218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1263 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1263  nitrate transporter component, nrtA  100 
 
 
403 aa  803    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2972  nitrate transporter component, nrtA  66.67 
 
 
402 aa  518  1e-146  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1704  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  47.74 
 
 
410 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155862  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1449  nitrate transporter component, nrtA  45.27 
 
 
403 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1085  nitrate transporter component, nrtA  42.72 
 
 
415 aa  299  5e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4527  putative nitrate transport protein  41.35 
 
 
435 aa  291  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4138  putative nitrate transporter component, nrtA  44.33 
 
 
384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1454  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  42.68 
 
 
425 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5899  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  40.25 
 
 
423 aa  278  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1703  nitrate transporter  38.5 
 
 
467 aa  277  3e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1210  putative nitrate transporter component, nrtA  43.28 
 
 
387 aa  275  7e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1631  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  41.54 
 
 
424 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0841796 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4228  putative nitrate transport protein  41.19 
 
 
386 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0904389  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0919  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.52 
 
 
398 aa  270  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1761  nitrate transporter component, nrtA  40.74 
 
 
386 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.786473  normal  0.0141893 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0589  nitrate transporter, putative  39.6 
 
 
432 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.57136  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1662  periplasmic binding protein-like II  38.48 
 
 
392 aa  262  6.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.429682  hitchhiker  0.00361023 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3039  putative nitrate transport protein  40 
 
 
389 aa  253  3e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.58476  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2505  putative nitrate transport protein  41.94 
 
 
377 aa  248  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249861  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4454  putative nitrate transport protein  39.19 
 
 
390 aa  235  8e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3769  nitrate transporter, putative  37.47 
 
 
407 aa  228  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1152  nitrate transporter, putative  34.88 
 
 
382 aa  220  3e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2820  nitrate transporter  34.39 
 
 
397 aa  216  5.9999999999999996e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.571583  normal  0.694753 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2958  nitrate transporter  35.66 
 
 
382 aa  213  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4960  putative nitrate transport protein  41.69 
 
 
338 aa  210  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4497  putative nitrate transport protein  42.44 
 
 
338 aa  209  8e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1133  nitrate transporter, putative  35.26 
 
 
406 aa  207  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0226657  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2528  nitrate transporter, putative  35.26 
 
 
370 aa  192  7e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6461  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  29.76 
 
 
437 aa  192  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325074 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  31.75 
 
 
669 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5013  putative nitrate transport protein  40.18 
 
 
338 aa  191  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.826042 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4470  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  29.02 
 
 
437 aa  190  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.214365 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2819  putative nitrate transport protein  32.61 
 
 
469 aa  190  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.469609  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1663  periplasmic binding protein-like II  33.7 
 
 
455 aa  188  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.550763  normal  0.0123781 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3040  putative nitrate transport protein  34.6 
 
 
452 aa  187  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0757013  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1969  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transporter, substrate binding protein  32.6 
 
 
457 aa  187  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1115  putative nitrate transport protein  34.15 
 
 
491 aa  187  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1084  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system  33.06 
 
 
467 aa  187  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2301  putative nitrate transport protein  39.94 
 
 
333 aa  186  9e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.910203 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1153  nitrate transporter system, periplasmic component  30.82 
 
 
461 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03654  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  32.33 
 
 
469 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2417  putative nitrate transport protein  31.87 
 
 
466 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  33.5 
 
 
657 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1166  regulatory protein NasS, putative  38.51 
 
 
353 aa  182  7e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.241228  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0177  nitrate transport ATP-binding protein  32.7 
 
 
454 aa  182  8.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2336  NO3-/NO2-ABC transporter  31.58 
 
 
407 aa  182  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001607  nitrate ABC transporter nitrate-binding protein  32.51 
 
 
449 aa  181  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1760  putative regulatory protein  37.64 
 
 
353 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1091  putative regulatory protein NasS  37.64 
 
 
353 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0089  putative regulatory protein NasS  37.64 
 
