257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1703 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1703  nitrate transporter  100 
 
 
467 aa  964    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0589  nitrate transporter, putative  56.56 
 
 
432 aa  487  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.57136  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1133  nitrate transporter, putative  46.58 
 
 
406 aa  374  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0226657  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2819  putative nitrate transport protein  44.44 
 
 
469 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.469609  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001607  nitrate ABC transporter nitrate-binding protein  45.52 
 
 
449 aa  367  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03654  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  45.9 
 
 
469 aa  366  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1084  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system  46.14 
 
 
467 aa  365  1e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0177  nitrate transport ATP-binding protein  46.77 
 
 
454 aa  363  2e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125703  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2958  nitrate transporter  47.26 
 
 
382 aa  363  3e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05588  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic component  44.83 
 
 
454 aa  362  8e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1115  putative nitrate transport protein  42.38 
 
 
491 aa  360  3e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2417  putative nitrate transport protein  45.03 
 
 
466 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1663  periplasmic binding protein-like II  46.15 
 
 
455 aa  355  8.999999999999999e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.550763  normal  0.0123781 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2264  histidine kinase  45.37 
 
 
470 aa  353  4e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00574253  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1969  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transporter, substrate binding protein  44.21 
 
 
457 aa  347  2e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3040  putative nitrate transport protein  45.07 
 
 
452 aa  346  5e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0757013  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3316  putative nitrate ABC transporter, periplasmic nitrate-binding protein  44.86 
 
 
461 aa  341  2e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.163343  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1153  nitrate transporter system, periplasmic component  42.44 
 
 
461 aa  341  2e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1152  nitrate transporter, putative  43.08 
 
 
382 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40.96 
 
 
669 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2820  nitrate transporter  43.3 
 
 
397 aa  322  7e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.571583  normal  0.694753 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0830  twin-arginine translocation pathway signal  38.44 
 
 
425 aa  315  9e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0327  nitrate transporter periplasmic component  38.16 
 
 
433 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2909  nitrate-binding proteint  41.57 
 
 
419 aa  311  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4527  putative nitrate transport protein  37.86 
 
 
435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2497  nitrate-binding proteint  39.39 
 
 
418 aa  309  8e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.722347  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1085  nitrate transporter component, nrtA  40.7 
 
 
415 aa  309  8e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1454  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  39.86 
 
 
425 aa  308  9e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0237  putative nitrate transporter protein  37.25 
 
 
426 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0258  putative nitrate transporter protein  37.25 
 
 
426 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.753989 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6461  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  37 
 
 
437 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325074 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2272  nitrate transporter periplasmic component  39.96 
 
 
423 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4228  putative nitrate transport protein  38.6 
 
 
386 aa  306  6e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0904389  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1631  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  39.86 
 
 
424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0841796 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40.1 
 
 
668 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5899  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  38.39 
 
 
423 aa  304  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4470  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  36.95 
 
 
437 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.214365 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2325  nitrate-binding proteint  39.82 
 
 
415 aa  303  3.0000000000000004e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1210  putative nitrate transporter component, nrtA  39.85 
 
 
387 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2105  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  37.77 
 
 
427 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187135  decreased coverage  0.00370566 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0330  putative nitrate transporter protein  37.84 
 
 
437 aa  302  9e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3743  twin-arginine translocation pathway signal  37.85 
 
 
431 aa  302  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869277  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0381  putative nitrate transporter protein  37.03 
 
 
420 aa  301  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.492425 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2504  nitrate-binding protein nrtA precursor, periplasmic  38.16 
 
 
450 aa  300  4e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1761  nitrate transporter component, nrtA  38.67 
 
 
386 aa  300  5e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.786473  normal  0.0141893 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3522  twin-arginine translocation pathway signal  37.64 
 
 
414 aa  298  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2733  nitrate-binding proteint  37.31 
 
 
419 aa  298  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1541  nitrate-binding proteint  37.83 
 
 
419 aa  297  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0277  putative nitrate transporter protein  38.26 
 
 
434 aa  296  6e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2377  twin-arginine translocation pathway signal  37.92 
 
