267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1488 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1488  membrane protein  100 
 
 		 450 aa  923    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.976236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4678  ABC-type bicarbonate transport system substrate-binding protein  61.45 
 
 		 452 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2596  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  58.73 
 
 		 457 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3521  bicarbonate transport system substrate-binding protein  58.52 
 
 		 457 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4925  bicarbonate transport system substrate-binding protein  58.85 
 
 		 454 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.794472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1027  bicarbonate transport system substrate-binding protein  56.8 
 
 		 458 aa  474  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.181538 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4572  nitrate transport protein  46.19 
 
 		 442 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4459  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  44.79 
 
 		 444 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.714854  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4396  nitrate transport protein  44.79 
 
 		 444 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3527  nitrate transport protein  44.64 
 
 		 442 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1239  ABC-type nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein  46.68 
 
 		 443 aa  379  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4959  twin-arginine translocation pathway signal  47.74 
 
 		 430 aa  365  1e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6461  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  43.85 
 
 		 437 aa  365  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325074 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4470  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  45.41 
 
 		 437 aa  363  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.214365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5012  twin-arginine translocation pathway signal  47.24 
 
 		 430 aa  363  4e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4496  twin-arginine translocation pathway signal  47.24 
 
 		 430 aa  362  8e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2817  ABC transporter nitrate-binding protein (nrtA)  45.84 
 
 		 438 aa  359  5e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4540  twin-arginine translocation pathway signal  44.74 
 
 		 440 aa  358  9.999999999999999e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1760  twin-arginine translocation pathway signal  46.85 
 
 		 434 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3743  twin-arginine translocation pathway signal  46.23 
 
 		 431 aa  356  5.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869277  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5897  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  44.03 
 
 		 432 aa  355  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.260088  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2504  nitrate-binding protein nrtA precursor, periplasmic  44 
 
 		 450 aa  342  8e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3656  twin-arginine translocation pathway signal  38.96 
 
 		 427 aa  333  3e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0665  nitrate-binding protein NrtA precursor, periplasmic  40.13 
 
 		 475 aa  324  2e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0120522  decreased coverage  0.00176089 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1703  nitrate transporter  31.86 
 
 		 467 aa  238  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0327  nitrate transporter periplasmic component  32.67 
 
 		 433 aa  227  3e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  33.5 
 
 		 668 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2272  nitrate transporter periplasmic component  32.43 
 
 		 423 aa  218  2e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2325  nitrate-binding proteint  32.66 
 
 		 415 aa  212  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1541  nitrate-binding proteint  31.31 
 
 		 419 aa  209  8e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2733  nitrate-binding proteint  31.01 
 
 		 419 aa  209  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  31.03 
 
 		 669 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2909  nitrate-binding proteint  32.51 
 
 		 419 aa  204  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0056  NO3-/NO2-ABC transporter  28.39 
 
 		 405 aa  202  9.999999999999999e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0830  twin-arginine translocation pathway signal  29.73 
 
 		 425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4676  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  29.1 
 
 		 673 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2598  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  29.51 
 
 		 669 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.992008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4457  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  30 
 
 		 668 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  33 
 
 		 657 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3519  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  29.51 
 
 		 669 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2105  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  31.77 
 
 		 427 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187135  decreased coverage  0.00370566 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4394  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  30 
 
 		 668 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0589  nitrate transporter, putative  31.71 
 
 		 432 aa  199  6e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.57136  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2497  nitrate-binding proteint  29.5 
 
 		 418 aa  196  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.722347  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1025  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  31.41 
 
 		 667 aa  196  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.129474 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4923  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  30.9 
 
 		 668 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1490  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  29.48 
 
 		 663 aa  194  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.810592  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0381  putative nitrate transporter protein  30.2 
 
 		 420 aa  193  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.492425 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2336  NO3-/NO2-ABC transporter  28.21 
 
 		 407 aa  193  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2377  twin-arginine translocation pathway signal  29.71 
 
 		 426 aa  192  8e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0237  putative nitrate transporter protein  30.85 
 
 		 426 aa  192  9e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1392  NO3-/NO2- ABC transporter  30.39 
 