 
353 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.964988  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0332  putative regulatory protein NasS  37.64 
 
 
353 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0240199  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1257  putative regulatory protein NasS  37.64 
 
 
353 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0276079  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0056  NO3-/NO2-ABC transporter  28.3 
 
 
405 aa  179  8e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3743  twin-arginine translocation pathway signal  29.06 
 
 
431 aa  179  9e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869277  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4959  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 
430 aa  178  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2264  histidine kinase  31.23 
 
 
470 aa  178  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00574253  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05588  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic component  32.51 
 
 
454 aa  177  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3316  putative nitrate ABC transporter, periplasmic nitrate-binding protein  31.37 
 
 
461 aa  176  6e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.163343  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4496  twin-arginine translocation pathway signal  27.9 
 
 
430 aa  176  7e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5012  twin-arginine translocation pathway signal  27.34 
 
 
430 aa  176  8e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1672  putative regulatory protein  36.78 
 
 
353 aa  176  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2817  ABC transporter nitrate-binding protein (nrtA)  27.76 
 
 
438 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4394  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  32.43 
 
 
668 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4457  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  32.43 
 
 
668 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1239  ABC-type nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein  29.8 
 
 
443 aa  175  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1760  twin-arginine translocation pathway signal  27.83 
 
 
434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0247  nitrate transport ATP-binding protein  36.49 
 
 
353 aa  173  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2504  nitrate-binding protein nrtA precursor, periplasmic  28.04 
 
 
450 aa  173  5.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  33.74 
 
 
668 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3527  nitrate transport protein  27.7 
 
 
442 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1734  nitrate transporter, putative  36.34 
 
 
361 aa  170  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918495  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0665  nitrate-binding protein NrtA precursor, periplasmic  28.33 
 
 
475 aa  169  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0120522  decreased coverage  0.00176089 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3843  NO3-/NO2-ABC transporter  31.71 
 
 
417 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0237  putative nitrate transporter protein  32.96 
 
 
426 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0258  putative nitrate transporter protein  32.96 
 
 
426 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.753989 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4572  nitrate transport protein  27.8 
 
 
442 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4396  nitrate transport protein  26.78 
 
 
444 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4459  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  26.78 
 
 
444 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.714854  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0381  putative nitrate transporter protein  31.91 
 
 
420 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.492425 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4818  ABC transporter nitrate-binding protein  31.74 
 
 
456 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191179  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5897  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  27.38 
 
 
432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.260088  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1047  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  33.8 
 
 
385 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817619  normal  0.872745 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3446  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  32.75 
 
 
380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2320  twin-arginine translocation pathway signal  31.88 
 
 
414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2831  twin-arginine translocation pathway signal  31.88 
 
 
414 aa  164  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4540  twin-arginine translocation pathway signal  28.12 
 
 
440 aa  161  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3522  twin-arginine translocation pathway signal  29.25 
 
 
414 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0330  putative nitrate transporter protein  31.36 
 
 
437 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3774  putative nitrate transporter component, NrtA  32.54 
 
 
454 aa  160  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.944319  normal  0.102556 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5674  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  33.72 
 
 
383 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.679378 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1339  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  34.76 
 
 
353 aa  159  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.413977 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4404  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  35.34 
 
 
347 aa  159  9e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.116895 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0830  twin-arginine translocation pathway signal  29.89 
 
 
425 aa  159  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3941  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  35.34 
 
 
347 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0774649  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3742  putative nitrate transport protein  42.09 
 
 
334 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.114721 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2554  twin-arginine translocation pathway signal  30.03 
 
 
414 aa  158  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0277  putative nitrate transporter protein  31.64 
 
 
434 aa  158  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1414  twin-arginine translocation pathway signal  29.49 
 
 
414 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.922981 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2403  ABC transporter nitrate-binding protein  31.11 
 
 
462 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0310148  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2147  twin-arginine translocation pathway signal  31.06 
 
 
414 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>