More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5981 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5981  ABC transporter substrate-binding protein  100 
 
 
311 aa  630  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.409896 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0105  NMT1/THI5 like domain protein  44.79 
 
 
314 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.318497  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0383  NlpA lipoprotein  45.64 
 
 
312 aa  245  6e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391974  normal  0.191867 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3542  NLPA lipoprotein  29.65 
 
 
313 aa  135  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5419  NMT1/THI5 like domain protein  28.81 
 
 
345 aa  86.7  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2477  NMT1/THI5 like domain protein  24.38 
 
 
331 aa  82  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5441  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.34 
 
 
329 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.558403 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5731  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.34 
 
 
329 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5352  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.34 
 
 
329 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0288  NMT1/THI5 like domain protein  29.55 
 
 
327 aa  77.8  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133462  hitchhiker  0.0000957197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1820  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.25 
 
 
327 aa  77  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1743  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  28.41 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00139756  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4669  NMT1/THI5 like domain protein  25 
 
 
335 aa  72.8  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1814  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.42 
 
 
322 aa  72.8  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.641284  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0465  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25.53 
 
 
347 aa  68.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.176308  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3147  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.48 
 
 
344 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3083  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  31.36 
 
 
328 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261971  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2330  NMT1/THI5 like domain-containing protein  24.55 
 
 
314 aa  66.2  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  24.05 
 
 
297 aa  66.2  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3062  putative lipoprotein  24.72 
 
 
340 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188548  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3060  lipoprotein, putative  24.34 
 
 
340 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4470  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  24.66 
 
 
437 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.214365 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34300  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  25.48 
 
 
319 aa  64.3  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2789  NLPA lipoprotein  24.7 
 
 
360 aa  64.3  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6461  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  25.17 
 
 
437 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325074 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1901  NMT1/THI5 like domain protein  25.65 
 
 
353 aa  63.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0056  NO3-/NO2-ABC transporter  23.55 
 
 
405 aa  63.2  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2750  sulfonate/taurine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  23.97 
 
 
340 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0292  ABC transporter nitrate-binding protein  26.54 
 
 
451 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1934  NLPA lipoprotein  26.98 
 
 
329 aa  60.1  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1836  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transport systems, periplasmic component  28.07 
 
 
340 aa  60.1  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0097  NLPA lipoprotein  26.14 
 
 
328 aa  59.3  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2107  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  24.17 
 
 
529 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.287431  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3279  hypothetical protein  25.94 
 
 
332 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000646762  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5319  taurine ABC transporter, periplasmic taurine-binding protein  28.45 
 
 
325 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2206  putative nitrate transporter component, NrtA  20.5 
 
 
457 aa  57.4  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3081  NMT1/THI5 like domain protein  25.27 
 
 
326 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5799  twin-arginine translocation pathway signal  24.58 
 
 
349 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1430  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28 
 
 
314 aa  56.2  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  25.29 
 
 
668 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2673  putative ABC transporter, substrate binding protein  26.92 
 
 
326 aa  55.8  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416834  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5897  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  32.17 
 
 
432 aa  55.8  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.260088  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3846  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  27.68 
 
 
337 aa  55.8  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2172  putative nitrate transporter component, nrtA  22.14 
 
 
460 aa  55.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.210639  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3487  putative nitrate transporter component, nrtA  24.3 
 
 
464 aa  55.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2960  sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein, putative  25.21 
 
 
328 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.641077  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  23.58 
 
 
669 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5002  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  28.26 
 
 
347 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016963  normal  0.417754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9276  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  24.71 
 
 
355 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3812  NMT1/THI5 like domain protein  30.97 
 
 
365 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0406  NMT1/THI5 like domain protein  25.98 
 
 
334 aa  54.3  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0260  extracellular solute-binding protein  22.36 
 
 
331 aa  54.7  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.388479  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  25.46 
 
 
333 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4555  NMT1/THI5 like domain protein  23.43 
 
 
337 aa  54.3  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2969  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  25.77 
 
 
321 aa  54.3  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.381415  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7163  taurine ABC transporter periplasmic binding protein  26.56 
 
 
336 aa  54.3  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4888  NMT1/THI5 like domain protein  25.68 
 
 
343 aa  53.9  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6227  ABC taurine transporter, periplasmic ligand binding protein  27.01 
 
 
338 aa  53.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4058  twin-arginine translocation pathway signal  28.09 
 
 
329 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2778  NMT1/THI5 like domain protein  28.87 
 
 
325 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1134  NMT1/THI5 like domain protein  21.46 
 
 
365 aa  53.1  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4209  ABC taurine transporter, periplasmic ligand binding protein  25.24 
 
 
340 aa  53.5  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.494827 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1573  extracellular solute-binding protein  25.72 
 
 
326 aa  53.5  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.817202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2641  alkanesulfonates-binding protein  25.62 
 
 
328 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.245447  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  23.17 
 
 
657 aa  52.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2271  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  27.01 
 
 
338 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2886  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  27.01 
 
 
338 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2620  NMT1/THI5 like domain protein  25.88 
 
 
328 aa  52.8  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.985405  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2896  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  27.01 
 
 
338 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.814597 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2272  nitrate transporter periplasmic component  23.64 
 
 
423 aa  52.8  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1573  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  25.21 
 
 
325 aa  52.8  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0964  putative nitrate transporter component  21.71 
 
 
486 aa  52.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.511943 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0449  NMT1/THI5 like domain protein  24.42 
 
 
327 aa  52.4  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0997  ABC transporter nitrate-binding protein  23.05 
 
 
457 aa  52  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2885  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  25.93 
 
 
354 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2504  nitrate-binding protein nrtA precursor, periplasmic  28.14 
 
 
450 aa  52.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0087  ABC taurine transporter, periplasmic ligand binding protein  26.79 
 
 
340 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.191531  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4396  nitrate transport protein  21.72 
 
 
444 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1920  NMT1/THI5 like domain protein  23.77 
 
 
344 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7250  putative ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components  24.48 
 
 
338 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal  0.156946 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4888  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  24.75 
 
 
339 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108184  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2336  NO3-/NO2-ABC transporter  24.06 
 
 
407 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4459  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  21.72 
 
 
444 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.714854  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1144  NMT1/THI5 like domain protein  22.47 
 
 
357 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.144377  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1760  twin-arginine translocation pathway signal  23.49 
 
 
434 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3972  ABC transporter nitrate-binding protein  24.12 
 
 
471 aa  51.2  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  27.72 
 
 
375 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0419  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  26.44 
 
 
338 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.402679 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4676  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  23.33 
 
 
673 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4496  twin-arginine translocation pathway signal  22.66 
 
 
430 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4818  ABC transporter nitrate-binding protein  23.13 
 
 
456 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191179  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2720  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 
325 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1025  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  25.37 
 
 
667 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.129474 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4678  ABC-type bicarbonate transport system substrate-binding protein  24.62 
 
 
452 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1239  ABC-type nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein  22.71 
 
 
443 aa  50.8  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2283  NLPA lipoprotein  24.66 
 
 
341 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000054697  unclonable  0.00000000025197 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2205  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  21.38 
 
 
332 aa  50.8  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142056  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4959  twin-arginine translocation pathway signal  22.66 
 
 
430 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12920  taurine ABC transporter periplasmic protein  26.89 
 
 
337 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.472759  normal  0.43236 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0619  NMT1/THI5 like domain protein  27.4 
 
 
339 aa  50.4  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>