205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0919 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0919  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  100 
 
 		 398 aa  796    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1085  nitrate transporter component, nrtA  51.91 
 
 		 415 aa  388  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1449  nitrate transporter component, nrtA  47.84 
 
 		 403 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1704  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  42.42 
 
 		 410 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1263  nitrate transporter component, nrtA  41.52 
 
 		 403 aa  270  2e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4527  putative nitrate transport protein  39.2 
 
 		 435 aa  269  8e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1703  nitrate transporter  36.13 
 
 		 467 aa  261  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2505  putative nitrate transport protein  40.52 
 
 		 377 aa  256  5e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249861  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0589  nitrate transporter, putative  39.85 
 
 		 432 aa  256  6e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.57136  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2972  nitrate transporter component, nrtA  41.16 
 
 		 402 aa  253  3e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1454  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  37.34 
 
 		 425 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1662  periplasmic binding protein-like II  36.25 
 
 		 392 aa  246  4e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.429682  hitchhiker  0.00361023 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5899  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  36.73 
 
 		 423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1631  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  37.09 
 
 		 424 aa  244  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0841796 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2958  nitrate transporter  39.29 
 
 		 382 aa  238  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4454  putative nitrate transport protein  38.34 
 
 		 390 aa  235  9e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1210  putative nitrate transporter component, nrtA  35.7 
 
 		 387 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4138  putative nitrate transporter component, nrtA  37.35 
 
 		 384 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4228  putative nitrate transport protein  35.28 
 
 		 386 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0904389  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1761  nitrate transporter component, nrtA  35.01 
 
 		 386 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.786473  normal  0.0141893 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1133  nitrate transporter, putative  36.79 
 
 		 406 aa  216  5e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0226657  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3769  nitrate transporter, putative  34.46 
 
 		 407 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1152  nitrate transporter, putative  33.43 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3039  putative nitrate transport protein  35.88 
 
 		 389 aa  209  6e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.58476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2820  nitrate transporter  31.43 
 
 		 397 aa  201  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.571583  normal  0.694753 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1084  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system  31.95 
 
 		 467 aa  192  9e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1969  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transporter, substrate binding protein  30.54 
 
 		 457 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4960  putative nitrate transport protein  39.36 
 
 		 338 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4497  putative nitrate transport protein  38.53 
 
 		 338 aa  187  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1115  putative nitrate transport protein  30.31 
 
 		 491 aa  187  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1239  ABC-type nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein  30.65 
 
 		 443 aa  182  9.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2819  putative nitrate transport protein  28.33 
 
 		 469 aa  182  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.469609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6461  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  31.67 
 
 		 437 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325074 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0177  nitrate transport ATP-binding protein  32.11 
 
 		 454 aa  180  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125703  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2264  histidine kinase  30.19 
 
 		 470 aa  179  5.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00574253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4470  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  31.42 
 
 		 437 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.214365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5013  putative nitrate transport protein  35.4 
 
 		 338 aa  177  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.826042 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2417  putative nitrate transport protein  30.05 
 
 		 466 aa  176  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3040  putative nitrate transport protein  31.94 
 
 		 452 aa  173  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0757013  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2528  nitrate transporter, putative  31.87 
 
 		 370 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001607  nitrate ABC transporter nitrate-binding protein  28.43 
 
 		 449 aa  172  9e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1153  nitrate transporter system, periplasmic component  29.16 
 
 		 461 aa  171  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03654  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  30.02 
 
 		 469 aa  169  6e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3527  nitrate transport protein  30.94 
 
 		 442 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05588  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic component  28.3 
 
 		 454 aa  168  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2504  nitrate-binding protein nrtA precursor, periplasmic  29.68 
 
 		 450 aa  168  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4373  nitrate transport protein, NrtC like protein  27.64 
 
 		 461 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1663  periplasmic binding protein-like II  29.81 
 
 		 455 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.550763  normal  0.0123781 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4435  nitrate transporter, putative  27.4 
 
