244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3417 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3417  NMT1/THI5 like domain protein  100 
 
 		 332 aa  660    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4578  NMT1/THI5-like domain-containing protein  59.33 
 
 		 335 aa  395  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3091  hypothetical protein  48.71 
 
 		 362 aa  295  6e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3110  twin-arginine translocation pathway signal  27.22 
 
 		 346 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1486  NMT1/THI5 like domain protein  27.6 
 
 		 355 aa  92.8  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7652  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  29.37 
 
 		 332 aa  90.5  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  25.85 
 
 		 340 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5403  hypothetical protein  29.27 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164568  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1861  NMT1/THI5 like domain protein  25.23 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.35 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.56 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4359  twin-arginine translocation pathway signal  26.77 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0619  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  25.79 
 
 		 336 aa  72.8  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1642  NMT1/THI5 like domain protein  25.98 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.604576 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3667  hypothetical protein  25.9 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1730  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.26 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.524252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  26.15 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3878  membrane lipoprotein lipid attachment site  29.05 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4269  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.76 
 
 		 341 aa  69.3  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933987  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1084  NMT1/THI5 like domain protein  29.65 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00229881  normal  0.0195344 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3456  hypothetical protein  28.46 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2049  NMT1/THI5 like domain protein  30.4 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6053  NMT1/THI5 like domain protein  25.23 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184042  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0343  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.63 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.010021  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3298  NMT1/THI5 like domain protein  27 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0306  twin-arginine translocation pathway signal  25.93 
 
 		 331 aa  65.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0622  NMT1/THI5 like domain protein  24.44 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2205  ABC transporter substrate-binding protein  23.81 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4165  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.61 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0994431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4052  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.23 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.577447 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3043  NMT1/THI5 like domain protein  27.31 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0667  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.53 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4758  NMT1/THI5 like domain protein  27.95 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1395  NMT1/THI5 like domain-containing protein  30.25 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.311199 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  30.67 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0436  NMT1/THI5 like protein  23.6 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  27.96 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0451  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.6 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0670  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  29.2 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0451  NMT1/THI5 like domain protein  33.59 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  normal  0.0280986 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1934  NLPA lipoprotein  28.32 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6030  putative ABC transporter, substrate binding protein  26.29 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1097  NMT1/THI5-like domain-containing protein  37.78 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.93236 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2297  NMT1/THI5 like domain protein  34.78 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2758  NMT1/THI5 like domain protein  25.23 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512132  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3461  ABC transporter substrate binding protein (nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate)  30.28 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3204  membrane lipoprotein lipid attachment site  36.04 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0443411  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3117  NMT1/THI5 like domain protein  24.31 
 
 		 331 aa  57  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0392  twin-arginine translocation pathway signal  27.64 
 
 		 352 aa  57  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00263227 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3337  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.78 
 
 		 326 aa  57  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.181277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  21.94 
 
 		 360 aa  57  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4256  NMT1/THI5 like domain protein  26.26 
 
 		 351 aa  57  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0797632  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1717  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.34 
 
 		 322 aa  57  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2036  NMT1/THI5 like domain protein  23.66 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.756885 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1097  NMT1/THI5 like domain protein  23.03 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0236053  normal  0.472572 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0893  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.45 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2373  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.77 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.163906 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0694  ABC transporter substrate-binding protein  23.13 
 
 		 333 aa  55.8  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0728  ABC transporter substrate-binding protein  23.13 
 
 		 333 aa  55.8  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.245129  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.7 
 
 		 333 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.45 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1033  hypothetical protein  22.53 
 
 		 342 aa  55.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.152767  normal  0.375545 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1423  extracellular solute-binding protein family 3  27.6 
 
 		 326 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2047  hypothetical protein  26.21 
 
 		 326 aa  55.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0745441  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3508  twin-arginine translocation pathway signal  23.81 
 
 		 342 aa  55.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276709  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1262  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.6 
 
 		 326 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.302787 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2098  NMT1/THI5 like domain protein  31.91 
 
 		 359 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.71 
 
 		 1238 aa  55.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1882  NMT1/THI5 like domain-containing protein  30.07 
 
 		 361 aa  55.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.4783 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  23.38 
 
 		 333 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0638  ABC transporter, substrate-binding protein  23.38 
 
 		 333 aa  53.9  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3607  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.85 
 
 		 351 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0882  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.38 
 
 		 333 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.57 
 
 		 338 aa  54.3  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0805  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.38 
 
 		 333 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5096200000000002e-46 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.2 
 
 		 333 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0638  ABC transporter, substrate-binding protein  23.38 
 
 		 333 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2172  putative nitrate transporter component, nrtA  25.83 
 
 		 460 aa  53.9  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.210639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6283  NMT1/THI5 like domain protein  29.57 
 
 		 381 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2129  hypothetical protein  38.26 
 
 		 341 aa  53.9  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0856  hypothetical protein  22.81 
 
 		 342 aa  53.5  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.028683  normal  0.870914 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  28.7 
 
 		 375 aa  53.5  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.27 
 
 		 915 aa  53.5  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1721  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.67 
 
 		 328 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal  0.736062 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0815  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  31.78 
 
 		 326 aa  53.1  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2040  NMT1/THI5 like domain protein  24.67 
 
 		 328 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0280  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.03 
 
 		 322 aa  52.8  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3959  NMT1/THI5 like domain protein  30.2 
 
 		 344 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1093  NMT1/THI5 like domain protein  25.39 
 
 		 328 aa  52  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000718314  normal  0.110975 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7630  hypothetical protein  31.16 
 
 		 363 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  0.456344 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1466  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.91 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1678  hypothetical protein  25.59 
 
 		 334 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0615  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.15 
 
 		 333 aa  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2834  twin-arginine translocation pathway signal  28.04 
 
 		 411 aa  51.6  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.960299 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3655  NLPA lipoprotein  26.32 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2868  NMT1/THI5 like domain protein  23.11 
 
 		 364 aa  51.6  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.51119  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  23.97 
 
 		 342 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3589  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.65 
 
 		 346 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  29.32 
 
 		 349 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  26.46 
 
 		 349 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.778479 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>