238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1047 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1047  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  100 
 
 
385 aa  783    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817619  normal  0.872745 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5674  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  90.65 
 
 
383 aa  712    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.679378 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3446  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  72.4 
 
 
380 aa  547  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1091  putative regulatory protein NasS  64.83 
 
 
353 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0247  nitrate transport ATP-binding protein  64.53 
 
 
353 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1166  regulatory protein NasS, putative  64.72 
 
 
353 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.241228  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0089  putative regulatory protein NasS  64.83 
 
 
353 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.964988  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0332  putative regulatory protein NasS  64.83 
 
 
353 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0240199  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1672  putative regulatory protein  64.53 
 
 
353 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1257  putative regulatory protein NasS  64.83 
 
 
353 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0276079  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1760  putative regulatory protein  64.24 
 
 
353 aa  434  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1339  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  64.72 
 
 
353 aa  433  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.413977 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3941  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  65.68 
 
 
347 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0774649  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4404  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  65.68 
 
 
347 aa  421  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.116895 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4143  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  66.16 
 
 
347 aa  418  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0553251 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3857  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  66.28 
 
 
350 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4511  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  66.28 
 
 
353 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000302779  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5793  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  65.98 
 
 
350 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0830  twin-arginine translocation pathway signal  47.72 
 
 
425 aa  373  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3843  NO3-/NO2-ABC transporter  49.87 
 
 
417 aa  374  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2580  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  48.85 
 
 
403 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457398  hitchhiker  0.00316434 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2590  twin-arginine translocation pathway signal  46.02 
 
 
414 aa  357  1.9999999999999998e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0514763 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1392  NO3-/NO2- ABC transporter  47.11 
 
 
417 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2094  nitrate-binding protein NasS, putative  50.62 
 
 
404 aa  355  5e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2307  hypothetical protein  48.47 
 
 
403 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0381  putative nitrate transporter protein  47.42 
 
 
420 aa  355  1e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.492425 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2909  nitrate-binding proteint  46.81 
 
 
419 aa  354  2e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0258  putative nitrate transporter protein  46.39 
 
 
426 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.753989 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3646  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  50.62 
 
 
404 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0237  putative nitrate transporter protein  46.39 
 
 
426 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3522  twin-arginine translocation pathway signal  46.13 
 
 
414 aa  352  4e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2105  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  48.53 
 
 
427 aa  352  5e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187135  decreased coverage  0.00370566 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2105  hypothetical protein  48.21 
 
 
403 aa  352  7e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.498438  hitchhiker  0.00655849 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2497  nitrate-binding proteint  47.61 
 
 
418 aa  350  2e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.722347  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0330  putative nitrate transporter protein  45.1 
 
 
437 aa  350  3e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1541  nitrate-binding proteint  47.07 
 
 
419 aa  349  4e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0277  putative nitrate transporter protein  46.11 
 
 
434 aa  349  5e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1414  twin-arginine translocation pathway signal  46.38 
 
 
414 aa  348  7e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.922981 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2272  nitrate transporter periplasmic component  46.51 
 
 
423 aa  348  1e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2733  nitrate-binding proteint  46.81 
 
 
419 aa  347  2e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0327  nitrate transporter periplasmic component  44.09 
 
 
433 aa  347  2e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3267  twin-arginine translocation pathway signal  44.73 
 
 
414 aa  346  3e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159892  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2320  twin-arginine translocation pathway signal  46.02 
 
 
414 aa  345  6e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2831  twin-arginine translocation pathway signal  46.02 
 
 
414 aa  345  7e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1785  nitrate-binding protein NasS, putative  48.26 
 
 
403 aa  343  4e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2554  twin-arginine translocation pathway signal  44.47 
 
 
414 aa  341  1e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2147  twin-arginine translocation pathway signal  45.76 
 
 
414 aa  341  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1605  nitrate-binding protein NasS  48.88 
 
