  NMT1/THI5 like domain-containing protein  29.13 
 
 
325 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.469481 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2047  hypothetical protein  27.24 
 
 
326 aa  77.4  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0745441  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1466  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.34 
 
 
326 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  26.89 
 
 
375 aa  76.3  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.38 
 
 
1075 aa  75.1  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5087  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.39 
 
 
342 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  24.44 
 
 
342 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  25.99 
 
 
686 aa  73.6  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  26.42 
 
 
778 aa  73.2  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  28.25 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  27.65 
 
 
336 aa  73.2  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  24.09 
 
 
856 aa  73.2  0.000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2052  NMT1/THI5 like domain protein  28.18 
 
 
340 aa  73.2  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.0508257 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  23.88 
 
 
674 aa  72.8  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.55 
 
 
1238 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2373  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.72 
 
 
330 aa  70.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.163906 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0666  NMT1/THI5 like domain protein  25.23 
 
 
359 aa  70.1  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5127  Fis family transcriptional regulator  27.61 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.295645  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2795  NMT1/THI5 like domain protein  25.37 
 
 
357 aa  69.7  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001037 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5201  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.76 
 
 
345 aa  69.7  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2758  NMT1/THI5 like domain protein  24.83 
 
 
354 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512132  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6388  aliphatic sulfonate ABC transporter substrate-binding protein  31.03 
 
 
327 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269939  normal  0.249456 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0179  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  25.6 
 
 
326 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.907617  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2537  putative taurine ABC transporter, substrate binding protein  25.83 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237782  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1812  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  25.6 
 
 
326 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.661868  normal  0.196706 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3032  twin-arginine translocation pathway signal  23.05 
 
 
348 aa  66.2  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000338526  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0256  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  26.49 
 
 
325 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.208502 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.81 
 
 
342 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3508  twin-arginine translocation pathway signal  25.98 
 
 
342 aa  65.5  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276709  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6030  putative ABC transporter, substrate binding protein  26.94 
 
 
329 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1152  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.6 
 
 
340 aa  65.1  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4526  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.23 
 
 
336 aa  64.3  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.600337  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0257  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  26.78 
 
 
323 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.953427  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3417  NMT1/THI5 like domain protein  30.68 
 
 
332 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4215  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.21 
 
 
330 aa  63.9  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0815  NMT1/THI5 like domain protein  27.04 
 
 
321 aa  63.2  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  21.92 
 
 
330 aa  63.2  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2222  taurine ABC transporter, periplasmic taurine-binding protein  27.23 
 
 
336 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2135  taurine ABC transporter, periplasmic taurine-binding protein  27.23 
 
 
336 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611131  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0622  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  27.23 
 
 
336 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0123615  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3456  hypothetical protein  24.32 
 
 
336 aa  62.4  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0477  NMT1/THI5 like domain protein  23.51 
 
 
320 aa  62  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  25.2 
 
 
311 aa  62.4  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0233  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  26.44 
 
 
323 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.786536  decreased coverage  0.000160369 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0392  NMT1/THI5 like domain protein  27.08 
 
 
351 aa  61.2  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3298  NMT1/THI5 like domain protein  25.46 
 
 
323 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0248  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  26.44 
 
 
323 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0698542  normal  0.239622 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0838  taurine transporter substrate binding subunit  25.45 
 
 
320 aa  61.2  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2591  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.6 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.329095 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3043  NMT1/THI5 like domain protein  25.49 
 
 
323 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  24.56 
 
 
775 aa  60.8  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2388  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.61 
 
 
348 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3466  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.74 
 
 
330 aa  60.8  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.106164  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  24.41 
 
 
333 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3461  ABC transporter substrate binding protein (nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate)  24.13 
 
 
330 aa  60.5  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0638  ABC transporter, substrate-binding protein  24.41 
 
 
333 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2620  NMT1/THI5 like domain protein  23.14 
 
 
328 aa  60.1  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.985405  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0027  twin-arginine translocation pathway signal  25.63 
 
 
365 aa  60.1  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0343  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.33 
 
 
332 aa  60.1  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.010021  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.41 
 
 
333 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0805  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.41 
 
 
333 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5096200000000002e-46 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0882  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.82 
 
 
333 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1374  NMT1/THI5 like domain protein  26.61 
 
 
329 aa  59.7  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.353892  normal  0.853253 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.41 
 
 
333 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>