167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7482 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7482  ABC transporter periplasmic-binding protein  100 
 
 		 329 aa  676    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061073  normal  0.0687655 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0471  NMT1/THI5 like domain protein  78.78 
 
 		 380 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0260  perplasmic binding protein of ABC transporter  76.21 
 
 		 373 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0425  perplasmic binding protein of ABC transporter  77.44 
 
 		 341 aa  514  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0570  perplasmic binding protein of ABC transporter  75.56 
 
 		 374 aa  507  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.288854  normal  0.233067 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0331  perplasmic binding protein of ABC transporter  75.61 
 
 		 344 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.18125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0570  ABC transporter periplasmic-binding protein  73.03 
 
 		 339 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1089  NMT1/THI5-like domain-containing protein  61.17 
 
 		 352 aa  421  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1162  NMT1/THI5 like domain protein  57.7 
 
 		 344 aa  409  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.139454 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3549  ABC transporter substrate-binding protein  55.59 
 
 		 339 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1678  NMT1/THI5 like domain protein  57.19 
 
 		 338 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00877169  normal  0.68258 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4663  NMT1/THI5 like domain protein  55.99 
 
 		 338 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.679325 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1384  permease protein of ABC transporter  53.54 
 
 		 333 aa  371  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.178302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3143  perplasmic binding protein of ABC transporter  55.31 
 
 		 351 aa  356  2.9999999999999997e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.786011  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5136  NMT1/THI5 like domain protein  54.02 
 
 		 342 aa  344  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3687  ABC transporter substrate-binding protein  53.25 
 
 		 351 aa  341  9e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1471  permease protein of ABC transporter  51.38 
 
 		 332 aa  339  5e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0706  putative secreted protein  50.82 
 
 		 345 aa  330  2e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0893  NMT1/THI5-like domain-containing protein  46.67 
 
 		 346 aa  310  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3874  NMT1/THI5-like domain-containing protein  44.85 
 
 		 336 aa  297  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2012  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  46.2 
 
 		 343 aa  271  9e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0834  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  41.14 
 
 		 336 aa  270  4e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.576945  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4758  NMT1/THI5 like domain protein  44.33 
 
 		 328 aa  266  4e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0799  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  40.58 
 
 		 336 aa  255  7e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3213  ABC transporter, periplasmic binding component-related protein  43.81 
 
 		 342 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.357764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2591  NMT1/THI5-like domain-containing protein  42.53 
 
 		 337 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.329095 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1717  NMT1/THI5-like domain-containing protein  39.33 
 
 		 322 aa  237  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2036  NMT1/THI5 like domain protein  39.33 
 
 		 322 aa  235  6e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.756885 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1097  NMT1/THI5 like domain protein  39 
 
 		 322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0236053  normal  0.472572 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1262  NMT1/THI5-like domain-containing protein  38.26 
 
 		 326 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal  0.0156923 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1093  NMT1/THI5 like domain protein  40.07 
 
 		 328 aa  225  7e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000718314  normal  0.110975 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2040  NMT1/THI5 like domain protein  39.94 
 
 		 328 aa  222  6e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1265  ABC transporter periplasmic-binding protein  38.49 
 
 		 314 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1721  NMT1/THI5-like domain-containing protein  39.6 
 
 		 328 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal  0.736062 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3563  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.92 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.087558  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2868  NMT1/THI5 like domain protein  31.29 
 
 		 364 aa  140  3.9999999999999997e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.51119  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2034  NMT1/THI5 like domain protein  28.47 
 
 		 347 aa  123  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.599976  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 		 915 aa  93.6  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.7 
 
 		 344 aa  90.9  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  28.99 
 
 		 674 aa  90.1  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  25.51 
 
 		 375 aa  90.1  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.07 
 
 		 1004 aa  89.7  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5087  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.69 
 
 		 342 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.32 
 
 		 1075 aa  87.4  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  24.72 
 
 		 721 aa  86.3  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2979  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.33 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.49 
 
 		 1004 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  23.72 
 
 		 856 aa  82.4  0.000000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5201  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.09 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  23.86 
 
 		 686 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  23.03 
 
 		 1065 aa  80.1  0.00000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3456  hypothetical protein  30.42 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2702  diguanylate cyclase  23.23 
 
 		 794 aa  78.6  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564678  normal  0.658888 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  25.7 
 
 		 775 aa  76.6  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2758  NMT1/THI5 like domain protein  25.36 
 
 		 354 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512132  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1173  NMT1/THI5 like domain protein  25.64 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0956705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3032  twin-arginine translocation pathway signal  26.69 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000338526  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1821  diguanylate cyclase  26.39 
 
 		 821 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  22.5 
 
 		 593 aa  70.1  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  24.36 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  24.46 
 
 		 340 aa  69.3  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  21.36 
 
 		 1238 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4165  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.21 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0994431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5692  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.22 
 
 		 360 aa  65.9  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  20.39 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1374  NMT1/THI5 like domain protein  28.98 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.353892  normal  0.853253 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3298  NMT1/THI5 like domain protein  26.53 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1730  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.87 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.524252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  25.57 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0306  twin-arginine translocation pathway signal  23.24 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0667  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.89 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17290  hypothetical protein  27.72 
 
 		 393 aa  62.8  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.047766  normal  0.203711 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6030  putative ABC transporter, substrate binding protein  28.4 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2373  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.57 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.163906 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  28.28 
 
 		 336 aa  62  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  21.4 
 
 		 778 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3143  hypothetical protein  24.81 
 
 		 383 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.60988  normal  0.0276228 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3043  NMT1/THI5 like domain protein  27.31 
 
 		 323 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1528  ABC transporter substrate-binding protein  22.83 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2049  NMT1/THI5 like domain protein  27.78 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7652  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  25.49 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2024  NMT1/THI5 like domain protein  24.6 
 
 		 344 aa  60.8  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2699  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.4 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.428468  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0622  NMT1/THI5 like domain protein  23.33 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3812  NMT1/THI5 like domain protein  24.05 
 
 		 365 aa  60.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1302  NMT1/THI5 like domain protein  22.26 
 
 		 364 aa  60.8  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0447941  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2065  NMT1/THI5 like domain protein  28.06 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411496  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  21.88 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3461  ABC transporter substrate binding protein (nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate)  26.83 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0619  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  26.29 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0436  NMT1/THI5 like protein  24.92 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0670  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  25.76 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0451  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.92 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1084  NMT1/THI5 like domain protein  27.43 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00229881  normal  0.0195344 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3204  membrane lipoprotein lipid attachment site  22.29 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0443411  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.53 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0815  NMT1/THI5 like domain protein  27.04 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1861  NMT1/THI5 like domain protein  24.12 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2047  hypothetical protein  27.57 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0745441  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2101  NMT1/THI5 like domain protein  23.64 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>