More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2107 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2107  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  100 
 
 		 529 aa  1095    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.287431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2054  twin-arginine translocation pathway signal  52.5 
 
 		 462 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2403  ABC transporter nitrate-binding protein  52.37 
 
 		 462 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0310148  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0964  putative nitrate transporter component  48.62 
 
 		 486 aa  403  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.511943 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2589  putative nitrate transporter component  42.91 
 
 		 475 aa  402  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200575 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4818  ABC transporter nitrate-binding protein  54.29 
 
 		 456 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191179  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0997  ABC transporter nitrate-binding protein  44.23 
 
 		 457 aa  397  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5415  putative nitrate ABC transporter (substrate-binding protein) (ntrA-like protein)  45.78 
 
 		 461 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.411292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0292  ABC transporter nitrate-binding protein  49.25 
 
 		 451 aa  394  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2206  putative nitrate transporter component, NrtA  48.38 
 
 		 457 aa  387  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3487  putative nitrate transporter component, nrtA  48.74 
 
 		 464 aa  389  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3742  twin-arginine translocation pathway signal  49.74 
 
 		 467 aa  384  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4663  ABC transporter nitrate-binding protein  52.19 
 
 		 453 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.807584 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1148  ABC transporter nitrate-binding protein  47.75 
 
 		 453 aa  375  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294193  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3972  ABC transporter nitrate-binding protein  48.37 
 
 		 471 aa  375  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1307  ABC transporter nitrate-binding protein  47.75 
 
 		 453 aa  375  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.870256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2617  ABC transporter nitrate-binding protein  51.38 
 
 		 454 aa  371  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0708468 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2172  putative nitrate transporter component, nrtA  43.43 
 
 		 460 aa  353  4e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.210639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3774  putative nitrate transporter component, NrtA  40.51 
 
 		 454 aa  329  6e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.944319  normal  0.102556 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1703  nitrate transporter  35.43 
 
 		 467 aa  232  1e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0589  nitrate transporter, putative  34.15 
 
 		 432 aa  202  9e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.57136  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1025  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  34.38 
 
 		 667 aa  201  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.129474 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4373  nitrate transport protein, NrtC like protein  29.62 
 
 		 461 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5012  twin-arginine translocation pathway signal  32.02 
 
 		 430 aa  200  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0327  nitrate transporter periplasmic component  33.16 
 
 		 433 aa  200  6e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  32.53 
 
 		 668 aa  200  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3743  twin-arginine translocation pathway signal  33.18 
 
 		 431 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869277  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4435  nitrate transporter, putative  29.84 
 
 		 461 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.210676 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3843  NO3-/NO2-ABC transporter  30.7 
 
 		 417 aa  197  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0830  twin-arginine translocation pathway signal  30.34 
 
 		 425 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  33.33 
 
 		 669 aa  196  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  33.25 
 
 		 657 aa  196  8.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4496  twin-arginine translocation pathway signal  31.95 
 
 		 430 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6461  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  30.79 
 
 		 437 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325074 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5897  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  32.91 
 
 		 432 aa  196  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.260088  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0237  putative nitrate transporter protein  34.91 
 
 		 426 aa  196  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4959  twin-arginine translocation pathway signal  32.11 
 
 		 430 aa  196  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1760  twin-arginine translocation pathway signal  30.69 
 
 		 434 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0258  putative nitrate transporter protein  34.91 
 
 		 426 aa  196  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.753989 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4396  nitrate transport protein  32.4 
 
 		 444 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4459  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  32.4 
 
 		 444 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.714854  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2497  nitrate-binding proteint  32.41 
 
 		 418 aa  192  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.722347  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0056  NO3-/NO2-ABC transporter  31.25 
 
 		 405 aa  191  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2377  twin-arginine translocation pathway signal  32.39 
 
 		 426 aa  191  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4540  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 440 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4470  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  30.28 
 
 		 437 aa  190  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.214365 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0330  putative nitrate transporter protein  31.58 
 
 		 437 aa  188  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2817  ABC transporter nitrate-binding protein (nrtA)  31.95 
 
 		 438 aa  188  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0277  putative nitrate transporter protein  31.58 
 
 		 434 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2554  twin-arginine translocation pathway signal  30.79 
 
