198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1138 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1138  NMT1/THI5-like domain-containing protein  100 
 
 
345 aa  695    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.847412  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1093  twin-arginine translocation pathway signal  80.35 
 
 
346 aa  560  1e-158  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3959  NMT1/THI5 like domain protein  76.01 
 
 
344 aa  528  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2129  hypothetical protein  73.33 
 
 
341 aa  513  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1097  NMT1/THI5-like domain-containing protein  68.33 
 
 
362 aa  471  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.93236 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0392  twin-arginine translocation pathway signal  63.77 
 
 
352 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00263227 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1395  NMT1/THI5 like domain-containing protein  45.6 
 
 
339 aa  259  6e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.311199 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3755  NMT1/THI5-like domain-containing protein  43.45 
 
 
335 aa  246  4e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2599  ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  40.5 
 
 
335 aa  225  8e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0940  ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  40.19 
 
 
335 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2975  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  39.62 
 
 
336 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.459543  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1136  NMT1/THI5-like domain-containing protein  39.76 
 
 
351 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.618524  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1941  NMT1/THI5 family protein  42.36 
 
 
337 aa  207  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000780337 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3969  NMT1/THI5 like domain protein  39.88 
 
 
346 aa  205  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1084  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  37.57 
 
 
340 aa  203  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3607  NMT1/THI5-like domain-containing protein  36.05 
 
 
351 aa  189  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3737  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  31.38 
 
 
353 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457967  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0955  hypothetical protein  31.38 
 
 
349 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2680  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  30.72 
 
 
353 aa  158  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.7 
 
 
331 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5403  hypothetical protein  29.07 
 
 
329 aa  125  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164568  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3110  twin-arginine translocation pathway signal  29.07 
 
 
346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.69 
 
 
336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  27.41 
 
 
340 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.9 
 
 
344 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4269  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.31 
 
 
341 aa  100  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933987  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3878  membrane lipoprotein lipid attachment site  29.17 
 
 
339 aa  100  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2349  NMT1/THI5 like domain protein  24.68 
 
 
333 aa  93.2  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5087  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.19 
 
 
342 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1861  NMT1/THI5 like domain protein  27.34 
 
 
339 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  24.63 
 
 
778 aa  90.1  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  27 
 
 
674 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0619  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  27.39 
 
 
336 aa  88.2  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5201  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.13 
 
 
345 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0622  NMT1/THI5 like domain protein  28.34 
 
 
338 aa  86.3  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1486  NMT1/THI5 like domain protein  24.31 
 
 
355 aa  86.3  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  24.63 
 
 
686 aa  85.9  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.01 
 
 
915 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7652  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  24.18 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422947  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4595  NMT1/THI5 like domain protein  23.62 
 
 
323 aa  84  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.67 
 
 
1075 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2795  NMT1/THI5 like domain protein  29.06 
 
 
357 aa  80.9  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001037 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.71 
 
 
1238 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  25.22 
 
 
593 aa  75.5  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  25.7 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  23.53 
 
 
375 aa  70.1  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2868  NMT1/THI5 like domain protein  22.08 
 
 
364 aa  70.1  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.51119  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0893  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.28 
 
 
346 aa  70.1  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  23.97 
 
 
775 aa  69.3  0.00000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3117  NMT1/THI5 like domain protein  25.37 
 
 
331 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3456  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0027  twin-arginine translocation pathway signal  27.09 
 
 
365 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0670  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  26.78 
 
 
328 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1920  diguanylate cyclase  24.62 
 
 
893 aa  66.2  0.0000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1262  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.69 
 
 
326 aa  65.9  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal  0.0156923 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3667  hypothetical protein  26.09 
 
 
335 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  25.56 
 
 
336 aa  65.5  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2979  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.28 
 
 
323 aa  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1173  NMT1/THI5 like domain protein  26.02 
 
 
335 aa  65.1  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0956705  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3032  twin-arginine translocation pathway signal  25.9 
 
 
348 aa  65.1  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000338526  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  26.88 
 
 
343 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.51 
 
 
1004 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1437  NMT1/THI5 like domain protein  26.16 
 
 
378 aa  63.9  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.608485 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24150  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  23.66 
 
 
382 aa  62.8  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481096  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  24.45 
 
 
721 aa  62  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4526  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.52 
 
 
336 aa  62.4  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.600337  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.01 
 
 
1004 aa  62.4  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  24.56 
 
 
330 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4513  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  29.54 
 
 
335 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3508  twin-arginine translocation pathway signal  25.08 
 
 
342 aa  61.2  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276709  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0451  NMT1/THI5 like domain protein  24.66 
 
 
349 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  normal  0.0280986 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  24.38 
 
 
1065 aa  61.2  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3461  ABC transporter substrate binding protein (nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate)  24.44 
 
 
330 aa  60.5  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30906  predicted protein  26.23 
 
 
339 aa  59.7  0.00000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.407472  normal  0.0307188 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4758  NMT1/THI5 like domain protein  25.62 
 
 
328 aa  59.7  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3563  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.36 
 
 
322 aa  58.9  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.087558  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  23.93 
 
 
856 aa  59.3  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1084  NMT1/THI5 like domain protein  25.53 
 
 
334 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00229881  normal  0.0195344 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2762  membrane lipoprotein lipid attachment site  28.4 
 
 
347 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6283  NMT1/THI5 like domain protein  24.39 
 
 
381 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0666  NMT1/THI5 like domain protein  23.1 
 
 
359 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1882  NMT1/THI5 like domain-containing protein  26.97 
 
 
361 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.4783 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  27.8 
 
 
311 aa  58.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1583  NMT1/THI5 like domain protein  24.02 
 
 
338 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0280  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.74 
 
 
322 aa  58.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0343  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.1 
 
 
332 aa  58.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.010021  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  25.19 
 
 
333 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0694  ABC transporter substrate-binding protein  25.19 
 
 
333 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0728  ABC transporter substrate-binding protein  25.19 
 
 
333 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.245129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.19 
 
 
333 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1730  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.03 
 
 
329 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.524252  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0805  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.19 
 
 
333 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5096200000000002e-46 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0638  ABC transporter, substrate-binding protein  25.19 
 
 
333 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1528  ABC transporter substrate-binding protein  21.22 
 
 
357 aa  57  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2098  NMT1/THI5 like domain protein  25.62 
 
 
359 aa  56.6  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.19 
 
 
333 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0638  ABC transporter, substrate-binding protein  24.26 
 
 
333 aa  56.2  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2049  NMT1/THI5 like domain protein  24 
 
 
334 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6053  NMT1/THI5 like domain protein  25.7 
 
 
323 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184042  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1075  NMT1/THI5 like domain-containing protein  26.32 
 
 
325 aa  55.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.469481 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0667  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.72 
 
 
329 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>