203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2591 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_2591  NMT1/THI5-like domain-containing protein  100 
 
 
337 aa  687    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.329095 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3213  ABC transporter, periplasmic binding component-related protein  83.82 
 
 
342 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.357764  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2012  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  62.66 
 
 
343 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452501  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1093  NMT1/THI5 like domain protein  55.99 
 
 
328 aa  358  5e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000718314  normal  0.110975 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2040  NMT1/THI5 like domain protein  52.91 
 
 
328 aa  349  4e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1265  ABC transporter periplasmic-binding protein  54.46 
 
 
314 aa  347  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1721  NMT1/THI5-like domain-containing protein  55.08 
 
 
328 aa  344  1e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal  0.736062 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4758  NMT1/THI5 like domain protein  50.33 
 
 
328 aa  310  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0706  putative secreted protein  43.31 
 
 
345 aa  275  8e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3549  ABC transporter substrate-binding protein  43.14 
 
 
339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7482  ABC transporter periplasmic-binding protein  42.53 
 
 
329 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061073  normal  0.0687655 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0471  NMT1/THI5 like domain protein  42.21 
 
 
380 aa  248  9e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0893  NMT1/THI5-like domain-containing protein  43.65 
 
 
346 aa  246  4e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0570  perplasmic binding protein of ABC transporter  42.39 
 
 
374 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.288854  normal  0.233067 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1678  NMT1/THI5 like domain protein  42.67 
 
 
338 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00877169  normal  0.68258 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4663  NMT1/THI5 like domain protein  43 
 
 
338 aa  241  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.679325 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1089  NMT1/THI5-like domain-containing protein  42.9 
 
 
352 aa  240  2.9999999999999997e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0425  perplasmic binding protein of ABC transporter  42.77 
 
 
341 aa  237  3e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0260  perplasmic binding protein of ABC transporter  41.56 
 
 
373 aa  235  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0331  perplasmic binding protein of ABC transporter  41.35 
 
 
344 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.18125  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1384  permease protein of ABC transporter  41.32 
 
 
333 aa  229  5e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.178302  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3874  NMT1/THI5-like domain-containing protein  41.9 
 
 
336 aa  229  5e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3687  ABC transporter substrate-binding protein  44.04 
 
 
351 aa  225  8e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0834  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  42.27 
 
 
336 aa  224  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.576945  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1162  NMT1/THI5 like domain protein  39.45 
 
 
344 aa  218  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.139454 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0799  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.22 
 
 
336 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3143  perplasmic binding protein of ABC transporter  41.2 
 
 
351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.786011  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1471  permease protein of ABC transporter  41 
 
 
332 aa  211  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0570  ABC transporter periplasmic-binding protein  41.41 
 
 
339 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262601  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5136  NMT1/THI5 like domain protein  39.35 
 
 
342 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1262  NMT1/THI5-like domain-containing protein  34.95 
 
 
326 aa  185  9e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal  0.0156923 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1717  NMT1/THI5-like domain-containing protein  37.21 
 
 
322 aa  179  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1097  NMT1/THI5 like domain protein  36.88 
 
 
322 aa  176  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0236053  normal  0.472572 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2036  NMT1/THI5 like domain protein  36.54 
 
 
322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.756885 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2868  NMT1/THI5 like domain protein  35.02 
 
 
364 aa  165  8e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.51119  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3563  NMT1/THI5-like domain-containing protein  34.11 
 
 
322 aa  145  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.087558  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2034  NMT1/THI5 like domain protein  30.77 
 
 
347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.599976  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.79 
 
 
1075 aa  120  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5087  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.84 
 
 
342 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2373  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.41 
 
 
330 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.163906 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.92 
 
 
1238 aa  100  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3298  NMT1/THI5 like domain protein  30.11 
 
 
323 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_004310  BR0213  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  26.6 
 
 
322 aa  92.8  8e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0179  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  30.74 
 
