More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0670 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0670  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  100 
 
 
328 aa  674    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0667  NMT1/THI5-like domain-containing protein  90.58 
 
 
329 aa  618  1e-176  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3117  NMT1/THI5 like domain protein  80.42 
 
 
331 aa  546  1e-154  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3456  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3204  membrane lipoprotein lipid attachment site  56.13 
 
 
336 aa  363  3e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0443411  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2065  NMT1/THI5 like domain protein  51.37 
 
 
327 aa  344  1e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411496  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0436  NMT1/THI5 like protein  56.71 
 
 
316 aa  343  2e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0451  NMT1/THI5-like domain-containing protein  56.71 
 
 
316 aa  343  2e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0371  NMT1/THI5-like domain-containing protein  49.1 
 
 
332 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0363  NMT1/THI5-like domain-containing protein  50.15 
 
 
332 aa  323  3e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0492  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  50.15 
 
 
332 aa  323  4e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0447  putative ABC transporter, substrate-binding protein  50.15 
 
 
332 aa  322  5e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0494  putative ABC transporter, substrate-binding protein  50.15 
 
 
332 aa  322  8e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0368  ABC transporter substrate-binding protein  50.15 
 
 
332 aa  322  8e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0358  ABC transporter, substrate-binding protein  50.15 
 
 
332 aa  322  8e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0355  ABC transporter, substrate-binding protein  50.15 
 
 
332 aa  322  8e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0382  ABC transporter substrate-binding protein  50.15 
 
 
332 aa  322  8e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0425  putative ABC transporter, substrate-binding protein  50.15 
 
 
332 aa  322  8e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4877  putative ABC transporter, substrate-binding protein  49.85 
 
 
332 aa  319  3e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  46.63 
 
 
342 aa  309  2.9999999999999997e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1222  NMT1/THI5 like domain protein  43.67 
 
 
360 aa  271  1e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0878  NMT1/THI5 like domain protein  40.64 
 
 
339 aa  260  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000508636  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1152  NMT1/THI5-like domain-containing protein  42.81 
 
 
340 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13660  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  41.29 
 
 
349 aa  244  1.9999999999999999e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0477  NMT1/THI5 like domain protein  41.69 
 
 
320 aa  242  5e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1444  NMT1/THI5-like protein  36.7 
 
 
318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.477186 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0392  NMT1/THI5 like domain protein  38.13 
 
 
351 aa  219  3.9999999999999997e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0451  NMT1/THI5 like domain protein  42.67 
 
 
349 aa  206  4e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  normal  0.0280986 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1669  NMT1/THI5 like domain protein  37.7 
 
 
360 aa  198  9e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.833326  normal  0.535701 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4670  NMT1/THI5 like domain protein  34.92 
 
 
318 aa  181  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  34 
 
 
328 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3018  NMT1/THI5 like domain protein  35.05 
 
 
342 aa  166  5e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1941  NMT1/THI5 like domain protein  32.19 
 
 
315 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.876036  hitchhiker  0.000270678 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0121  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  32.58 
 
 
356 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3936  NMT1/THI5 like domain protein  34.4 
 
 
336 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0655  NMT1/THI5-like protein  32.23 
 
 
350 aa  150  2e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3647  NMT1/THI5 like domain protein  35.04 
 
 
336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2297  NMT1/THI5 like domain protein  28.27 
 
 
312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0694  ABC transporter substrate-binding protein  28.78 
 
 
333 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0728  ABC transporter substrate-binding protein  28.78 
 
 
333 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.245129  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.08 
 
 
333 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0882  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.78 
 
 
333 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  28.78 
 
 
333 aa  129  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.78 
 
 
333 aa  129  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1642  NMT1/THI5 like domain protein  29.28 
 
 
338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.604576 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0638  ABC transporter, substrate-binding protein  28.49 
 
 
333 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0615  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.92 
 
 
333 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0805  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.49 
 
 
333 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5096200000000002e-46 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0638  ABC transporter, substrate-binding protein  28.19 
 
 
333 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.57 
 
 
344 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.19 
 
 
333 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2388  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.63 
 
 
348 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  29.85 
 
 
330 aa  108  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2762  membrane lipoprotein lipid attachment site  29.38 
 
 
347 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2052  NMT1/THI5 like domain protein  29.17 
 
 
340 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.0508257 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4256  NMT1/THI5 like domain protein  27.15 
 
 
351 aa  105  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0797632  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5201  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.36 
 
 
345 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0280  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.54 
 
 
322 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.71 
 
 
342 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  29.23 
 
 
674 aa  102  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2205  ABC transporter substrate-binding protein  25.44 
 
 
324 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 
915 aa  95.9  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  27.76 
 
 
360 aa  95.9  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0909  NMT1/THI5 like domain protein  27.52 
 
 
311 aa  95.5  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0643839  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2868  NMT1/THI5 like domain protein  26.32 
 
 
364 aa  95.5  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.51119  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  28.8 
 
 
375 aa  94  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5087  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.99 
 
 
342 aa  92.8  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1461  hypothetical protein  24.01 
 
 
314 aa  92.8  7e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1522  hypothetical protein  24.01 
 
 
314 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0204  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.01 
 
 
322 aa  91.3  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24150  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  27 
 
 
382 aa  91.7  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481096  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0213  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.01 
 
 
322 aa  90.5  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2024  NMT1/THI5 like domain protein  25.08 
 
 
344 aa  90.9  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.35 
 
 
1238 aa  89.7  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.16 
 
 
336 aa  89  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1642  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  25.57 
 
 
335 aa  87.8  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456194  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3125  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.6 
 
 
311 aa  87.8  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1262  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.97 
 
 
326 aa  86.3  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal  0.0156923 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1528  ABC transporter substrate-binding protein  26.84 
 
 
357 aa  86.3  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2733  NMT1/THI5 like domain protein  25.84 
 
 
349 aa  85.9  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.546218  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  26.62 
 
 
686 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2349  NMT1/THI5 like domain protein  24.84 
 
 
333 aa  85.9  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2375  ABC transporter substrate-binding protein  29.57 
 
 
312 aa  85.9  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0489  hypothetical protein  24.2 
 
 
315 aa  85.1  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1934  NLPA lipoprotein  30.22 
 
 
329 aa  84.3  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30906  predicted protein  26.34 
 
 
339 aa  83.6  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.407472  normal  0.0307188 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2373  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.82 
 
 
330 aa  83.6  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.163906 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  24.1 
 
 
340 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3655  NLPA lipoprotein  23.77 
 
 
311 aa  82.8  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3878  membrane lipoprotein lipid attachment site  30.71 
 
 
339 aa  82.8  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  26.64 
 
 
311 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3456  hypothetical protein  36.72 
 
 
336 aa  82  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000866  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter substrate-binding component  29.03 
 
 
316 aa  82  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0036  NlpA lipoprotein  24.28 
 
 
323 aa  82.4  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2034  NMT1/THI5 like domain protein  26.07 
 
 
347 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.599976  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2047  hypothetical protein  27.33 
 
 
326 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0745441  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2129  hypothetical protein  28.39 
 
 
341 aa  81.6  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4269  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.05 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933987  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  27.43 
 
 
593 aa  80.9  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4595  NMT1/THI5 like domain protein  23.4 
 
 
323 aa  80.1  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3755  twin-arginine translocation pathway signal  29.13 
 
 
344 aa  79.7  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>