183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0799 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0799  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  100 
 
 		 336 aa  682    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0706  putative secreted protein  44.74 
 
 		 345 aa  290  3e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0834  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  45.34 
 
 		 336 aa  276  4e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.576945  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0893  NMT1/THI5-like domain-containing protein  44.37 
 
 		 346 aa  270  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2012  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  46.92 
 
 		 343 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0570  perplasmic binding protein of ABC transporter  43.46 
 
 		 374 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.288854  normal  0.233067 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0471  NMT1/THI5 like domain protein  42.48 
 
 		 380 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7482  ABC transporter periplasmic-binding protein  40.37 
 
 		 329 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061073  normal  0.0687655 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1678  NMT1/THI5 like domain protein  42.62 
 
 		 338 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00877169  normal  0.68258 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1089  NMT1/THI5-like domain-containing protein  43.38 
 
 		 352 aa  251  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4663  NMT1/THI5 like domain protein  41.64 
 
 		 338 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.679325 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4758  NMT1/THI5 like domain protein  41.47 
 
 		 328 aa  245  6e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3549  ABC transporter substrate-binding protein  40.78 
 
 		 339 aa  245  6.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1265  ABC transporter periplasmic-binding protein  40.39 
 
 		 314 aa  245  6.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1717  NMT1/THI5-like domain-containing protein  42.42 
 
 		 322 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1162  NMT1/THI5 like domain protein  41.59 
 
 		 344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.139454 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1097  NMT1/THI5 like domain protein  42.86 
 
 		 322 aa  243  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0236053  normal  0.472572 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2036  NMT1/THI5 like domain protein  42.76 
 
 		 322 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.756885 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0425  perplasmic binding protein of ABC transporter  43.45 
 
 		 341 aa  243  5e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0260  perplasmic binding protein of ABC transporter  40.52 
 
 		 373 aa  242  9e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1384  permease protein of ABC transporter  40.37 
 
 		 333 aa  241  9e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.178302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3143  perplasmic binding protein of ABC transporter  41.18 
 
 		 351 aa  239  4e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.786011  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0331  perplasmic binding protein of ABC transporter  43.42 
 
 		 344 aa  238  6.999999999999999e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.18125  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3213  ABC transporter, periplasmic binding component-related protein  43.1 
 
 		 342 aa  238  9e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.357764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0570  ABC transporter periplasmic-binding protein  42.17 
 
 		 339 aa  235  8e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1093  NMT1/THI5 like domain protein  40.67 
 
 		 328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000718314  normal  0.110975 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5136  NMT1/THI5 like domain protein  40.2 
 
 		 342 aa  233  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2040  NMT1/THI5 like domain protein  40.33 
 
 		 328 aa  230  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3687  ABC transporter substrate-binding protein  41.42 
 
 		 351 aa  228  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1721  NMT1/THI5-like domain-containing protein  40 
 
 		 328 aa  226  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal  0.736062 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1262  NMT1/THI5-like domain-containing protein  40.46 
 
 		 326 aa  224  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal  0.0156923 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1471  permease protein of ABC transporter  38.48 
 
 		 332 aa  220  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2591  NMT1/THI5-like domain-containing protein  38.27 
 
 		 337 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.329095 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3874  NMT1/THI5-like domain-containing protein  36.06 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2034  NMT1/THI5 like domain protein  31.49 
 
 		 347 aa  146  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.599976  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2868  NMT1/THI5 like domain protein  29.74 
 
 		 364 aa  140  3.9999999999999997e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.51119  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3563  NMT1/THI5-like domain-containing protein  33.98 
 
 		 322 aa  139  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.087558  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1173  NMT1/THI5 like domain protein  32.67 
 
 		 335 aa  118  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0956705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.8 
 
 		 1075 aa  93.6  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 915 aa  93.2  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  29.55 
 
 		 375 aa  90.5  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.3 
 
 		 1238 aa  87  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3032  twin-arginine translocation pathway signal  27.2 
 
 		 348 aa  86.3  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000338526  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5403  hypothetical protein  27.04 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164568  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.4 
 
 		 336 aa  78.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5087  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.08 
 
 		 342 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.67 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2758  NMT1/THI5 like domain protein  26.24 
 
 		 354 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512132  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  25.36 
 
 		 593 aa  75.5  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3667  hypothetical protein  27.66 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.96 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3117  NMT1/THI5 like domain protein  30.58 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.39 
 
 		 1004 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5201  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.86 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2702  diguanylate cyclase  23.99 
 
 		 794 aa  73.2  0.000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564678  normal  0.658888 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2388  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.29 
 
 		 348 aa  72.8  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  28.01 
 
 		 686 aa  72.4  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1821  diguanylate cyclase  26.27 
 
 		 821 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3204  membrane lipoprotein lipid attachment site  23.72 
 
 		 336 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0443411  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  26.07 
 
 		 775 aa  70.5  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  26.06 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0436  NMT1/THI5 like protein  24.62 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0451  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.62 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  26.1 
 
 		 721 aa  69.7  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1222  NMT1/THI5 like domain protein  25.73 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4359  twin-arginine translocation pathway signal  28.51 
 
 		 331 aa  69.3  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  26.32 
 
 		 328 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.55 
 
 		 342 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1941  NMT1/THI5 like domain protein  26.15 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.876036  hitchhiker  0.000270678 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2979  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.67 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1920  diguanylate cyclase  26.17 
 
 		 893 aa  66.6  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1642  NMT1/THI5 like domain protein  28.26 
 
 		 338 aa  65.9  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377547  normal  0.604576 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3878  membrane lipoprotein lipid attachment site  27.63 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2762  membrane lipoprotein lipid attachment site  25.99 
 
 		 347 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0667  NMT1/THI5-like domain-containing protein  30.42 
 
 		 329 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  26.34 
 
 		 336 aa  65.9  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  24.14 
 
 		 778 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  21.37 
 
 		 856 aa  65.1  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  25.76 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1486  NMT1/THI5 like domain protein  29.53 
 
 		 355 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0306  twin-arginine translocation pathway signal  25.08 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1730  NMT1/THI5-like domain-containing protein  33.58 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.524252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  23.97 
 
 		 674 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.12 
 
 		 1004 aa  63.5  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2065  NMT1/THI5 like domain protein  22.26 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411496  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0815  NMT1/THI5 like domain protein  25.08 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1084  NMT1/THI5 like domain protein  33.08 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00229881  normal  0.0195344 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0670  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  27.05 
 
 		 328 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2049  NMT1/THI5 like domain protein  33.08 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3456  hypothetical protein  25.42 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0213  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  27.03 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0368  ABC transporter substrate-binding protein  23.57 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0358  ABC transporter, substrate-binding protein  23.57 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0355  ABC transporter, substrate-binding protein  23.57 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0382  ABC transporter substrate-binding protein  23.57 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0425  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.57 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0494  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.57 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4165  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.48 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0994431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0204  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.03 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3461  ABC transporter substrate binding protein (nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate)  25.93 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>