 		 417 aa  192  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1438  nitrate-binding proteint  30.73 
 
 		 432 aa  192  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.28551  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0258  putative nitrate transporter protein  30.85 
 
 		 426 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.753989 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2105  hypothetical protein  28.54 
 
 		 403 aa  190  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.498438  hitchhiker  0.00655849 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2147  twin-arginine translocation pathway signal  31.34 
 
 		 414 aa  189  7e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2307  hypothetical protein  28.54 
 
 		 403 aa  187  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3843  NO3-/NO2-ABC transporter  29.46 
 
 		 417 aa  187  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0277  putative nitrate transporter protein  30.52 
 
 		 434 aa  186  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2320  twin-arginine translocation pathway signal  29.35 
 
 		 414 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2831  twin-arginine translocation pathway signal  29.35 
 
 		 414 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0330  putative nitrate transporter protein  30.02 
 
 		 437 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2172  putative nitrate transporter component, nrtA  31.45 
 
 		 460 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.210639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3522  twin-arginine translocation pathway signal  29.18 
 
 		 414 aa  184  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1449  nitrate transporter component, nrtA  28.82 
 
 		 403 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0999  ABC transporter periplasmic protein  30.2 
 
 		 431 aa  183  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1414  twin-arginine translocation pathway signal  29.18 
 
 		 414 aa  182  8.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.922981 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1968  nitrate transport protein, NrtC like protein  27.49 
 
 		 444 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2590  twin-arginine translocation pathway signal  29.35 
 
 		 414 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0514763 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2554  twin-arginine translocation pathway signal  29.28 
 
 		 414 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0875  twin-arginine translocation pathway signal  26.84 
 
 		 480 aa  180  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0516063  hitchhiker  0.00230539 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1307  ABC transporter nitrate-binding protein  30.04 
 
 		 453 aa  179  9e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.870256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1148  ABC transporter nitrate-binding protein  30.27 
 
 		 453 aa  179  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294193  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3267  twin-arginine translocation pathway signal  28.86 
 
 		 414 aa  179  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4663  ABC transporter nitrate-binding protein  30.94 
 
 		 453 aa  177  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.807584 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0964  putative nitrate transporter component  28.51 
 
 		 486 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.511943 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2958  nitrate transporter  30.2 
 
 		 382 aa  177  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3730  nitrate transporter  27.25 
 
 		 467 aa  176  9e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0457947  normal  0.12705 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1133  nitrate transporter, putative  29.26 
 
 		 406 aa  176  9e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0226657  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3676  twin-arginine translocation pathway signal  27.25 
 
 		 467 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23460  nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein ; NasS  28.04 
 
 		 440 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143963  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2107  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  29.69 
 
 		 529 aa  174  3.9999999999999995e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.287431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4373  nitrate transport protein, NrtC like protein  26.69 
 
 		 461 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4435  nitrate transporter, putative  27.29 
 
 		 461 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.210676 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3446  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  28.68 
 
 		 380 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1785  nitrate-binding protein NasS, putative  26.65 
 
 		 403 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5899  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  28.47 
 
 		 423 aa  171  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1454  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  28.7 
 
 		 425 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3518  hypothetical protein  29.28 
 
 		 402 aa  170  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2054  twin-arginine translocation pathway signal  29.27 
 
 		 462 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4527  putative nitrate transport protein  28.15 
 
 		 435 aa  169  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2403  ABC transporter nitrate-binding protein  30.38 
 
 		 462 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0310148  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1047  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  29.5 
 
 		 385 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817619  normal  0.872745 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41480  hypothetical protein  27.59 
 
 		 402 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2580  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.18 
 
 		 403 aa  168  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457398  hitchhiker  0.00316434 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0292  ABC transporter nitrate-binding protein  28.54 
 
 		 451 aa  167  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1115  putative nitrate transport protein  27.8 
 
 		 491 aa  167  4e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0641  twin-arginine translocation pathway signal  24.27 
 
 		 477 aa  167  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5674  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  29.06 
 
 		 383 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.679378 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2589  putative nitrate transporter component  27 
 
 		 475 aa  166  8e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>