173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1084 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1084  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  100 
 
 
340 aa  682    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1136  NMT1/THI5-like domain-containing protein  63.1 
 
 
351 aa  402  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.618524  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3969  NMT1/THI5 like domain protein  60.95 
 
 
346 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1138  NMT1/THI5-like domain-containing protein  37.1 
 
 
345 aa  202  9e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.847412  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1093  twin-arginine translocation pathway signal  37.03 
 
 
346 aa  194  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3959  NMT1/THI5 like domain protein  35.28 
 
 
344 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1097  NMT1/THI5-like domain-containing protein  34.11 
 
 
362 aa  190  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.93236 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2129  hypothetical protein  36.15 
 
 
341 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0392  twin-arginine translocation pathway signal  34.91 
 
 
352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00263227 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3755  NMT1/THI5-like domain-containing protein  34.09 
 
 
335 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1395  NMT1/THI5 like domain-containing protein  34.97 
 
 
339 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.311199 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2599  ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  31.63 
 
 
335 aa  162  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2975  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  32.14 
 
 
336 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.459543  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0940  ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  31.63 
 
 
335 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3607  NMT1/THI5-like domain-containing protein  32.25 
 
 
351 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3737  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  30.23 
 
 
353 aa  140  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457967  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0955  hypothetical protein  29.08 
 
 
349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1941  NMT1/THI5 family protein  28.81 
 
 
337 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000780337 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2680  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  28.8 
 
 
353 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0622  NMT1/THI5 like domain protein  28.06 
 
 
338 aa  108  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.05 
 
 
336 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5403  hypothetical protein  26.38 
 
 
329 aa  104  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164568  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.02 
 
 
331 aa  102  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1861  NMT1/THI5 like domain protein  25.74 
 
 
339 aa  93.2  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0619  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  26.58 
 
 
336 aa  92  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  29.3 
 
 
686 aa  74.3  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2868  NMT1/THI5 like domain protein  25 
 
 
364 aa  73.9  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.51119  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 
915 aa  73.2  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3117  NMT1/THI5 like domain protein  26.22 
 
 
331 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3456  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7652  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  25.42 
 
 
332 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422947  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2573  NMT1/THI5 like domain protein  27.56 
 
 
385 aa  68.9  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.946083 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0670  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  26.63 
 
 
328 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0893  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.15 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0667  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.02 
 
 
329 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08009  thiamine biosynthesis protein (Eurofung)  23.47 
 
 
341 aa  64.3  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504438  normal  0.187766 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3032  twin-arginine translocation pathway signal  27.85 
 
 
348 aa  64.3  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000338526  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.39 
 
 
344 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2098  NMT1/THI5 like domain protein  30.96 
 
 
359 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1486  NMT1/THI5 like domain protein  23.4 
 
 
355 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  26.43 
 
 
375 aa  63.9  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30906  predicted protein  26.89 
 
 
339 aa  63.2  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.407472  normal  0.0307188 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3110  twin-arginine translocation pathway signal  21.24 
 
 
346 aa  62.8  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.24 
 
 
1238 aa  62.8  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4758  NMT1/THI5 like domain protein  23.75 
 
 
328 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0815  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  28.81 
 
 
326 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4269  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.14 
 
 
341 aa  61.6  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933987  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1262  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.86 
 
 
326 aa  60.8  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal  0.0156923 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.32 
 
 
1075 aa  60.8  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  25.23 
 
 
360 aa  60.5  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5087  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.91 
 
 
342 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3755  twin-arginine translocation pathway signal  25.71 
 
 
344 aa  60.1  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3298  NMT1/THI5 like domain protein  27.16 
 
 
323 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1882  NMT1/THI5 like domain-containing protein  30.51 
 
 
361 aa  59.7  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.4783 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3878  membrane lipoprotein lipid attachment site  23 
 
 
339 aa  59.3  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4595  NMT1/THI5 like domain protein  25.63 
 
 
323 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1075  NMT1/THI5 like domain-containing protein  27.23 
 
 
325 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.469481 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  25.39 
 
 
674 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  25.54 
 
 
593 aa  58.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0834  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.1 
 
 
336 aa  58.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.576945  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2024  NMT1/THI5 like domain protein  23.74 
 
 
344 aa  58.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3874  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.16 
 
 
336 aa  58.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1437  NMT1/THI5 like domain protein  24.89 
 
 
378 aa  57.8  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.608485 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5201  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.72 
 
 
345 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3508  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 
342 aa  57  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276709  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.46 
 
 
342 aa  57.4  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  25.68 
 
 
778 aa  57  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2795  NMT1/THI5 like domain protein  22.35 
 
 
357 aa  56.6  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001037 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3043  NMT1/THI5 like domain protein  25.63 
 
 
323 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3456  hypothetical protein  33.59 
 
 
336 aa  56.6  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2349  NMT1/THI5 like domain protein  27.24 
 
 
333 aa  56.2  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1717  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.7 
 
 
322 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  21.69 
 
 
340 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2762  membrane lipoprotein lipid attachment site  29.02 
 
 
347 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3091  hypothetical protein  33.33 
 
 
362 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0363  putative sulfonate/nitrate/taurine transport system substrate-binding protein  28.87 
 
 
317 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  26.53 
 
 
328 aa  54.7  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24150  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  24.03 
 
 
382 aa  54.7  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481096  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34300  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  26.22 
 
 
319 aa  54.3  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1528  ABC transporter substrate-binding protein  22.02 
 
 
357 aa  54.3  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1097  NMT1/THI5 like domain protein  24.69 
 
 
322 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0236053  normal  0.472572 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2297  NMT1/THI5 like domain protein  24.1 
 
 
312 aa  54.3  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2758  NMT1/THI5 like domain protein  30.21 
 
 
354 aa  53.9  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512132  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2036  NMT1/THI5 like domain protein  24.29 
 
 
322 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.756885 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0815  NMT1/THI5 like domain protein  26.59 
 
 
321 aa  53.1  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3563  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.3 
 
 
322 aa  53.5  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.087558  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2543  putative binding protein  25.42 
 
 
352 aa  53.1  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.721383 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2388  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.47 
 
 
348 aa  52.8  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1084  NMT1/THI5 like domain protein  26.18 
 
 
334 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00229881  normal  0.0195344 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  24.71 
 
 
333 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0882  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.71 
 
 
333 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.71 
 
 
333 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0706  putative secreted protein  25.22 
 
 
345 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.71 
 
 
333 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1093  NMT1/THI5 like domain protein  24.29 
 
 
328 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000718314  normal  0.110975 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  25.56 
 
 
721 aa  51.2  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2065  NMT1/THI5 like domain protein  23.22 
 
 
327 aa  51.2  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411496  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.71 
 
 
333 aa  50.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0638  ABC transporter, substrate-binding protein  24.33 
 
 
333 aa  50.8  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  24.2 
 
 
775 aa  50.4  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2049  NMT1/THI5 like domain protein  26.07 
 
 
334 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.574504 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>