225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1704 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1704  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  100 
 
 		 410 aa  816    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1263  nitrate transporter component, nrtA  47.74 
 
 		 403 aa  336  5e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2972  nitrate transporter component, nrtA  47.86 
 
 		 402 aa  327  2.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1449  nitrate transporter component, nrtA  45.41 
 
 		 403 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1085  nitrate transporter component, nrtA  42.08 
 
 		 415 aa  298  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0919  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.42 
 
 		 398 aa  287  2.9999999999999996e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0589  nitrate transporter, putative  40.1 
 
 		 432 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.57136  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1703  nitrate transporter  35.78 
 
 		 467 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1662  periplasmic binding protein-like II  37.63 
 
 		 392 aa  263  3e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.429682  hitchhiker  0.00361023 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1454  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  38.02 
 
 		 425 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5899  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  39.04 
 
 		 423 aa  257  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4527  putative nitrate transport protein  37.59 
 
 		 435 aa  257  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1631  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  38.27 
 
 		 424 aa  257  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0841796 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3769  nitrate transporter, putative  37.79 
 
 		 407 aa  249  4e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3039  putative nitrate transport protein  39.35 
 
 		 389 aa  246  6e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.58476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2958  nitrate transporter  38.74 
 
 		 382 aa  243  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1152  nitrate transporter, putative  34.25 
 
 		 382 aa  236  4e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2505  putative nitrate transport protein  36.34 
 
 		 377 aa  229  5e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4454  putative nitrate transport protein  36.27 
 
 		 390 aa  223  7e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1133  nitrate transporter, putative  34.52 
 
 		 406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0226657  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4228  putative nitrate transport protein  34.49 
 
 		 386 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0904389  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4138  putative nitrate transporter component, nrtA  34.56 
 
 		 384 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1210  putative nitrate transporter component, nrtA  34.34 
 
 		 387 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1761  nitrate transporter component, nrtA  34 
 
 		 386 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.786473  normal  0.0141893 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  33.73 
 
 		 657 aa  210  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1239  ABC-type nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein  32.36 
 
 		 443 aa  204  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2820  nitrate transporter  32.38 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.571583  normal  0.694753 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4960  putative nitrate transport protein  38.89 
 
 		 338 aa  202  6e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3743  twin-arginine translocation pathway signal  30.96 
 
 		 431 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869277  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  33.58 
 
 		 668 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5013  putative nitrate transport protein  39.18 
 
 		 338 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.826042 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0056  NO3-/NO2-ABC transporter  31.22 
 
 		 405 aa  194  2e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4497  putative nitrate transport protein  38.89 
 
 		 338 aa  194  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4457  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  32.92 
 
 		 668 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4394  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  32.92 
 
 		 668 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4470  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  29.16 
 
 		 437 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.214365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2504  nitrate-binding protein nrtA precursor, periplasmic  29.48 
 
 		 450 aa  192  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1734  nitrate transporter, putative  36.49 
 
 		 361 aa  191  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5012  twin-arginine translocation pathway signal  29.06 
 
 		 430 aa  191  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6461  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  28.92 
 
 		 437 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325074 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4959  twin-arginine translocation pathway signal  29.31 
 
 		 430 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4496  twin-arginine translocation pathway signal  28.82 
 
 		 430 aa  190  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4459  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  27.86 
 
 		 444 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.714854  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4396  nitrate transport protein  27.86 
 
 		 444 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  29.83 
 
 		 669 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1166  regulatory protein NasS, putative  35.48 
 
 		 353 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.241228  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5897  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  28.26 
 
 		 432 aa  180  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.260088  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1760  twin-arginine translocation pathway signal  28.01 
 
 		 434 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1115  putative nitrate transport protein  30.46 
 
 		 491 aa  180  4e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4572  nitrate transport protein  27.98 
 
 		 442 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1091  putative regulatory protein NasS  35.48 
 
 		 353 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0089  putative regulatory protein NasS  35.48 
 
