206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0177 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_03654  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  71.53 
 
 
469 aa  652    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001607  nitrate ABC transporter nitrate-binding protein  70.02 
 
 
449 aa  653    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05588  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic component  69.8 
 
 
454 aa  654    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2417  putative nitrate transport protein  69.59 
 
 
466 aa  649    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2819  putative nitrate transport protein  73.33 
 
 
469 aa  674    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.469609  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0177  nitrate transport ATP-binding protein  100 
 
 
454 aa  939    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125703  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1153  nitrate transporter system, periplasmic component  67.72 
 
 
461 aa  631  1e-180  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2264  histidine kinase  68.76 
 
 
470 aa  628  1e-179  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00574253  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3316  putative nitrate ABC transporter, periplasmic nitrate-binding protein  67.35 
 
 
461 aa  625  1e-178  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.163343  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1663  periplasmic binding protein-like II  67.19 
 
 
455 aa  617  1e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.550763  normal  0.0123781 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3040  putative nitrate transport protein  67.41 
 
 
452 aa  611  9.999999999999999e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0757013  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1115  putative nitrate transport protein  64.14 
 
 
491 aa  605  9.999999999999999e-173  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1084  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system  66.51 
 
 
467 aa  594  1e-168  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1969  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transporter, substrate binding protein  59.05 
 
 
457 aa  549  1e-155  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1703  nitrate transporter  46.77 
 
 
467 aa  363  2e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0589  nitrate transporter, putative  44.68 
 
 
432 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.57136  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  36.93 
 
 
669 aa  252  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2820  nitrate transporter  37.7 
 
 
397 aa  251  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.571583  normal  0.694753 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2958  nitrate transporter  39.62 
 
 
382 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4394  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  36.19 
 
 
668 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4457  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  36.19 
 
 
668 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5899  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  36.57 
 
 
423 aa  244  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1152  nitrate transporter, putative  39.08 
 
 
382 aa  241  2e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  36.79 
 
 
668 aa  239  9e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0327  nitrate transporter periplasmic component  35.39 
 
 
433 aa  238  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4527  putative nitrate transport protein  36.85 
 
 
435 aa  238  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1454  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  36.28 
 
 
425 aa  232  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  34.65 
 
 
657 aa  228  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5012  twin-arginine translocation pathway signal  34.74 
 
 
430 aa  228  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1541  nitrate-binding proteint  33.65 
 
 
419 aa  227  3e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2733  nitrate-binding proteint  33.65 
 
 
419 aa  227  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3743  twin-arginine translocation pathway signal  33.97 
 
 
431 aa  225  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869277  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4496  twin-arginine translocation pathway signal  34.51 
 
 
430 aa  225  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1631  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  35.8 
 
 
424 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0841796 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4959  twin-arginine translocation pathway signal  34.51 
 
 
430 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2598  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  34.43 
 
 
669 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.992008  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3519  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  34.43 
 
 
669 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2497  nitrate-binding proteint  33.57 
 
 
418 aa  223  7e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.722347  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4923  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  36.02 
 
 
668 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1133  nitrate transporter, putative  37.67 
 
 
406 aa  222  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0226657  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4459  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  33.81 
 
 
444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.714854  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4396  nitrate transport protein  33.81 
 
 
444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1449  nitrate transporter component, nrtA  34.42 
 
 
403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1605  nitrate-binding protein NasS  33.72 
 
 
421 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4676  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  34.11 
 
 
673 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0830  twin-arginine translocation pathway signal  32.62 
 
 
425 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2909  nitrate-binding proteint  32.63 
 
 
419 aa  215  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1760  twin-arginine translocation pathway signal  33.41 
 
 
434 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2528  nitrate transporter, putative  35.88 
 
 
370 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2105  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  33.25 
 
 
427 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187135  decreased coverage  0.00370566 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2504  nitrate-binding protein nrtA precursor, periplasmic  33.1 
 
 
450 aa  213  7.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2094  nitrate-binding protein NasS, putative  33.73 
 
 
404 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4138  putative nitrate transporter component, nrtA  35.99 
 
