230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5793 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1339  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  92.86 
 
 		 353 aa  646    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.413977 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5793  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  100 
 
 		 350 aa  692    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3857  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  99.71 
 
 		 350 aa  689    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4511  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  99.71 
 
 		 353 aa  690    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000302779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3941  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  92.2 
 
 		 347 aa  617  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0774649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4404  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  92.2 
 
 		 347 aa  617  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.116895 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4143  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  92.49 
 
 		 347 aa  617  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553251 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1091  putative regulatory protein NasS  77.38 
 
 		 353 aa  517  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0089  putative regulatory protein NasS  77.38 
 
 		 353 aa  517  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.964988  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0332  putative regulatory protein NasS  77.38 
 
 		 353 aa  517  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0240199  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1760  putative regulatory protein  77.38 
 
 		 353 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1257  putative regulatory protein NasS  77.38 
 
 		 353 aa  517  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0276079  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0247  nitrate transport ATP-binding protein  76.79 
 
 		 353 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1672  putative regulatory protein  76.79 
 
 		 353 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1166  regulatory protein NasS, putative  74.71 
 
 		 353 aa  513  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.241228  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1047  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  65.98 
 
 		 385 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817619  normal  0.872745 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5674  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  64.31 
 
 		 383 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.679378 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3446  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  63.69 
 
 		 380 aa  408  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0258  putative nitrate transporter protein  45.38 
 
 		 426 aa  317  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.753989 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0237  putative nitrate transporter protein  45.38 
 
 		 426 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2105  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  47.54 
 
 		 427 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187135  decreased coverage  0.00370566 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0381  putative nitrate transporter protein  46.24 
 
 		 420 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.492425 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41480  hypothetical protein  52.31 
 
 		 402 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2320  twin-arginine translocation pathway signal  45.45 
 
 		 414 aa  312  6.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2831  twin-arginine translocation pathway signal  45.45 
 
 		 414 aa  311  1e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3518  hypothetical protein  52.89 
 
 		 402 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0330  putative nitrate transporter protein  44.78 
 
 		 437 aa  308  9e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1785  nitrate-binding protein NasS, putative  49.14 
 
 		 403 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0277  putative nitrate transporter protein  45.07 
 
 		 434 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0830  twin-arginine translocation pathway signal  43.77 
 
 		 425 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2094  nitrate-binding protein NasS, putative  49.14 
 
 		 404 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3843  NO3-/NO2-ABC transporter  44.97 
 
 		 417 aa  306  3e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2580  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  48.81 
 
 		 403 aa  306  3e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457398  hitchhiker  0.00316434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3646  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  49.14 
 
 		 404 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2147  twin-arginine translocation pathway signal  44.25 
 
 		 414 aa  301  9e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2554  twin-arginine translocation pathway signal  43.58 
 
 		 414 aa  301  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3522  twin-arginine translocation pathway signal  43.75 
 
 		 414 aa  300  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23460  nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein ; NasS  47.73 
 
 		 440 aa  299  4e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143963  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1612  nitrate-binding protein NasS  47.77 
 
 		 400 aa  299  6e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.837424  hitchhiker  0.00000000179069 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1414  twin-arginine translocation pathway signal  42.32 
 
 		 414 aa  299  6e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.922981 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2590  twin-arginine translocation pathway signal  45.29 
 
 		 414 aa  298  7e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0514763 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2272  nitrate transporter periplasmic component  45.54 
 
 		 423 aa  298  9e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2909  nitrate-binding proteint  45.95 
 
 		 419 aa  298  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1605  nitrate-binding protein NasS  48.55 
 
 		 421 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2307  hypothetical protein  47.41 
 
 		 403 aa  295  7e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0327  nitrate transporter periplasmic component  41.28 
 
 		 433 aa  295  1e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3267  twin-arginine translocation pathway signal  41.45 
 
 		 414 aa  293  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0999  ABC transporter periplasmic protein  41.19 
 
 		 431 aa  294  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1541  nitrate-binding proteint  44.57 
 
