223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2680 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2680  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  100 
 
 
353 aa  691    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3737  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components  83.29 
 
 
353 aa  580  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457967  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0955  hypothetical protein  63.34 
 
 
349 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3755  NMT1/THI5-like domain-containing protein  40.45 
 
 
335 aa  263  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2599  ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  38.51 
 
 
335 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2975  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  38.28 
 
 
336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.459543  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0940  ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  37.54 
 
 
335 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1097  NMT1/THI5-like domain-containing protein  34.92 
 
 
362 aa  185  9e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.93236 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1941  NMT1/THI5 family protein  34.84 
 
 
337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000780337 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1395  NMT1/THI5 like domain-containing protein  33.55 
 
 
339 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.311199 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1093  twin-arginine translocation pathway signal  32.3 
 
 
346 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0392  twin-arginine translocation pathway signal  30.84 
 
 
352 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00263227 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2129  hypothetical protein  34.28 
 
 
341 aa  166  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1138  NMT1/THI5-like domain-containing protein  31.09 
 
 
345 aa  160  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.847412  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3969  NMT1/THI5 like domain protein  31.3 
 
 
346 aa  159  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3959  NMT1/THI5 like domain protein  31.51 
 
 
344 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3607  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.84 
 
 
351 aa  149  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1136  NMT1/THI5-like domain-containing protein  31.45 
 
 
351 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.618524  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1084  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  28.8 
 
 
340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.35 
 
 
331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.17 
 
 
336 aa  95.9  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  25.66 
 
 
330 aa  87.8  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 
915 aa  88.6  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5403  hypothetical protein  26.71 
 
 
329 aa  87.8  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164568  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1861  NMT1/THI5 like domain protein  26.57 
 
 
339 aa  84  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0622  NMT1/THI5 like domain protein  26.37 
 
 
338 aa  82.8  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.71 
 
 
342 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  28.33 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.93 
 
 
344 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3812  NMT1/THI5 like domain protein  25.23 
 
 
365 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0619  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  26.38 
 
 
336 aa  76.3  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1486  NMT1/THI5 like domain protein  20.92 
 
 
355 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  28.11 
 
 
686 aa  73.6  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4595  NMT1/THI5 like domain protein  27.91 
 
 
323 aa  73.9  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  24.49 
 
 
336 aa  73.6  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.42 
 
 
1238 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08009  thiamine biosynthesis protein (Eurofung)  26.96 
 
 
341 aa  72  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504438  normal  0.187766 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5087  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.96 
 
 
342 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30906  predicted protein  23.62 
 
 
339 aa  70.9  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.407472  normal  0.0307188 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5201  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.28 
 
 
345 aa  70.5  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1075  NMT1/THI5 like domain-containing protein  25.85 
 
 
325 aa  69.7  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.469481 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2297  NMT1/THI5 like domain protein  27.52 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.84 
 
 
1075 aa  69.7  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  26.72 
 
 
311 aa  68.9  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2349  NMT1/THI5 like domain protein  25.83 
 
 
333 aa  67.8  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1522  hypothetical protein  24.18 
 
 
314 aa  67  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0882  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.21 
 
 
333 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0280  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.48 
 
 
322 aa  66.6  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  24.65 
 
 
360 aa  66.2  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0213  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  27.88 
 
 
322 aa  66.2  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.21 
 
 
333 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0694  ABC transporter substrate-binding protein  24.21 
 
 
333 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0638  ABC transporter, substrate-binding protein  24.21 
 
 
333 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1461  hypothetical protein  25.21 
 
 
314 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0728  ABC transporter substrate-binding protein  24.21 
 
 
333 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.245129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.21 
 
 
333 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0805  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.21 
 
 
333 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5096200000000002e-46 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0204  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.88 
 
 
322 aa  65.9  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1173  NMT1/THI5 like domain protein  25.73 
 
 
335 aa  64.7  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0956705  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1934  NLPA lipoprotein  31.18 
 
 
329 aa  65.5  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  24.19 
 
 
333 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  23.86 
 
 
333 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3032  twin-arginine translocation pathway signal  27.05 
 
 
348 aa  64.7  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000338526  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0638  ABC transporter, substrate-binding protein  23.86 
 
 
333 aa  63.9  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3456  hypothetical protein  23.65 
 
 
336 aa  63.2  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  25.48 
 
 
778 aa  63.2  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1262  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.37 
 
 
326 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal  0.0156923 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0646  ABC transporter, substrate-binding protein  29.41 
 
 
311 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.714673  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  22.29 
 
 
674 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2299  ABC transporter, substrate-binding protein  29.41 
 
 
311 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0813032 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1642  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  26.56 
 
 
335 aa  62  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456194  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  22 
 
 
340 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3125  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.85 
 
 
311 aa  61.6  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1528  ABC transporter substrate-binding protein  26.09 
 
 
357 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0586  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.66 
 
 
309 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.891954  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6030  putative ABC transporter, substrate binding protein  25.24 
 
 
329 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0666  NMT1/THI5 like domain protein  24.31 
 
 
359 aa  60.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0767  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  30.73 
 
 
322 aa  60.8  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.250566 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  24.89 
 
 
343 aa  60.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0243  ABC transporter, permease protein, putative  27.94 
 
 
587 aa  60.1  0.00000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2388  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.55 
 
 
348 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0036  NlpA lipoprotein  24.46 
 
 
323 aa  59.7  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2733  NMT1/THI5 like domain protein  28.05 
 
 
349 aa  59.3  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.546218  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2065  NMT1/THI5 like domain protein  22.83 
 
 
327 aa  58.9  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411496  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2047  hypothetical protein  24.7 
 
 
326 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0745441  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0343  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.58 
 
 
332 aa  58.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.010021  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2277  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.42 
 
 
313 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191617  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3878  membrane lipoprotein lipid attachment site  25.95 
 
 
339 aa  59.3  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0670  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  25.51 
 
 
328 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4269  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.75 
 
 
341 aa  58.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933987  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06841  nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components  25.42 
 
 
337 aa  58.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3563  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.52 
 
 
322 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.087558  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1466  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.03 
 
 
326 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1882  NMT1/THI5 like domain-containing protein  28.72 
 
 
361 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.4783 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2205  ABC transporter substrate-binding protein  21.69 
 
 
324 aa  57.4  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6283  NMT1/THI5 like domain protein  24.32 
 
 
381 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0179  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  23.94 
 
 
326 aa  56.6  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.907617  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3936  NMT1/THI5 like domain protein  25.35 
 
 
336 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0815  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  24.48 
 
 
326 aa  56.6  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1812  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  23.94 
 
 
326 aa  56.6  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.661868  normal  0.196706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>