 
421 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2377  twin-arginine translocation pathway signal  46.38 
 
 
426 aa  338  9.999999999999999e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1612  nitrate-binding protein NasS  48.74 
 
 
400 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.837424  hitchhiker  0.00000000179069 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3518  hypothetical protein  51.32 
 
 
402 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23460  nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein ; NasS  48.14 
 
 
440 aa  335  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143963  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41480  hypothetical protein  50.13 
 
 
402 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0999  ABC transporter periplasmic protein  42.01 
 
 
431 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2325  nitrate-binding proteint  47.27 
 
 
415 aa  321  1.9999999999999998e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1438  nitrate-binding proteint  47.47 
 
 
432 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.28551  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2336  NO3-/NO2-ABC transporter  37.3 
 
 
407 aa  260  4e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0056  NO3-/NO2-ABC transporter  34.26 
 
 
405 aa  251  2e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  39.02 
 
 
668 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1703  nitrate transporter  36.9 
 
 
467 aa  242  7e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0589  nitrate transporter, putative  40.79 
 
 
432 aa  238  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.57136  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3743  twin-arginine translocation pathway signal  36.88 
 
 
431 aa  236  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869277  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2504  nitrate-binding protein nrtA precursor, periplasmic  34.36 
 
 
450 aa  231  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6461  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  34.69 
 
 
437 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325074 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4470  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  34.62 
 
 
437 aa  230  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.214365 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3527  nitrate transport protein  37.5 
 
 
442 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5899  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  35.9 
 
 
423 aa  228  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  37.21 
 
 
669 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4959  twin-arginine translocation pathway signal  35.58 
 
 
430 aa  228  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4496  twin-arginine translocation pathway signal  35.58 
 
 
430 aa  228  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2817  ABC transporter nitrate-binding protein (nrtA)  34.69 
 
 
438 aa  225  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4394  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  35.77 
 
 
668 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4457  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  35.77 
 
 
668 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5012  twin-arginine translocation pathway signal  35.32 
 
 
430 aa  224  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4459  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  34.55 
 
 
444 aa  223  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.714854  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4396  nitrate transport protein  34.55 
 
 
444 aa  223  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5897  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  34 
 
 
432 aa  216  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.260088  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2958  nitrate transporter  36.53 
 
 
382 aa  216  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0665  nitrate-binding protein NrtA precursor, periplasmic  34.85 
 
 
475 aa  215  9e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0120522  decreased coverage  0.00176089 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4572  nitrate transport protein  34.35 
 
 
442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1760  twin-arginine translocation pathway signal  33.42 
 
 
434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4540  twin-arginine translocation pathway signal  34.96 
 
 
440 aa  211  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1454  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  33.51 
 
 
425 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1631  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  34.12 
 
 
424 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0841796 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4676  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  34.39 
 
 
673 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1239  ABC-type nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein  34.18 
 
 
443 aa  200  3e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4527  putative nitrate transport protein  32.91 
 
 
435 aa  201  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4923  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  34.38 
 
 
668 aa  199  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2598  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  33.07 
 
 
669 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.992008  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3519  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  33.07 
 
 
669 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4435  nitrate transporter, putative  32.63 
 
 
461 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.210676 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4373  nitrate transport protein, NrtC like protein  32.63 
 
 
461 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1969  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transporter, substrate binding protein  31.86 
 
 
457 aa  194  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2528  nitrate transporter, putative  35.23 
 
 
370 aa  194  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0177  nitrate transport ATP-binding protein  33.59 
 
 
454 aa  192  6e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125703  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  33.33 
 
 
657 aa  192  8e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1662  periplasmic binding protein-like II  33.24 
 
 
392 aa  192  9e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.429682  hitchhiker  0.00361023 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1152  nitrate transporter, putative  31.93 
 
 
382 aa  187  3e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1490  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  32.63 
 
 
663 aa  187  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.810592  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1025  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  32.39 
 
 
667 aa  186  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.129474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>