 		 353 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.964988  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001607  nitrate ABC transporter nitrate-binding protein  31.34 
 
 		 449 aa  179  8e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0332  putative regulatory protein NasS  35.48 
 
 		 353 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0240199  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1257  putative regulatory protein NasS  35.48 
 
 		 353 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0276079  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3527  nitrate transport protein  28.36 
 
 		 442 aa  179  9e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1153  nitrate transporter system, periplasmic component  29.77 
 
 		 461 aa  178  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1047  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  33.9 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817619  normal  0.872745 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2819  putative nitrate transport protein  31.62 
 
 		 469 aa  179  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.469609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2528  nitrate transporter, putative  32.85 
 
 		 370 aa  179  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1760  putative regulatory protein  35.48 
 
 		 353 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1237  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  31.75 
 
 		 659 aa  177  3e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05588  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic component  29.52 
 
 		 454 aa  177  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0665  nitrate-binding protein NrtA precursor, periplasmic  28.43 
 
 		 475 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0120522  decreased coverage  0.00176089 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2417  putative nitrate transport protein  31.17 
 
 		 466 aa  177  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2817  ABC transporter nitrate-binding protein (nrtA)  27.56 
 
 		 438 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3941  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  35.71 
 
 		 347 aa  176  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0774649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3446  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  31.99 
 
 		 380 aa  176  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4404  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  36.04 
 
 		 347 aa  176  9e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.116895 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1969  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transporter, substrate binding protein  28.61 
 
 		 457 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1084  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system  30.81 
 
 		 467 aa  172  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1672  putative regulatory protein  34.02 
 
 		 353 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4540  twin-arginine translocation pathway signal  28.5 
 
 		 440 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0247  nitrate transport ATP-binding protein  34.02 
 
 		 353 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3316  putative nitrate ABC transporter, periplasmic nitrate-binding protein  30.27 
 
 		 461 aa  171  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.163343  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2105  hypothetical protein  31.69 
 
 		 403 aa  170  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.498438  hitchhiker  0.00655849 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4373  nitrate transport protein, NrtC like protein  28.5 
 
 		 461 aa  170  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2307  hypothetical protein  31.97 
 
 		 403 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2301  putative nitrate transport protein  37.75 
 
 		 333 aa  169  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.910203 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03654  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  29.25 
 
 		 469 aa  169  7e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2272  nitrate transporter periplasmic component  28.54 
 
 		 423 aa  168  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1339  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  34.2 
 
 		 353 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.413977 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3040  putative nitrate transport protein  31.06 
 
 		 452 aa  169  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0757013  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2264  histidine kinase  29.41 
 
 		 470 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00574253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3857  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  35.44 
 
 		 350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5674  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  31.74 
 
 		 383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.679378 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4511  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  35.44 
 
 		 353 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000302779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4435  nitrate transporter, putative  28.27 
 
 		 461 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.210676 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0177  nitrate transport ATP-binding protein  30.54 
 
 		 454 aa  166  6.9999999999999995e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125703  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5793  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  35.14 
 
 		 350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0830  twin-arginine translocation pathway signal  28.53 
 
 		 425 aa  164  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1663  periplasmic binding protein-like II  30.16 
 
 		 455 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.550763  normal  0.0123781 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3646  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  31.2 
 
 		 404 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2172  putative nitrate transporter component, nrtA  28.1 
 
 		 460 aa  162  9e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.210639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4923  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  29.31 
 
 		 668 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.502071 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2094  nitrate-binding protein NasS, putative  31.2 
 
 		 404 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3522  twin-arginine translocation pathway signal  27.59 
 
 		 414 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3656  twin-arginine translocation pathway signal  27.54 
 
 		 427 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4818  ABC transporter nitrate-binding protein  28.43 
 
 		 456 aa  162  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191179  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2320  twin-arginine translocation pathway signal  29.49 
 
 		 414 aa  161  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>