222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3091 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3091  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  730    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3417  NMT1/THI5 like domain protein  48.71 
 
 		 332 aa  295  7e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4578  NMT1/THI5-like domain-containing protein  46.47 
 
 		 335 aa  291  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  28.48 
 
 		 340 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0694  ABC transporter substrate-binding protein  27.64 
 
 		 333 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0728  ABC transporter substrate-binding protein  27.64 
 
 		 333 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.245129  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.95 
 
 		 333 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3110  twin-arginine translocation pathway signal  24.92 
 
 		 346 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0805  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.64 
 
 		 333 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5096200000000002e-46 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  27.64 
 
 		 333 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0638  ABC transporter, substrate-binding protein  27.64 
 
 		 333 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.64 
 
 		 333 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0638  ABC transporter, substrate-binding protein  27.33 
 
 		 333 aa  87.4  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0882  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.64 
 
 		 333 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.52 
 
 		 336 aa  86.3  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2868  NMT1/THI5 like domain protein  23.59 
 
 		 364 aa  84.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.51119  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.71 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5403  hypothetical protein  26.64 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164568  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1084  NMT1/THI5 like domain protein  26.56 
 
 		 334 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00229881  normal  0.0195344 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0615  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.22 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1730  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.06 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.524252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3204  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.48 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0443411  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  22.71 
 
 		 674 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2049  NMT1/THI5 like domain protein  25.74 
 
 		 334 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  21.88 
 
 		 331 aa  75.9  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2065  NMT1/THI5 like domain protein  22.58 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411496  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.76 
 
 		 1238 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3667  hypothetical protein  26.6 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3298  NMT1/THI5 like domain protein  24.53 
 
 		 323 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.92 
 
 		 915 aa  72  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7652  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  25.88 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  22.71 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1097  NMT1/THI5 like domain protein  23.7 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0236053  normal  0.472572 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4359  twin-arginine translocation pathway signal  26.77 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6053  NMT1/THI5 like domain protein  24.4 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184042  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3563  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.51 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.087558  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0667  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.34 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  22.08 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1486  NMT1/THI5 like domain protein  25.32 
 
 		 355 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4269  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.35 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933987  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3456  hypothetical protein  25.77 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2036  NMT1/THI5 like domain protein  23.23 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.756885 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1583  NMT1/THI5 like domain protein  24.42 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  22.29 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4165  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.5 
 
 		 331 aa  65.9  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0994431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1642  NMT1/THI5 like domain protein  25.85 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.604576 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  20.42 
 
 		 1075 aa  65.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1483  ABC transporter substrate-binding protein  27.07 
 
 		 330 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0893  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.12 
 
 		 346 aa  65.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0670  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  25.75 
 
 		 328 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0451  NMT1/THI5-like domain-containing protein  21.88 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1717  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.58 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2297  NMT1/THI5 like domain protein  26.4 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0436  NMT1/THI5 like protein  21.88 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1861  NMT1/THI5 like domain protein  21.49 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0371  NMT1/THI5-like domain-containing protein  21.22 
 
 		 332 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0492  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  20.75 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  23.57 
 
 		 593 aa  64.3  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0494  putative ABC transporter, substrate-binding protein  20.5 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0368  ABC transporter substrate-binding protein  20.5 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0358  ABC transporter, substrate-binding protein  20.5 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0355  ABC transporter, substrate-binding protein  20.5 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0382  ABC transporter substrate-binding protein  20.5 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0425  putative ABC transporter, substrate-binding protein  20.5 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3508  twin-arginine translocation pathway signal  25.26 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276709  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.87 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  20.24 
 
 		 336 aa  63.2  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3117  NMT1/THI5 like domain protein  24.05 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4877  putative ABC transporter, substrate-binding protein  20.19 
 
 		 332 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0447  putative ABC transporter, substrate-binding protein  20.19 
 
 		 332 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  22.36 
 
 		 375 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  22.88 
 
 		 686 aa  62  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2206  putative nitrate transporter component, NrtA  25.53 
 
 		 457 aa  62  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0363  NMT1/THI5-like domain-containing protein  20.58 
 
 		 332 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2762  membrane lipoprotein lipid attachment site  22.88 
 
 		 347 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2388  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.34 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1173  NMT1/THI5 like domain protein  24.93 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0956705  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0815  NMT1/THI5 like domain protein  23.68 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2795  NMT1/THI5 like domain protein  26.51 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001037 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3878  membrane lipoprotein lipid attachment site  22.82 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1093  NMT1/THI5 like domain protein  25.99 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000718314  normal  0.110975 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.91 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2034  NMT1/THI5 like domain protein  20.65 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.599976  normal  0.2602 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08009  thiamine biosynthesis protein (Eurofung)  25 
 
 		 341 aa  59.3  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504438  normal  0.187766 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3043  NMT1/THI5 like domain protein  24.67 
 
 		 323 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1934  NLPA lipoprotein  27.37 
 
 		 329 aa  59.3  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4758  NMT1/THI5 like domain protein  26.72 
 
 		 328 aa  59.3  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0619  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  20.36 
 
 		 336 aa  59.3  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2373  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.26 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.163906 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  22.84 
 
 		 721 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2047  hypothetical protein  23.87 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0745441  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1444  NMT1/THI5-like protein  22.7 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.477186 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0622  NMT1/THI5 like domain protein  22.9 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0451  NMT1/THI5 like domain protein  30.63 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  normal  0.0280986 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  23.21 
 
 		 330 aa  57  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30906  predicted protein  22.73 
 
 		 339 aa  57  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.407472  normal  0.0307188 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0343  NMT1/THI5-like domain-containing protein  21.57 
 
 		 332 aa  57  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.010021  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3755  twin-arginine translocation pathway signal  24.62 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1222  NMT1/THI5 like domain protein  21.99 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1395  NMT1/THI5 like domain-containing protein  29.83 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.311199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>