211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1734 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1734  nitrate transporter, putative  100 
 
 		 361 aa  721    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1703  nitrate transporter  37.25 
 
 		 467 aa  226  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2336  NO3-/NO2-ABC transporter  37.24 
 
 		 407 aa  219  6e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2505  putative nitrate transport protein  39.94 
 
 		 377 aa  215  8e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249861  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0589  nitrate transporter, putative  41.43 
 
 		 432 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.57136  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  39.76 
 
 		 669 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0056  NO3-/NO2-ABC transporter  36.25 
 
 		 405 aa  209  4e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2528  nitrate transporter, putative  38.79 
 
 		 370 aa  206  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5899  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  36.75 
 
 		 423 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1152  nitrate transporter, putative  35.24 
 
 		 382 aa  202  5e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2820  nitrate transporter  34.1 
 
 		 397 aa  198  9e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.571583  normal  0.694753 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2497  nitrate-binding proteint  34.73 
 
 		 418 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.722347  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2958  nitrate transporter  39.18 
 
 		 382 aa  196  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0327  nitrate transporter periplasmic component  34.53 
 
 		 433 aa  196  7e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1449  nitrate transporter component, nrtA  38.82 
 
 		 403 aa  196  7e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  36.17 
 
 		 657 aa  195  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1785  nitrate-binding protein NasS, putative  36.53 
 
 		 403 aa  193  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23460  nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein ; NasS  36.46 
 
 		 440 aa  193  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143963  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3646  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  37.13 
 
 		 404 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2094  nitrate-binding protein NasS, putative  36.83 
 
 		 404 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1605  nitrate-binding protein NasS  36.83 
 
 		 421 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1414  twin-arginine translocation pathway signal  31.83 
 
 		 414 aa  191  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.922981 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1704  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  36.49 
 
 		 410 aa  191  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4394  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  36.14 
 
 		 668 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4228  putative nitrate transport protein  36.73 
 
 		 386 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0904389  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4457  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  36.14 
 
 		 668 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0381  putative nitrate transporter protein  33.83 
 
 		 420 aa  190  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.492425 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41480  hypothetical protein  37.99 
 
 		 402 aa  190  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1210  putative nitrate transporter component, nrtA  36.78 
 
 		 387 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2580  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  36.23 
 
 		 403 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457398  hitchhiker  0.00316434 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4527  putative nitrate transport protein  34.53 
 
 		 435 aa  189  8e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2733  nitrate-binding proteint  33.23 
 
 		 419 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1133  nitrate transporter, putative  37.4 
 
 		 406 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0226657  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1541  nitrate-binding proteint  32.93 
 
 		 419 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2147  twin-arginine translocation pathway signal  31.63 
 
 		 414 aa  188  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3518  hypothetical protein  39.29 
 
 		 402 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  36.45 
 
 		 668 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0237  putative nitrate transporter protein  32.44 
 
 		 426 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2909  nitrate-binding proteint  35.07 
 
 		 419 aa  186  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0258  putative nitrate transporter protein  32.44 
 
 		 426 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.753989 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1631  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  34.46 
 
 		 424 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0841796 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1490  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  39.03 
 
 		 663 aa  186  7e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.810592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2377  twin-arginine translocation pathway signal  31.83 
 
 		 426 aa  186  7e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3519  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  37.1 
 
 		 669 aa  185  8e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2598  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  37.1 
 
 		 669 aa  186  8e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.992008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0330  putative nitrate transporter protein  32.33 
 
 		 437 aa  185  9e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1454  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  34.45 
 
 		 425 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4923  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  37.42 
 
 		 668 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1612  nitrate-binding protein NasS  35.52 
 
 		 400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.837424  hitchhiker  0.00000000179069 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0177  nitrate transport ATP-binding protein  34.32 
 
 		 454 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125703  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2307  hypothetical protein  34.42 
 
 		 403 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3267  twin-arginine translocation pathway signal  30.63 
 
 		 414 aa  184  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2272  nitrate transporter periplasmic component  36.16 
 
 		 423 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2320  twin-arginine translocation pathway signal  32.13 
 
 		 414 aa  182  6e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2831  twin-arginine translocation pathway signal  32.13 
 
 		 414 aa  182  6e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0830  twin-arginine translocation pathway signal  31.14 
 
 		 425 aa  182  8.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1761  nitrate transporter component, nrtA  36.21 
 
 		 386 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.786473  normal  0.0141893 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4676  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  35.05 
 
 		 673 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2554  twin-arginine translocation pathway signal  30.51 
 
 		 414 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0277  putative nitrate transporter protein  31.93 
 
 		 434 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2105  hypothetical protein  34.42 
 
 		 403 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.498438  hitchhiker  0.00655849 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6461  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  30.9 
 
 		 437 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325074 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2325  nitrate-binding proteint  35.93 
 
 		 415 aa  181  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2105  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  33.23 
 
 		 427 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187135  decreased coverage  0.00370566 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4138  putative nitrate transporter component, nrtA  35.73 
 
 		 384 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1438  nitrate-binding proteint  34.53 
 
 		 432 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.28551  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3743  twin-arginine translocation pathway signal  31.2 
 
 		 431 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869277  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4470  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  30.9 
 
 		 437 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.214365 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0997  ABC transporter nitrate-binding protein  35.11 
 
 		 457 aa  179  5.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1392  NO3-/NO2- ABC transporter  33.45 
 
 		 417 aa  178  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3843  NO3-/NO2-ABC transporter  30.93 
 
 		 417 aa  178  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05588  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic component  32.16 
 
 		 454 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4959  twin-arginine translocation pathway signal  30.28 
 
 		 430 aa  177  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5012  twin-arginine translocation pathway signal  30.19 
 
 		 430 aa  177  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4496  twin-arginine translocation pathway signal  30.28 
 
 		 430 aa  177  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1239  ABC-type nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein  32.27 
 
 		 443 aa  177  4e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0999  ABC transporter periplasmic protein  31.96 
 
 		 431 aa  176  6e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3742  twin-arginine translocation pathway signal  35.74 
 
 		 467 aa  176  8e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2590  twin-arginine translocation pathway signal  33.1 
 
 		 414 aa  175  9e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0514763 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1085  nitrate transporter component, nrtA  37.46 
 
 		 415 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001607  nitrate ABC transporter nitrate-binding protein  31.42 
 
 		 449 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5793  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  40.2 
 
 		 350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3972  ABC transporter nitrate-binding protein  36.33 
 
 		 471 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3522  twin-arginine translocation pathway signal  30.45 
 
 		 414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3040  putative nitrate transport protein  33.15 
 
 		 452 aa  174  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0757013  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2417  putative nitrate transport protein  30.77 
 
 		 466 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3769  nitrate transporter, putative  36.01 
 
 		 407 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4572  nitrate transport protein  30.81 
 
 		 442 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1025  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  40.16 
 
 		 667 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.129474 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4404  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  39.04 
 
 		 347 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.116895 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3857  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  39.86 
 
 		 350 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3941  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  38.64 
 
 		 347 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0774649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4511  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  39.86 
 
 		 353 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000302779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4396  nitrate transport protein  29.33 
 
 		 444 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4459  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  29.33 
 
 		 444 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.714854  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1263  nitrate transporter component, nrtA  36.34 
 
 		 403 aa  170  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2172  putative nitrate transporter component, nrtA  35.87 
 
 		 460 aa  170  4e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.210639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2264  histidine kinase  31.22 
 
 		 470 aa  169  5e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00574253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1084  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system  30.94 
 
 		 467 aa  169  6e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3527  nitrate transport protein  30.03 
 
 		 442 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.54237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>