204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1302 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1302  NMT1/THI5 like domain protein  100 
 
 
364 aa  734    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0447941  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0027  twin-arginine translocation pathway signal  51.11 
 
 
365 aa  348  9e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5692  NMT1/THI5-like domain-containing protein  46.76 
 
 
360 aa  316  5e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2795  NMT1/THI5 like domain protein  49.7 
 
 
357 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001037 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3667  hypothetical protein  39.53 
 
 
335 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4165  NMT1/THI5-like domain-containing protein  38.54 
 
 
331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0994431  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4359  twin-arginine translocation pathway signal  36.34 
 
 
331 aa  184  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0306  twin-arginine translocation pathway signal  36.54 
 
 
331 aa  177  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2979  NMT1/THI5-like domain-containing protein  32.07 
 
 
323 aa  159  8e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3032  twin-arginine translocation pathway signal  28.98 
 
 
348 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000338526  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2758  NMT1/THI5 like domain protein  29.39 
 
 
354 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512132  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 
915 aa  110  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.39 
 
 
1075 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.68 
 
 
1004 aa  100  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  28.67 
 
 
686 aa  99.4  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3508  twin-arginine translocation pathway signal  27.82 
 
 
342 aa  94.7  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276709  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.52 
 
 
1004 aa  91.3  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.38 
 
 
344 aa  89.4  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  26.89 
 
 
721 aa  86.7  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  22.52 
 
 
375 aa  84.3  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  24.21 
 
 
330 aa  84.3  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  26.77 
 
 
593 aa  84  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0622  NMT1/THI5 like domain protein  26.46 
 
 
338 aa  84  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6283  NMT1/THI5 like domain protein  28.22 
 
 
381 aa  83.6  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  27.84 
 
 
778 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3755  twin-arginine translocation pathway signal  26.37 
 
 
344 aa  82.4  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.33 
 
 
1238 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0893  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.07 
 
 
346 aa  81.6  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  25 
 
 
674 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  24.7 
 
 
1065 aa  80.1  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0644  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.1 
 
 
333 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5087  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.17 
 
 
342 aa  79.7  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4546  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.1 
 
 
333 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0574771  normal  0.650232 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0638  ABC transporter, substrate-binding protein  26.1 
 
 
333 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0638  ABC transporter, substrate-binding protein  26.1 
 
 
333 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0785  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.1 
 
 
333 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299641  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0798  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  26.1 
 
 
333 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0615  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.79 
 
 
333 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0805  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.1 
 
 
333 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5096200000000002e-46 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1920  diguanylate cyclase  28.47 
 
 
893 aa  79.3  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0694  ABC transporter substrate-binding protein  26.1 
 
 
333 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0728  ABC transporter substrate-binding protein  26.1 
 
 
333 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.245129  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0882  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.79 
 
 
333 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1173  NMT1/THI5 like domain protein  27.59 
 
 
335 aa  78.2  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0956705  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  23.31 
 
 
856 aa  77  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3812  NMT1/THI5 like domain protein  25.53 
 
 
365 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4758  NMT1/THI5 like domain protein  24.46 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0363  putative sulfonate/nitrate/taurine transport system substrate-binding protein  30.32 
 
 
317 aa  73.9  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3110  twin-arginine translocation pathway signal  27.37 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  28.76 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5201  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.72 
 
 
345 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2573  NMT1/THI5 like domain protein  24.65 
 
 
385 aa  70.9  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.946083 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2052  NMT1/THI5 like domain protein  27.44 
 
 
340 aa  70.5  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.0508257 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2702  diguanylate cyclase  22.18 
 
 
794 aa  70.1  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564678  normal  0.658888 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0471  NMT1/THI5 like domain protein  23.64 
 
 
380 aa  70.1  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2733  NMT1/THI5 like domain protein  23.36 
 
 
349 aa  69.7  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.546218  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0706  putative secreted protein  22.81 
 
 
345 aa  69.7  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1730  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.62 
 
 
329 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.524252  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0619  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  25.11 
 
 
336 aa  68.6  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1821  diguanylate cyclase  24.82 
 
 
821 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3456  hypothetical protein  22.89 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  26.89 
 
 
336 aa  67.8  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0570  perplasmic binding protein of ABC transporter  24.82 
 
 
374 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.288854  normal  0.233067 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2699  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.2 
 
 
335 aa  67  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.428468  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1084  NMT1/THI5 like domain protein  25.62 
 
 
334 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00229881  normal  0.0195344 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  24.38 
 
 
360 aa  66.6  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1138  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.91 
 
 
345 aa  66.6  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.847412  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2049  NMT1/THI5 like domain protein  25.21 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0260  perplasmic binding protein of ABC transporter  24.28 
 
 
373 aa  66.2  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1262  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.62 
 
 
326 aa  65.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal  0.0156923 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1861  NMT1/THI5 like domain protein  24.52 
 
 
339 aa  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2034  NMT1/THI5 like domain protein  24.82 
 
 
347 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.599976  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3461  ABC transporter substrate binding protein (nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate)  25.21 
 
 
330 aa  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2373  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.37 
 
 
330 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.163906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4256  NMT1/THI5 like domain protein  25.08 
 
 
351 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0797632  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.37 
 
 
342 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  25.27 
 
 
342 aa  64.7  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4663  NMT1/THI5 like domain protein  26.73 
 
 
338 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.679325 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1882  NMT1/THI5 like domain-containing protein  27.34 
 
 
361 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.4783 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1152  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.56 
 
 
340 aa  65.1  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3549  ABC transporter substrate-binding protein  24.26 
 
 
339 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1678  NMT1/THI5 like domain protein  25.81 
 
 
338 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00877169  normal  0.68258 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24150  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  24.15 
 
 
382 aa  64.3  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481096  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2098  NMT1/THI5 like domain protein  24.7 
 
 
359 aa  63.9  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3959  NMT1/THI5 like domain protein  26.58 
 
 
344 aa  63.9  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2047  hypothetical protein  25.29 
 
 
326 aa  63.5  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0745441  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1093  twin-arginine translocation pathway signal  26.3 
 
 
346 aa  63.5  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0179  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  25.21 
 
 
326 aa  63.5  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.907617  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1812  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  25.21 
 
 
326 aa  63.5  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.661868  normal  0.196706 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1466  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.71 
 
 
326 aa  63.2  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0280  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.16 
 
 
322 aa  62.8  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3043  NMT1/THI5 like domain protein  22.67 
 
 
323 aa  62.8  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0121  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  27.05 
 
 
356 aa  62  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1642  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  28.46 
 
 
335 aa  62.4  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456194  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7482  ABC transporter periplasmic-binding protein  24 
 
 
329 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061073  normal  0.0687655 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6053  NMT1/THI5 like domain protein  27.27 
 
 
323 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184042  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2388  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.45 
 
 
348 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3298  NMT1/THI5 like domain protein  22.22 
 
 
323 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1097  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.41 
 
 
362 aa  60.8  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.93236 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2868  NMT1/THI5 like domain protein  23.49 
 
 
364 aa  60.8  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.51119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>