39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_17290 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_17290  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  786    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.047766  normal  0.203711 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3787  hypothetical protein  57.87 
 
 		 392 aa  454  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.036851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2282  hypothetical protein  44.38 
 
 		 394 aa  306  3e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.212652 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0260  hypothetical protein  42.45 
 
 		 392 aa  305  7e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3143  hypothetical protein  42.53 
 
 		 383 aa  295  7e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.60988  normal  0.0276228 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3625  hypothetical protein  39.05 
 
 		 379 aa  261  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3892  hypothetical protein  36.9 
 
 		 415 aa  219  7e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.361535  normal  0.109076 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1162  NMT1/THI5 like domain protein  26.7 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.139454 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1384  permease protein of ABC transporter  25.64 
 
 		 333 aa  65.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.178302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4758  NMT1/THI5 like domain protein  25.81 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1471  permease protein of ABC transporter  25.57 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7482  ABC transporter periplasmic-binding protein  27.72 
 
 		 329 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061073  normal  0.0687655 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4663  NMT1/THI5 like domain protein  25.08 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.679325 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0570  perplasmic binding protein of ABC transporter  25.37 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.288854  normal  0.233067 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0260  perplasmic binding protein of ABC transporter  25.37 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0570  ABC transporter periplasmic-binding protein  27.06 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2868  NMT1/THI5 like domain protein  24.02 
 
 		 364 aa  59.7  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.51119  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1089  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.72 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5136  NMT1/THI5 like domain protein  24.2 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0471  NMT1/THI5 like domain protein  25.22 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3549  ABC transporter substrate-binding protein  24.59 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3143  perplasmic binding protein of ABC transporter  24.2 
 
 		 351 aa  55.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.786011  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2040  NMT1/THI5 like domain protein  24.05 
 
 		 328 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3874  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.17 
 
 		 336 aa  54.3  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0425  perplasmic binding protein of ABC transporter  25.68 
 
 		 341 aa  53.9  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0893  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.15 
 
 		 346 aa  53.9  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0706  putative secreted protein  22.15 
 
 		 345 aa  53.5  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1678  NMT1/THI5 like domain protein  23.45 
 
 		 338 aa  53.5  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00877169  normal  0.68258 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1093  NMT1/THI5 like domain protein  23.18 
 
 		 328 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000718314  normal  0.110975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1721  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.19 
 
 		 328 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal  0.736062 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3687  ABC transporter substrate-binding protein  24.52 
 
 		 351 aa  50.4  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0331  perplasmic binding protein of ABC transporter  25.6 
 
 		 344 aa  50.4  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.18125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1262  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.33 
 
 		 326 aa  50.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal  0.0156923 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2034  NMT1/THI5 like domain protein  24.9 
 
 		 347 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.599976  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0799  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.08 
 
 		 336 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1265  ABC transporter periplasmic-binding protein  24.6 
 
 		 314 aa  47.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3213  ABC transporter, periplasmic binding component-related protein  25.59 
 
 		 342 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.357764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2012  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.48 
 
 		 343 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  23.37 
 
 		 721 aa  44.3  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>