 		 419 aa  290  3e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2105  hypothetical protein  46.53 
 
 		 403 aa  289  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.498438  hitchhiker  0.00655849 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1392  NO3-/NO2- ABC transporter  42.9 
 
 		 417 aa  288  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2497  nitrate-binding proteint  43.99 
 
 		 418 aa  287  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.722347  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2377  twin-arginine translocation pathway signal  43.58 
 
 		 426 aa  287  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2733  nitrate-binding proteint  44.08 
 
 		 419 aa  287  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2325  nitrate-binding proteint  47.98 
 
 		 415 aa  283  3.0000000000000004e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1438  nitrate-binding proteint  46.43 
 
 		 432 aa  271  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.28551  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0056  NO3-/NO2-ABC transporter  35.55 
 
 		 405 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2336  NO3-/NO2-ABC transporter  37.87 
 
 		 407 aa  236  5.0000000000000005e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  38.71 
 
 		 668 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0589  nitrate transporter, putative  40.4 
 
 		 432 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.57136  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  36.26 
 
 		 669 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4396  nitrate transport protein  35.04 
 
 		 444 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4459  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  35.04 
 
 		 444 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.714854  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3743  twin-arginine translocation pathway signal  35.56 
 
 		 431 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869277  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1703  nitrate transporter  33.33 
 
 		 467 aa  202  8e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6461  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  34.65 
 
 		 437 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325074 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5899  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  37.43 
 
 		 423 aa  200  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4496  twin-arginine translocation pathway signal  35.47 
 
 		 430 aa  199  6e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4959  twin-arginine translocation pathway signal  35.47 
 
 		 430 aa  199  6e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2504  nitrate-binding protein nrtA precursor, periplasmic  36.75 
 
 		 450 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4394  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  36.21 
 
 		 668 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4457  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  36.21 
 
 		 668 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4470  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  34.28 
 
 		 437 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.214365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5012  twin-arginine translocation pathway signal  34.82 
 
 		 430 aa  196  7e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2817  ABC transporter nitrate-binding protein (nrtA)  33.05 
 
 		 438 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1760  twin-arginine translocation pathway signal  34.17 
 
 		 434 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1662  periplasmic binding protein-like II  37.75 
 
 		 392 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.429682  hitchhiker  0.00361023 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5897  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  33.9 
 
 		 432 aa  189  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.260088  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4676  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  34.69 
 
 		 673 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4527  putative nitrate transport protein  36.68 
 
 		 435 aa  188  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4572  nitrate transport protein  34.08 
 
 		 442 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2528  nitrate transporter, putative  35.87 
 
 		 370 aa  186  7e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4228  putative nitrate transport protein  38.84 
 
 		 386 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0904389  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1454  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  34.47 
 
 		 425 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1239  ABC-type nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein  37.11 
 
 		 443 aa  184  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1631  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  36.78 
 
 		 424 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0841796 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1210  putative nitrate transporter component, nrtA  38.9 
 
 		 387 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  33.43 
 
 		 657 aa  182  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1490  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  34.32 
 
 		 663 aa  180  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.810592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3527  nitrate transport protein  34 
 
 		 442 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2958  nitrate transporter  37.9 
 
 		 382 aa  179  9e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3519  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  32.35 
 
 		 669 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2598  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  32.35 
 
 		 669 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.992008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4923  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  34.67 
 
 		 668 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1761  nitrate transporter component, nrtA  37.21 
 
 		 386 aa  175  9e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.786473  normal  0.0141893 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2820  nitrate transporter  29.5 
 
 		 397 aa  175  9e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.571583  normal  0.694753 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1734  nitrate transporter, putative  40.2 
 
 		 361 aa  174  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0177  nitrate transport ATP-binding protein  32.58 
 
 		 454 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125703  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1133  nitrate transporter, putative  35.07 
 
 		 406 aa  172  7.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0226657  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3656  twin-arginine translocation pathway signal  31.71 
 
 		 427 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>