 
384 aa  212  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4470  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  32.29 
 
 
437 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.214365 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1761  nitrate transporter component, nrtA  35.99 
 
 
386 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.786473  normal  0.0141893 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1210  putative nitrate transporter component, nrtA  35.71 
 
 
387 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6461  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  31.92 
 
 
437 aa  211  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325074 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3646  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  33.73 
 
 
404 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0330  putative nitrate transporter protein  31.35 
 
 
437 aa  210  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4228  putative nitrate transport protein  33.49 
 
 
386 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0904389  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1085  nitrate transporter component, nrtA  35.44 
 
 
415 aa  209  7e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2580  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  36.53 
 
 
403 aa  209  8e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457398  hitchhiker  0.00316434 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4572  nitrate transport protein  32.02 
 
 
442 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23460  nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein ; NasS  33.18 
 
 
440 aa  207  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143963  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0665  nitrate-binding protein NrtA precursor, periplasmic  33.11 
 
 
475 aa  207  4e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0120522  decreased coverage  0.00176089 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1025  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  34.04 
 
 
667 aa  206  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.129474 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3843  NO3-/NO2-ABC transporter  30.48 
 
 
417 aa  206  5e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1490  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  32.7 
 
 
663 aa  206  9e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.810592  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5897  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  32.51 
 
 
432 aa  205  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.260088  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2272  nitrate transporter periplasmic component  33.18 
 
 
423 aa  204  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0999  ABC transporter periplasmic protein  31.19 
 
 
431 aa  204  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1414  twin-arginine translocation pathway signal  29.08 
 
 
414 aa  203  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.922981 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2554  twin-arginine translocation pathway signal  30 
 
 
414 aa  203  5e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4818  ABC transporter nitrate-binding protein  32.48 
 
 
456 aa  203  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191179  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0381  putative nitrate transporter protein  32.14 
 
 
420 aa  203  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.492425 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0258  putative nitrate transporter protein  31.67 
 
 
426 aa  203  7e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.753989 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0237  putative nitrate transporter protein  31.9 
 
 
426 aa  202  8e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1438  nitrate-binding proteint  32.63 
 
 
432 aa  202  9e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.28551  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3527  nitrate transport protein  32.07 
 
 
442 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2817  ABC transporter nitrate-binding protein (nrtA)  32.07 
 
 
438 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2377  twin-arginine translocation pathway signal  30.24 
 
 
426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2325  nitrate-binding proteint  32.25 
 
 
415 aa  201  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0277  putative nitrate transporter protein  30.64 
 
 
434 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3267  twin-arginine translocation pathway signal  29.31 
 
 
414 aa  199  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159892  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1392  NO3-/NO2- ABC transporter  30.31 
 
 
417 aa  199  6e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1612  nitrate-binding protein NasS  31.07 
 
 
400 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.837424  hitchhiker  0.00000000179069 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2105  hypothetical protein  31.47 
 
 
403 aa  199  9e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.498438  hitchhiker  0.00655849 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3972  ABC transporter nitrate-binding protein  33.33 
 
 
471 aa  199  9e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1237  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  32.62 
 
 
659 aa  198  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1785  nitrate-binding protein NasS, putative  32.39 
 
 
403 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3522  twin-arginine translocation pathway signal  30.55 
 
 
414 aa  198  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2147  twin-arginine translocation pathway signal  30.71 
 
 
414 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0056  NO3-/NO2-ABC transporter  30.6 
 
 
405 aa  197  3e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1239  ABC-type nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein  30.99 
 
 
443 aa  197  3e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0292  ABC transporter nitrate-binding protein  31.63 
 
 
451 aa  197  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2206  putative nitrate transporter component, NrtA  31.34 
 
 
457 aa  197  5.000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2590  twin-arginine translocation pathway signal  29.93 
 
 
414 aa  196  5.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0514763 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2307  hypothetical protein  31.35 
 
 
403 aa  196  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3769  nitrate transporter, putative  34.97 
 
 
407 aa  196  9e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2320  twin-arginine translocation pathway signal  29.52 
 
 
414 aa  195  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>