25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3892 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3892  hypothetical protein  100 
 
 		 415 aa  835    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.361535  normal  0.109076 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3625  hypothetical protein  56.2 
 
 		 379 aa  421  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3143  hypothetical protein  40.75 
 
 		 383 aa  251  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.60988  normal  0.0276228 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2282  hypothetical protein  39.68 
 
 		 394 aa  250  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.212652 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3787  hypothetical protein  38.32 
 
 		 392 aa  241  2e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.036851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17290  hypothetical protein  37.15 
 
 		 393 aa  233  5e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.047766  normal  0.203711 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0260  hypothetical protein  37.81 
 
 		 392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4758  NMT1/THI5 like domain protein  24.65 
 
 		 328 aa  62  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1262  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.72 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal  0.0156923 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1093  NMT1/THI5 like domain protein  25.58 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000718314  normal  0.110975 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2040  NMT1/THI5 like domain protein  24.5 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1721  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.5 
 
 		 328 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal  0.736062 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5136  NMT1/THI5 like domain protein  22.71 
 
 		 342 aa  54.7  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0706  putative secreted protein  24.64 
 
 		 345 aa  54.3  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1162  NMT1/THI5 like domain protein  22.35 
 
 		 344 aa  53.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.139454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1265  ABC transporter periplasmic-binding protein  24.71 
 
 		 314 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2591  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.9 
 
 		 337 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.329095 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3213  ABC transporter, periplasmic binding component-related protein  25.98 
 
 		 342 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.357764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3143  perplasmic binding protein of ABC transporter  21.51 
 
 		 351 aa  49.7  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.786011  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0893  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.15 
 
 		 346 aa  49.3  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2012  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.09 
 
 		 343 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3687  ABC transporter substrate-binding protein  21.01 
 
 		 351 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3874  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.44 
 
 		 336 aa  44.3  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1089  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.34 
 
 		 352 aa  43.9  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0570  perplasmic binding protein of ABC transporter  21.24 
 
 		 374 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.288854  normal  0.233067 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>