 		 461 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.210676 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1968  nitrate transport protein, NrtC like protein  28.68 
 
 		 444 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1734  nitrate transporter, putative  33.73 
 
 		 361 aa  160  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4396  nitrate transport protein  28.46 
 
 		 444 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4459  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  28.46 
 
 		 444 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.714854  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3316  putative nitrate ABC transporter, periplasmic nitrate-binding protein  29.33 
 
 		 461 aa  159  6e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.163343  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3742  putative nitrate transport protein  36.69 
 
 		 334 aa  159  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.114721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3743  twin-arginine translocation pathway signal  27.25 
 
 		 431 aa  156  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869277  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0665  nitrate-binding protein NrtA precursor, periplasmic  28.21 
 
 		 475 aa  156  7e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0120522  decreased coverage  0.00176089 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2301  putative nitrate transport protein  35.4 
 
 		 333 aa  155  9e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.910203 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  29.78 
 
 		 668 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4959  twin-arginine translocation pathway signal  27.75 
 
 		 430 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  28.89 
 
 		 669 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2307  hypothetical protein  31.74 
 
 		 403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0056  NO3-/NO2-ABC transporter  26.84 
 
 		 405 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4457  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  28.82 
 
 		 668 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4394  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  28.82 
 
 		 668 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5012  twin-arginine translocation pathway signal  27.18 
 
 		 430 aa  153  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  29.98 
 
 		 657 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2105  hypothetical protein  32.3 
 
 		 403 aa  153  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.498438  hitchhiker  0.00655849 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1760  twin-arginine translocation pathway signal  27.79 
 
 		 434 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  0.0152873 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1047  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  33.04 
 
 		 385 aa  152  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817619  normal  0.872745 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5674  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  33.63 
 
 		 383 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.679378 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4496  twin-arginine translocation pathway signal  27.5 
 
 		 430 aa  152  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1091  putative regulatory protein NasS  36.39 
 
 		 353 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0089  putative regulatory protein NasS  36.39 
 
 		 353 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.964988  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0332  putative regulatory protein NasS  36.39 
 
 		 353 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0240199  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1760  putative regulatory protein  36.39 
 
 		 353 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1257  putative regulatory protein NasS  36.39 
 
 		 353 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0276079  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5897  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  28.64 
 
 		 432 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.260088  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4404  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  35.41 
 
 		 347 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.116895 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3941  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  35.41 
 
 		 347 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0774649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4572  nitrate transport protein  27.64 
 
 		 442 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1166  regulatory protein NasS, putative  35.74 
 
 		 353 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.241228  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2596  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  26.75 
 
 		 457 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1672  putative regulatory protein  35.41 
 
 		 353 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3446  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  32.84 
 
 		 380 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3521  bicarbonate transport system substrate-binding protein  26.97 
 
 		 457 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4925  bicarbonate transport system substrate-binding protein  26.83 
 
 		 454 aa  146  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.794472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4540  twin-arginine translocation pathway signal  27.76 
 
 		 440 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2336  NO3-/NO2-ABC transporter  28.49 
 
 		 407 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2817  ABC transporter nitrate-binding protein (nrtA)  28.36 
 
 		 438 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0247  nitrate transport ATP-binding protein  35.08 
 
 		 353 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3676  twin-arginine translocation pathway signal  27.85 
 
 		 467 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3857  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  34.75 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23460  nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein ; NasS  30.62 
 
 		 440 aa  145  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143963  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4511  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  34.75 
 
 		 353 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000302779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5793  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  34.75 
 
 		 350 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3730  nitrate transporter  27.85 
 
 		 467 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0457947  normal  0.12705 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2580  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  31.18 
 
 		 403 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457398  hitchhiker  0.00316434 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1541  nitrate-binding proteint  27.32 
 
 		 419 aa  142  9e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1785  nitrate-binding protein NasS, putative  31.27 
 
 		 403 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>