215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3959 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3959  NMT1/THI5 like domain protein  100 
 
 		 344 aa  690    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1138  NMT1/THI5-like domain-containing protein  75.72 
 
 		 345 aa  520  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.847412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1093  twin-arginine translocation pathway signal  73.99 
 
 		 346 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2129  hypothetical protein  72.11 
 
 		 341 aa  502  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1097  NMT1/THI5-like domain-containing protein  71.64 
 
 		 362 aa  482  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.93236 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0392  twin-arginine translocation pathway signal  73.07 
 
 		 352 aa  476  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00263227 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1395  NMT1/THI5 like domain-containing protein  48.1 
 
 		 339 aa  273  3e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.311199 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3755  NMT1/THI5-like domain-containing protein  43.73 
 
 		 335 aa  240  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2599  ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  39.68 
 
 		 335 aa  209  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0940  ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  39.03 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2975  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  40.4 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.459543  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1136  NMT1/THI5-like domain-containing protein  38.91 
 
 		 351 aa  205  9e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.618524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1941  NMT1/THI5 family protein  41.69 
 
 		 337 aa  203  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000780337 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3607  NMT1/THI5-like domain-containing protein  37.81 
 
 		 351 aa  202  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3969  NMT1/THI5 like domain protein  39.42 
 
 		 346 aa  202  9e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1084  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  35.28 
 
 		 340 aa  191  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3737  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  31.29 
 
 		 353 aa  157  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457967  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0955  hypothetical protein  32.14 
 
 		 349 aa  153  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2680  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  31.51 
 
 		 353 aa  152  8.999999999999999e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5403  hypothetical protein  32.18 
 
 		 329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164568  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.52 
 
 		 331 aa  120  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.41 
 
 		 336 aa  114  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3878  membrane lipoprotein lipid attachment site  30.21 
 
 		 339 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4269  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.56 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933987  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3110  twin-arginine translocation pathway signal  30.77 
 
 		 346 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.35 
 
 		 344 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  30.97 
 
 		 340 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2349  NMT1/THI5 like domain protein  25.7 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1861  NMT1/THI5 like domain protein  25.58 
 
 		 339 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7652  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  26.49 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4595  NMT1/THI5 like domain protein  24.92 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1486  NMT1/THI5 like domain protein  26.13 
 
 		 355 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0619  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  25 
 
 		 336 aa  93.6  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5201  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.87 
 
 		 345 aa  90.1  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5087  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.35 
 
 		 342 aa  90.1  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  25.9 
 
 		 674 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0622  NMT1/THI5 like domain protein  26.71 
 
 		 338 aa  82.8  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2795  NMT1/THI5 like domain protein  27.44 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001037 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  23.61 
 
 		 775 aa  80.9  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.22 
 
 		 1075 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0670  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  30.25 
 
 		 328 aa  79.3  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  25.82 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.4 
 
 		 915 aa  77  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.52 
 
 		 1238 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  26.29 
 
 		 593 aa  76.3  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  23 
 
 		 778 aa  75.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  23.01 
 
 		 686 aa  74.3  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  26.79 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  27.15 
 
 		 336 aa  72.8  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1173  NMT1/THI5 like domain protein  26.44 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0956705  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2868  NMT1/THI5 like domain protein  26.46 
 
 		 364 aa  70.5  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.51119  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0027  twin-arginine translocation pathway signal  26.32 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0878  NMT1/THI5 like domain protein  24.76 
 
 		 339 aa  66.2  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000508636  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  27.62 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08009  thiamine biosynthesis protein (Eurofung)  27.64 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504438  normal  0.187766 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24150  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  24.8 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3508  twin-arginine translocation pathway signal  27 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276709  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  25.86 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30906  predicted protein  28.34 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.407472  normal  0.0307188 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0667  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.96 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3117  NMT1/THI5 like domain protein  27.69 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3456  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1437  NMT1/THI5 like domain protein  25.2 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.608485 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0666  NMT1/THI5 like domain protein  24.77 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6283  NMT1/THI5 like domain protein  25.48 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1920  diguanylate cyclase  23.37 
 
 		 893 aa  60.1  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3032  twin-arginine translocation pathway signal  23.96 
 
 		 348 aa  59.7  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000338526  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2979  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.53 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.17 
 
 		 1004 aa  59.3  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4526  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.04 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.600337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0451  NMT1/THI5 like domain protein  23.77 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  normal  0.0280986 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6053  NMT1/THI5 like domain protein  24.02 
 
 		 323 aa  59.3  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184042  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3667  hypothetical protein  22.12 
 
 		 335 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.62 
 
 		 1004 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2052  NMT1/THI5 like domain protein  24.39 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.0508257 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2733  NMT1/THI5 like domain protein  27.35 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.546218  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2101  NMT1/THI5 like domain protein  22.81 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1583  NMT1/THI5 like domain protein  25.1 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  22.61 
 
 		 721 aa  57.4  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4513  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.78 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0893  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.65 
 
 		 346 aa  57  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3204  membrane lipoprotein lipid attachment site  31.63 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0443411  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  24.47 
 
 		 856 aa  56.2  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3125  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.6 
 
 		 311 aa  55.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2049  NMT1/THI5 like domain protein  23.47 
 
 		 334 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1730  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.21 
 
 		 329 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.524252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3755  twin-arginine translocation pathway signal  24.63 
 
 		 344 aa  55.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1084  NMT1/THI5 like domain protein  24.82 
 
 		 334 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00229881  normal  0.0195344 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0671  NMT1/THI5 like domain protein  26.57 
 
 		 424 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1941  NMT1/THI5 like domain protein  23.23 
 
 		 315 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.876036  hitchhiker  0.000270678 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1075  NMT1/THI5 like domain-containing protein  24.42 
 
 		 325 aa  54.7  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.469481 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  24.27 
 
 		 1065 aa  54.7  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2762  membrane lipoprotein lipid attachment site  28.46 
 
 		 347 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2373  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.72 
 
 		 330 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.163906 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1302  NMT1/THI5 like domain protein  26.33 
 
 		 364 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0447941  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3874  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.84 
 
 		 336 aa  55.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2297  NMT1/THI5 like domain protein  25.43 
 
 		 312 aa  54.3  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3563  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.57 
 
 		 322 aa  54.7  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.087558  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2388  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.24 
 
 		 348 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.48 
 
 		 342 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0392  NMT1/THI5 like domain protein  24.32 
 
 		 351 aa  54.7  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>