 
326 aa  90.1  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.907617  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1812  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  30.74 
 
 
326 aa  90.1  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.661868  normal  0.196706 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5201  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.84 
 
 
345 aa  90.1  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 
915 aa  89.4  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6030  putative ABC transporter, substrate binding protein  29.55 
 
 
329 aa  88.6  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0204  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.28 
 
 
322 aa  88.6  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3461  ABC transporter substrate binding protein (nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate)  31.44 
 
 
330 aa  89  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2047  hypothetical protein  29.46 
 
 
326 aa  87.8  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0745441  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  25.46 
 
 
593 aa  88.2  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3043  NMT1/THI5 like domain protein  29.51 
 
 
323 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1374  NMT1/THI5 like domain protein  30.83 
 
 
329 aa  85.9  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.353892  normal  0.853253 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.22 
 
 
344 aa  85.9  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0280  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.16 
 
 
322 aa  85.1  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0343  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.49 
 
 
332 aa  85.9  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.010021  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2979  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.76 
 
 
323 aa  85.5  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1730  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.57 
 
 
329 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.524252  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  26.21 
 
 
336 aa  83.6  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  27.56 
 
 
686 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  26.9 
 
 
674 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  25.61 
 
 
375 aa  82.4  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3456  hypothetical protein  28.51 
 
 
336 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3032  twin-arginine translocation pathway signal  24.56 
 
 
348 aa  81.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000338526  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2101  NMT1/THI5 like domain protein  24.62 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1466  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  27.85 
 
 
326 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2049  NMT1/THI5 like domain protein  28.1 
 
 
334 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1084  NMT1/THI5 like domain protein  27.98 
 
 
334 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00229881  normal  0.0195344 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2758  NMT1/THI5 like domain protein  24.89 
 
 
354 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512132  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2699  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.59 
 
 
335 aa  77.8  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.428468  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1173  NMT1/THI5 like domain protein  26.91 
 
 
335 aa  77.4  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0956705  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  24.9 
 
 
330 aa  77  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  25.17 
 
 
1065 aa  76.3  0.0000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1528  ABC transporter substrate-binding protein  25.47 
 
 
357 aa  76.3  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2702  diguanylate cyclase  25 
 
 
794 aa  75.1  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564678  normal  0.658888 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  25.99 
 
 
778 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0451  NMT1/THI5-like domain-containing protein  21.93 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0436  NMT1/THI5 like protein  21.93 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  24.21 
 
 
775 aa  73.2  0.000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1493  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.75 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.140791  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  23.69 
 
 
721 aa  72.4  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5692  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.1 
 
 
360 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2052  NMT1/THI5 like domain protein  26.05 
 
 
340 aa  72.4  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.0508257 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  21.15 
 
 
856 aa  71.2  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2297  NMT1/THI5 like domain protein  25.64 
 
 
312 aa  71.2  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2795  NMT1/THI5 like domain protein  25.91 
 
 
357 aa  70.9  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001037 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1437  NMT1/THI5 like domain protein  24.92 
 
 
378 aa  70.9  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.608485 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2205  ABC transporter substrate-binding protein  23.23 
 
 
324 aa  70.5  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.31 
 
 
1004 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2733  NMT1/THI5 like domain protein  25.87 
 
 
349 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.546218  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0036  NlpA lipoprotein  24.58 
 
 
323 aa  68.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1821  diguanylate cyclase  24.79 
 
 
821 aa  68.6  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1920  diguanylate cyclase  24.36 
 
 
893 aa  68.2  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0909  NMT1/THI5 like domain protein  23.76 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0643839  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3667  hypothetical protein  24.64 
 
 
335 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  25.1 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.42 
 
 
1004 aa  67  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3508  twin-arginine translocation pathway signal  24.07 
 
 
342 aa  66.6  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276709  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0925  NMT1/THI5 like domain protein  23 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0676609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>