 		 414 aa  187  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3521  bicarbonate transport system substrate-binding protein  30.5 
 
 		 457 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2831  twin-arginine translocation pathway signal  30.59 
 
 		 414 aa  186  7e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1968  nitrate transport protein, NrtC like protein  31.15 
 
 		 444 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2596  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  30.5 
 
 		 457 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2909  nitrate-binding proteint  31.92 
 
 		 419 aa  186  7e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2320  twin-arginine translocation pathway signal  30.59 
 
 		 414 aa  186  8e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2272  nitrate transporter periplasmic component  34.49 
 
 		 423 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1490  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  31.51 
 
 		 663 aa  186  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.810592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0665  nitrate-binding protein NrtA precursor, periplasmic  30.82 
 
 		 475 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0120522  decreased coverage  0.00176089 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2336  NO3-/NO2-ABC transporter  31.43 
 
 		 407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1414  twin-arginine translocation pathway signal  29.83 
 
 		 414 aa  185  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.922981 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4457  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  32.03 
 
 		 668 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0999  ABC transporter periplasmic protein  32.21 
 
 		 431 aa  184  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4394  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  32.03 
 
 		 668 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0381  putative nitrate transporter protein  31.37 
 
 		 420 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.492425 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3522  twin-arginine translocation pathway signal  31.36 
 
 		 414 aa  184  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3267  twin-arginine translocation pathway signal  29.05 
 
 		 414 aa  183  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1392  NO3-/NO2- ABC transporter  29.14 
 
 		 417 aa  183  8.000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3519  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  31.02 
 
 		 669 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2598  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  31.02 
 
 		 669 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.992008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1541  nitrate-binding proteint  32.2 
 
 		 419 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4676  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  31.03 
 
 		 673 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2504  nitrate-binding protein nrtA precursor, periplasmic  28.34 
 
 		 450 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2325  nitrate-binding proteint  31.39 
 
 		 415 aa  180  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0641  twin-arginine translocation pathway signal  28.11 
 
 		 477 aa  180  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2147  twin-arginine translocation pathway signal  31.76 
 
 		 414 aa  178  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5899  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  33.24 
 
 		 423 aa  178  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3676  twin-arginine translocation pathway signal  29.53 
 
 		 467 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2733  nitrate-binding proteint  31.64 
 
 		 419 aa  177  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3730  nitrate transporter  29.53 
 
 		 467 aa  177  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0457947  normal  0.12705 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2105  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  32.49 
 
 		 427 aa  177  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187135  decreased coverage  0.00370566 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1662  periplasmic binding protein-like II  31.85 
 
 		 392 aa  176  7e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.429682  hitchhiker  0.00361023 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4925  bicarbonate transport system substrate-binding protein  30.89 
 
 		 454 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.794472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4923  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  32.48 
 
 		 668 aa  174  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1438  nitrate-binding proteint  33.44 
 
 		 432 aa  173  7.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.28551  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2958  nitrate transporter  32.7 
 
 		 382 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4572  nitrate transport protein  32 
 
 		 442 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1115  putative nitrate transport protein  30.59 
 
 		 491 aa  171  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3527  nitrate transport protein  32.07 
 
 		 442 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2590  twin-arginine translocation pathway signal  27.21 
 
 		 414 aa  171  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0514763 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1454  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  31.98 
 
 		 425 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4527  putative nitrate transport protein  33.23 
 
 		 435 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05588  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic component  31.03 
 
 		 454 aa  166  6.9999999999999995e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1488  membrane protein  29.69 
 
 		 450 aa  166  9e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.976236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4678  ABC-type bicarbonate transport system substrate-binding protein  28.26 
 
 		 452 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2819  putative nitrate transport protein  28.51 
 
 		 469 aa  166  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.469609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3656  twin-arginine translocation pathway signal  27.03 
 
 		 427 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001607  nitrate ABC transporter nitrate-binding protein  31.3 
 
 		 449 aa  164  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1027  bicarbonate transport system substrate-binding protein  29.36 
 
 		 458 aa  164  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.181538 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0875  twin-arginine translocation pathway signal  27.51 
 
 		 480 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0516063  hitchhiker  0.00230539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>