206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2129 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2129  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  680    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3959  NMT1/THI5 like domain protein  72.86 
 
 
344 aa  508  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1093  twin-arginine translocation pathway signal  74.28 
 
 
346 aa  509  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1138  NMT1/THI5-like domain-containing protein  73.04 
 
 
345 aa  508  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.847412  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1097  NMT1/THI5-like domain-containing protein  67.16 
 
 
362 aa  474  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.93236 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0392  twin-arginine translocation pathway signal  64.58 
 
 
352 aa  434  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00263227 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1395  NMT1/THI5 like domain-containing protein  44.51 
 
 
339 aa  261  1e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.311199 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3755  NMT1/THI5-like domain-containing protein  40.19 
 
 
335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2599  ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  38.1 
 
 
335 aa  205  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0940  ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  37.78 
 
 
335 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2975  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  38.16 
 
 
336 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.459543  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1941  NMT1/THI5 family protein  40.19 
 
 
337 aa  199  7e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000780337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1136  NMT1/THI5-like domain-containing protein  38.01 
 
 
351 aa  195  8.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.618524  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3969  NMT1/THI5 like domain protein  37.07 
 
 
346 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1084  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  36.73 
 
 
340 aa  192  9e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3607  NMT1/THI5-like domain-containing protein  34.48 
 
 
351 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3737  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  33.44 
 
 
353 aa  161  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457967  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2680  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  34.23 
 
 
353 aa  159  8e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0955  hypothetical protein  31.21 
 
 
349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.35 
 
 
331 aa  120  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.8 
 
 
336 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3110  twin-arginine translocation pathway signal  28.53 
 
 
346 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5403  hypothetical protein  29.25 
 
 
329 aa  113  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164568  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  27.71 
 
 
340 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1486  NMT1/THI5 like domain protein  28.48 
 
 
355 aa  106  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.08 
 
 
344 aa  105  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7652  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  28.66 
 
 
332 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422947  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1861  NMT1/THI5 like domain protein  29.02 
 
 
339 aa  99.4  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0619  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  28.79 
 
 
336 aa  98.6  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2349  NMT1/THI5 like domain protein  26.05 
 
 
333 aa  98.2  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4269  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.51 
 
 
341 aa  95.5  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933987  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3878  membrane lipoprotein lipid attachment site  28.47 
 
 
339 aa  93.6  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5087  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.62 
 
 
342 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  30.36 
 
 
674 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5201  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.03 
 
 
345 aa  90.1  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4595  NMT1/THI5 like domain protein  24.04 
 
 
323 aa  88.6  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0622  NMT1/THI5 like domain protein  30.42 
 
 
338 aa  87.4  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.3 
 
 
1238 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  31.33 
 
 
593 aa  85.5  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 
915 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.71 
 
 
1075 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  28.63 
 
 
778 aa  82.4  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2795  NMT1/THI5 like domain protein  28.41 
 
 
357 aa  82  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001037 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0670  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  28.39 
 
 
328 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  25.58 
 
 
686 aa  79  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2868  NMT1/THI5 like domain protein  25.37 
 
 
364 aa  75.9  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.51119  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  29.79 
 
 
328 aa  75.5  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  25 
 
 
375 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  27.99 
 
 
336 aa  74.3  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3508  twin-arginine translocation pathway signal  27.53 
 
 
342 aa  71.2  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276709  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4513  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  31.22 
 
 
335 aa  69.7  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.51 
 
 
1004 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0667  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.17 
 
 
329 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2979  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.9 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3117  NMT1/THI5 like domain protein  25.81 
 
 
331 aa  67  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3456  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6053  NMT1/THI5 like domain protein  26.4 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184042  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0451  NMT1/THI5 like domain protein  27.35 
 
 
349 aa  66.2  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  normal  0.0280986 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  29.72 
 
 
343 aa  66.2  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.14 
 
 
1004 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  27.55 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08009  thiamine biosynthesis protein (Eurofung)  27.17 
 
 
341 aa  65.5  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504438  normal  0.187766 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  18.21 
 
 
775 aa  65.5  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3032  twin-arginine translocation pathway signal  26.52 
 
 
348 aa  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000338526  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2101  NMT1/THI5 like domain protein  23.66 
 
 
327 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0893  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.69 
 
 
346 aa  65.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0027  twin-arginine translocation pathway signal  26.43 
 
 
365 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1173  NMT1/THI5 like domain protein  26.41 
 
 
335 aa  64.3  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0956705  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3667  hypothetical protein  26.05 
 
 
335 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4526  NMT1/THI5-like domain-containing protein  34.23 
 
 
336 aa  63.2  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.600337  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1920  diguanylate cyclase  25.1 
 
 
893 aa  62.8  0.000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0878  NMT1/THI5 like domain protein  26.86 
 
 
339 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000508636  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0666  NMT1/THI5 like domain protein  25.11 
 
 
359 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1941  NMT1/THI5 like domain protein  26.56 
 
 
315 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.876036  hitchhiker  0.000270678 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3812  NMT1/THI5 like domain protein  26.03 
 
 
365 aa  60.5  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0671  NMT1/THI5 like domain protein  26.92 
 
 
424 aa  60.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2065  NMT1/THI5 like domain protein  26.07 
 
 
327 aa  60.5  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411496  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2758  NMT1/THI5 like domain protein  24.8 
 
 
354 aa  59.7  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512132  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1528  ABC transporter substrate-binding protein  21.01 
 
 
357 aa  59.3  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6283  NMT1/THI5 like domain protein  24.4 
 
 
381 aa  59.3  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1821  diguanylate cyclase  25.63 
 
 
821 aa  59.3  0.00000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1642  NMT1/THI5 like domain protein  30.08 
 
 
338 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.604576 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0371  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.61 
 
 
332 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  27.27 
 
 
311 aa  58.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.15 
 
 
342 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30906  predicted protein  25.52 
 
 
339 aa  57.4  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.407472  normal  0.0307188 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  21.63 
 
 
856 aa  56.6  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0492  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  24.52 
 
 
332 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1262  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.58 
 
 
326 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal  0.0156923 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0615  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.4 
 
 
333 aa  55.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1583  NMT1/THI5 like domain protein  25.51 
 
 
338 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4165  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.09 
 
 
331 aa  54.7  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0994431  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2388  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.74 
 
 
348 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3417  NMT1/THI5 like domain protein  37.9 
 
 
332 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1882  NMT1/THI5 like domain-containing protein  25.21 
 
 
361 aa  55.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.4783 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3563  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.95 
 
 
322 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.087558  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2788  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.88 
 
 
336 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0498257  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2573  NMT1/THI5 like domain protein  23.89 
 
 
385 aa  54.7  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.946083 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1084  NMT1/THI5 like domain protein  24.64 
 
 
334 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00229881  normal  0.0195344 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2052  NMT1/THI5 like domain protein  25.69 
 
 
340 aa  53.9  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.0508257 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2762  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.67 
 
 
347 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>