201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2301 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2301  putative nitrate transport protein  100 
 
 
333 aa  646    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.910203 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5013  putative nitrate transport protein  58.16 
 
 
338 aa  332  8e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.826042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4960  putative nitrate transport protein  57.44 
 
 
338 aa  323  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4497  putative nitrate transport protein  57.74 
 
 
338 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3742  putative nitrate transport protein  53.89 
 
 
334 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.114721 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2870  putative nitrate transport protein  52.24 
 
 
334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2505  putative nitrate transport protein  41.91 
 
 
377 aa  216  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249861  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4527  putative nitrate transport protein  40.06 
 
 
435 aa  216  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1631  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  41.26 
 
 
424 aa  215  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0841796 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1454  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  40.29 
 
 
425 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2528  nitrate transporter, putative  36.13 
 
 
370 aa  208  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1210  putative nitrate transporter component, nrtA  40.92 
 
 
387 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5899  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  39.94 
 
 
423 aa  206  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1703  nitrate transporter  35.17 
 
 
467 aa  202  9e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4228  putative nitrate transport protein  40.17 
 
 
386 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0904389  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4138  putative nitrate transporter component, nrtA  39.03 
 
 
384 aa  193  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1449  nitrate transporter component, nrtA  38.55 
 
 
403 aa  192  7e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1085  nitrate transporter component, nrtA  37.1 
 
 
415 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1761  nitrate transporter component, nrtA  39.77 
 
 
386 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.786473  normal  0.0141893 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2820  nitrate transporter  32.75 
 
 
397 aa  187  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.571583  normal  0.694753 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1263  nitrate transporter component, nrtA  39.94 
 
 
403 aa  186  5e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0589  nitrate transporter, putative  38.26 
 
 
432 aa  186  7e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.57136  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2958  nitrate transporter  38.76 
 
 
382 aa  186  7e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3769  nitrate transporter, putative  38.3 
 
 
407 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1152  nitrate transporter, putative  34.01 
 
 
382 aa  182  7e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1153  nitrate transporter system, periplasmic component  30.3 
 
 
461 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1133  nitrate transporter, putative  37.24 
 
 
406 aa  179  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0226657  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1084  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system  31.86 
 
 
467 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1115  putative nitrate transport protein  31.52 
 
 
491 aa  175  8e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2972  nitrate transporter component, nrtA  38.79 
 
 
402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1704  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  37.75 
 
 
410 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155862  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001607  nitrate ABC transporter nitrate-binding protein  31.34 
 
 
449 aa  170  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1662  periplasmic binding protein-like II  36.52 
 
 
392 aa  169  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.429682  hitchhiker  0.00361023 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1047  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  36.5 
 
 
385 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817619  normal  0.872745 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3039  putative nitrate transport protein  37.13 
 
 
389 aa  168  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.58476  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3316  putative nitrate ABC transporter, periplasmic nitrate-binding protein  30.43 
 
 
461 aa  167  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.163343  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1969  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transporter, substrate binding protein  28.85 
 
 
457 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3040  putative nitrate transport protein  32.23 
 
 
452 aa  166  5.9999999999999996e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0757013  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05588  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic component  31.34 
 
 
454 aa  166  6.9999999999999995e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0177  nitrate transport ATP-binding protein  31.49 
 
 
454 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125703  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2417  putative nitrate transport protein  30.66 
 
 
466 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2819  putative nitrate transport protein  29.86 
 
 
469 aa  160  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.469609  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0919  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.4 
 
 
398 aa  159  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3941  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  37.06 
 
 
347 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0774649  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4404  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  37.06 
 
 
347 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.116895 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03654  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  29.95 
 
 
469 aa  157  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1663  periplasmic binding protein-like II  29.75 
 
 
455 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.550763  normal  0.0123781 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1091  putative regulatory protein NasS  36.18 
 
 
353 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0089  putative regulatory protein NasS  36.18 
 
 
353 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.964988  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0332  putative regulatory protein NasS  36.18 
 
 
353 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0240199  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1257  putative regulatory protein NasS  36.18 
 
 
353 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0276079  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4143  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  37.94 
 
 
347 aa  155  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0553251 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5674  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  33.83 
 
 
383 aa  156  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.679378 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1734  nitrate transporter, putative  36.69 
 
 
361 aa  156  6e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918495  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3446  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  34.53 
 
 
380 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1672  putative regulatory protein  35.59 
 
 
353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0247  nitrate transport ATP-binding protein  35.59 
 
 
353 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4394  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  32.75 
 
 
668 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4457  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  32.75 
 
 
668 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1339  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  36.07 
 
 
353 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.413977 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1166  regulatory protein NasS, putative  35.88 
 
 
353 aa  151  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.241228  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1760  putative regulatory protein  35.88 
 
 
353 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4511  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  37.74 
 
 
353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000302779  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5793  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  37.62 
 
 
350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2264  histidine kinase  28.37 
 
 
470 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00574253  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3857  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  37.74 
 
 
350 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0056  NO3-/NO2-ABC transporter  25.82 
 
 
405 aa  146  6e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3518  hypothetical protein  35.09 
 
 
402 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3843  NO3-/NO2-ABC transporter  28.36 
 
 
417 aa  142  7e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  32.36 
 
 
668 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  31.78 
 
 
669 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4542  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  31.69 
 
 
657 aa  139  8.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2272  nitrate transporter periplasmic component  30.29 
 
 
423 aa  137  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1414  twin-arginine translocation pathway signal  28.24 
 
 
414 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.922981 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41480  hypothetical protein  34.02 
 
 
402 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1239  ABC-type nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein  31.43 
 
 
443 aa  134  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2336  NO3-/NO2-ABC transporter  27.73 
 
 
407 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4959  twin-arginine translocation pathway signal  28.7 
 
 
430 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4496  twin-arginine translocation pathway signal  28.7 
 
 
430 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4454  putative nitrate transport protein  39.21 
 
 
390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3522  twin-arginine translocation pathway signal  27.7 
 
 
414 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5012  twin-arginine translocation pathway signal  28.99 
 
 
430 aa  133  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2497  nitrate-binding proteint  30.06 
 
 
418 aa  133  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.722347  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3267  twin-arginine translocation pathway signal  27.78 
 
 
414 aa  132  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159892  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2909  nitrate-binding proteint  29.24 
 
 
419 aa  132  6.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2554  twin-arginine translocation pathway signal  27.65 
 
 
414 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2105  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.57 
 
 
427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187135  decreased coverage  0.00370566 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2320  twin-arginine translocation pathway signal  29.31 
 
 
414 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2147  twin-arginine translocation pathway signal  28.61 
 
 
414 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2598  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  28.7 
 
 
669 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.992008  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2831  twin-arginine translocation pathway signal  29.31 
 
 
414 aa  130  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3519  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  28.7 
 
 
669 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0830  twin-arginine translocation pathway signal  26.9 
 
 
425 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6461  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  27.07 
 
 
437 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325074 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4676  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  28.65 
 
 
673 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3743  twin-arginine translocation pathway signal  28.9 
 
 
431 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869277  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0237  putative nitrate transporter protein  29.15 
 
 
426 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2504  nitrate-binding protein nrtA precursor, periplasmic  27.62 
 
 
450 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2590  twin-arginine translocation pathway signal  28.02 
 
 
414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0514763 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0258  putative nitrate transporter protein  29.15 
 
 
426 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.753989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>