 
426 aa  295  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4457  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  37.89 
 
 
668 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4394  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  37.89 
 
 
668 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2554  twin-arginine translocation pathway signal  36.42 
 
 
414 aa  294  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3843  NO3-/NO2-ABC transporter  37.3 
 
 
417 aa  292  9e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0665  nitrate-binding protein NrtA precursor, periplasmic  37.67 
 
 
475 aa  291  1e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0120522  decreased coverage  0.00176089 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4138  putative nitrate transporter component, nrtA  41.88 
 
 
384 aa  291  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2505  putative nitrate transport protein  42.13 
 
 
377 aa  289  7e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249861  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1449  nitrate transporter component, nrtA  38.85 
 
 
403 aa  288  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2831  twin-arginine translocation pathway signal  36.64 
 
 
414 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1392  NO3-/NO2- ABC transporter  36.24 
 
 
417 aa  286  7e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5012  twin-arginine translocation pathway signal  36.28 
 
 
430 aa  285  9e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0999  ABC transporter periplasmic protein  38.12 
 
 
431 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2320  twin-arginine translocation pathway signal  36.64 
 
 
414 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4572  nitrate transport protein  35.19 
 
 
442 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1438  nitrate-binding proteint  40.09 
 
 
432 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.28551  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1414  twin-arginine translocation pathway signal  36.3 
 
 
414 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.922981 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1760  twin-arginine translocation pathway signal  35.82 
 
 
434 aa  282  9e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3769  nitrate transporter, putative  37.69 
 
 
407 aa  281  1e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2336  NO3-/NO2-ABC transporter  36.96 
 
 
407 aa  281  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3267  twin-arginine translocation pathway signal  35.62 
 
 
414 aa  280  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159892  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4959  twin-arginine translocation pathway signal  35.87 
 
 
430 aa  280  5e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2147  twin-arginine translocation pathway signal  37.32 
 
 
414 aa  280  5e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  38.14 
 
 
657 aa  279  8e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3527  nitrate transport protein  35.76 
 
 
442 aa  279  8e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4496  twin-arginine translocation pathway signal  35.87 
 
 
430 aa  279  9e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1263  nitrate transporter component, nrtA  38.5 
 
 
403 aa  277  3e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5897  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  34.7 
 
 
432 aa  276  4e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.260088  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4923  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  38.41 
 
 
668 aa  276  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2528  nitrate transporter, putative  40.57 
 
 
370 aa  276  5e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1704  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  35.78 
 
 
410 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155862  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3730  nitrate transporter  35.58 
 
 
467 aa  273  6e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0457947  normal  0.12705 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2972  nitrate transporter component, nrtA  38.15 
 
 
402 aa  273  6e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2817  ABC transporter nitrate-binding protein (nrtA)  34.91 
 
 
438 aa  273  7e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3656  twin-arginine translocation pathway signal  34.07 
 
 
427 aa  272  8.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3676  twin-arginine translocation pathway signal  35.35 
 
 
467 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4396  nitrate transport protein  35.82 
 
 
444 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2598  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  36.5 
 
 
669 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.992008  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4459  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  35.82 
 
 
444 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.714854  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3519  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  36.5 
 
 
669 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1785  nitrate-binding protein NasS, putative  37.24 
 
 
403 aa  268  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0056  NO3-/NO2-ABC transporter  33.41 
 
 
405 aa  269  1e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2590  twin-arginine translocation pathway signal  34.9 
 
 
414 aa  268  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0514763 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1239  ABC-type nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein  36.75 
 
 
443 aa  267  2.9999999999999995e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1490  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  36.56 
 
 
663 aa  266  4e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.810592  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2307  hypothetical protein  35.91 
 
 
403 aa  266  5e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2105  hypothetical protein  36.28 
 
 
403 aa  266  7e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.498438  hitchhiker  0.00655849 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4676  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  36.1 
 
 
673 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0919  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.13 
 
 
398 aa  261  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23460  nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein ; NasS  35.42 
 
 
440 aa  261  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143963  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1025  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  38.54 
 
 
667 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.129474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>