240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4269 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4269  NMT1/THI5-like domain-containing protein  100 
 
 
341 aa  687    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933987  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3878  membrane lipoprotein lipid attachment site  87.39 
 
 
339 aa  580  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  29.18 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3110  twin-arginine translocation pathway signal  30.88 
 
 
346 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0392  twin-arginine translocation pathway signal  28.87 
 
 
352 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00263227 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1395  NMT1/THI5 like domain-containing protein  29.97 
 
 
339 aa  107  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.311199 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3959  NMT1/THI5 like domain protein  30.56 
 
 
344 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1093  twin-arginine translocation pathway signal  28.43 
 
 
346 aa  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1138  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.31 
 
 
345 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.847412  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0622  NMT1/THI5 like domain protein  26.74 
 
 
338 aa  99.8  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.13 
 
 
331 aa  99.8  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0451  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.58 
 
 
316 aa  98.2  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0436  NMT1/THI5 like protein  30.58 
 
 
316 aa  98.2  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2129  hypothetical protein  29.51 
 
 
341 aa  95.1  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  28.62 
 
 
328 aa  94.7  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  30.9 
 
 
686 aa  92.8  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1097  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.43 
 
 
362 aa  92.4  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.93236 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5403  hypothetical protein  25.8 
 
 
329 aa  91.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164568  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1152  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.97 
 
 
340 aa  89.4  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2758  NMT1/THI5 like domain protein  28.57 
 
 
354 aa  89.4  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512132  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3755  NMT1/THI5-like domain-containing protein  31.06 
 
 
335 aa  89.4  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0121  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  31.56 
 
 
356 aa  89  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 
915 aa  88.6  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  32.41 
 
 
342 aa  87.8  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3032  twin-arginine translocation pathway signal  29.62 
 
 
348 aa  86.3  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000338526  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  29.52 
 
 
721 aa  85.1  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3117  NMT1/THI5 like domain protein  30.13 
 
 
331 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3456  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0392  NMT1/THI5 like domain protein  27.96 
 
 
351 aa  85.1  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0619  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  25.96 
 
 
336 aa  84  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  26.3 
 
 
856 aa  82.8  0.000000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  27.33 
 
 
1065 aa  82.8  0.000000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3204  membrane lipoprotein lipid attachment site  25.43 
 
 
336 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0443411  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1861  NMT1/THI5 like domain protein  25 
 
 
339 aa  82.4  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0667  NMT1/THI5-like domain-containing protein  31.02 
 
 
329 aa  82.8  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0878  NMT1/THI5 like domain protein  24.18 
 
 
339 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000508636  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.77 
 
 
1238 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.88 
 
 
344 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.64 
 
 
1004 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1486  NMT1/THI5 like domain protein  29.03 
 
 
355 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7652  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  28.21 
 
 
332 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422947  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0670  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  29.05 
 
 
328 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.08 
 
 
1004 aa  79  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  28.98 
 
 
674 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1136  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.13 
 
 
351 aa  76.6  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.618524  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0371  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.17 
 
 
332 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3607  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.49 
 
 
351 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0027  twin-arginine translocation pathway signal  28.72 
 
 
365 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  27.36 
 
 
778 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.48 
 
 
336 aa  75.1  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2065  NMT1/THI5 like domain protein  28.51 
 
 
327 aa  72.4  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411496  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5087  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.06 
 
 
342 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2330  NMT1/THI5 like domain-containing protein  26.73 
 
 
314 aa  71.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4877  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.62 
 
 
332 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0368  ABC transporter substrate-binding protein  25.62 
 
 
332 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0358  ABC transporter, substrate-binding protein  25.62 
 
 
332 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0355  ABC transporter, substrate-binding protein  25.62 
 
 
332 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0382  ABC transporter substrate-binding protein  25.62 
 
 
332 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0425  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.62 
 
 
332 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0494  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.62 
 
 
332 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0363  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.12 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0492  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  27.12 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0447  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.12 
 
 
332 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2101  NMT1/THI5 like domain protein  26.14 
 
 
327 aa  69.7  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  23.15 
 
 
375 aa  69.7  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  25.17 
 
 
775 aa  69.3  0.00000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3417  NMT1/THI5 like domain protein  29.76 
 
 
332 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.93 
 
 
1075 aa  68.9  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2297  NMT1/THI5 like domain protein  27.23 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3091  hypothetical protein  24.35 
 
 
362 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5352  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.03 
 
 
329 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2205  ABC transporter substrate-binding protein  23.64 
 
 
324 aa  67  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5441  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.03 
 
 
329 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.558403 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5731  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.03 
 
 
329 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2795  NMT1/THI5 like domain protein  26.52 
 
 
357 aa  66.6  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001037 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5201  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.82 
 
 
345 aa  66.2  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0940  ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  27.04 
 
 
335 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0655  NMT1/THI5-like protein  27 
 
 
350 aa  64.7  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13660  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  24.66 
 
 
349 aa  64.3  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1821  diguanylate cyclase  25.62 
 
 
821 aa  64.3  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2599  ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  27.94 
 
 
335 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2975  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.76 
 
 
336 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.459543  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4256  NMT1/THI5 like domain protein  27.1 
 
 
351 aa  63.5  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0797632  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2349  NMT1/THI5 like domain protein  25.61 
 
 
333 aa  63.2  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1444  NMT1/THI5-like protein  26.35 
 
 
318 aa  63.2  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.477186 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1222  NMT1/THI5 like domain protein  28.11 
 
 
360 aa  62.8  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1084  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  26.14 
 
 
340 aa  62  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3667  hypothetical protein  24.9 
 
 
335 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3563  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.64 
 
 
322 aa  62.4  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.087558  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2702  diguanylate cyclase  24.1 
 
 
794 aa  61.2  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564678  normal  0.658888 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0477  NMT1/THI5 like domain protein  25.98 
 
 
320 aa  60.5  0.00000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4526  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.65 
 
 
336 aa  60.1  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.600337  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4595  NMT1/THI5 like domain protein  24.21 
 
 
323 aa  59.7  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2789  NLPA lipoprotein  23.87 
 
 
360 aa  59.3  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0851  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.08 
 
 
328 aa  59.7  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0219644  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4513  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  22.68 
 
 
335 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0666  NMT1/THI5 like domain protein  25 
 
 
359 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  22.19 
 
 
333 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2543  putative binding protein  27.13 
 
 
352 aa  57.8  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.721383 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  22.3 
 
 
333 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2477  NMT1/THI5 like domain protein  25.17 
 
 
331 aa  57.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>