205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3039 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3039  putative nitrate transport protein  100 
 
 		 389 aa  771    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.58476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1662  periplasmic binding protein-like II  53.61 
 
 		 392 aa  420  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.429682  hitchhiker  0.00361023 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4454  putative nitrate transport protein  49.35 
 
 		 390 aa  364  1e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1263  nitrate transporter component, nrtA  40 
 
 		 403 aa  256  5e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1704  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  39.65 
 
 		 410 aa  249  6e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.155862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2972  nitrate transporter component, nrtA  40.36 
 
 		 402 aa  249  8e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4527  putative nitrate transport protein  38 
 
 		 435 aa  236  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1085  nitrate transporter component, nrtA  36.73 
 
 		 415 aa  232  8.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0589  nitrate transporter, putative  36.41 
 
 		 432 aa  227  3e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.57136  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1454  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  37.6 
 
 		 425 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1449  nitrate transporter component, nrtA  37.82 
 
 		 403 aa  225  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1703  nitrate transporter  32.16 
 
 		 467 aa  225  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543775 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1631  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  37.79 
 
 		 424 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0841796 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0919  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.88 
 
 		 398 aa  221  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5899  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  35.68 
 
 		 423 aa  216  5e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2505  putative nitrate transport protein  34.79 
 
 		 377 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1152  nitrate transporter, putative  32.07 
 
 		 382 aa  201  3e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1133  nitrate transporter, putative  33.25 
 
 		 406 aa  195  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0226657  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4138  putative nitrate transporter component, nrtA  38.44 
 
 		 384 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal  0.349195 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4228  putative nitrate transport protein  38.31 
 
 		 386 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0904389  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1210  putative nitrate transporter component, nrtA  36.89 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1761  nitrate transporter component, nrtA  37.97 
 
 		 386 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.786473  normal  0.0141893 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3769  nitrate transporter, putative  33.25 
 
 		 407 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2820  nitrate transporter  33.24 
 
 		 397 aa  184  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.571583  normal  0.694753 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5013  putative nitrate transport protein  39.24 
 
 		 338 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.826042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4960  putative nitrate transport protein  37.93 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2301  putative nitrate transport protein  36.87 
 
 		 333 aa  173  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.910203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4497  putative nitrate transport protein  38.15 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1339  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  36.34 
 
 		 353 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.413977 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2105  hypothetical protein  33.7 
 
 		 403 aa  163  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.498438  hitchhiker  0.00655849 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2307  hypothetical protein  33.7 
 
 		 403 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4404  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  37.14 
 
 		 347 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.116895 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3941  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  37.14 
 
 		 347 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0774649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2528  nitrate transporter, putative  29.94 
 
 		 370 aa  161  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.341637  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4143  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  37.14 
 
 		 347 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553251 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3040  putative nitrate transport protein  30.43 
 
 		 452 aa  160  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0757013  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4511  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  36.83 
 
 		 353 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000302779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3857  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  36.83 
 
 		 350 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5793  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, periplasmic ligand binding protein  36.83 
 
 		 350 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0177  nitrate transport ATP-binding protein  30.33 
 
 		 454 aa  157  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125703  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3743  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 		 431 aa  156  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.869277  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3446  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  33.14 
 
 		 380 aa  156  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1166  regulatory protein NasS, putative  35.56 
 
 		 353 aa  155  8e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.241228  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2336  NO3-/NO2-ABC transporter  30.47 
 
 		 407 aa  156  8e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2958  nitrate transporter  34.3 
 
 		 382 aa  155  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1091  putative regulatory protein NasS  35.24 
 
 		 353 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224559  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0830  twin-arginine translocation pathway signal  30.33 
 
 		 425 aa  155  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0089  putative regulatory protein NasS  35.24 
 
 		 353 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.964988  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0332  putative regulatory protein NasS  35.24 
 
 		 353 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0240199  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1257  putative regulatory protein NasS  35.24 
 
 		 353 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0276079  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2094  nitrate-binding protein NasS, putative  33.24 
 
 		 404 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3525  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  30.4 
 
 		 669 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1760  putative regulatory protein  35.24 
 
 		 353 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3646  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  33.24 
 
 		 404 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2107  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  29.3 
 
 		 529 aa  154  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.287431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2554  twin-arginine translocation pathway signal  28.32 
 
 		 414 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2325  nitrate-binding proteint  30.45 
 
 		 415 aa  153  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0999  ABC transporter periplasmic protein  28.98 
 
 		 431 aa  153  5.9999999999999996e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1047  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  34.19 
 
 		 385 aa  152  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817619  normal  0.872745 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2819  putative nitrate transport protein  27.91 
 
 		 469 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.469609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6461  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  28.25 
 
 		 437 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325074 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1612  nitrate-binding protein NasS  32.96 
 
 		 400 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.837424  hitchhiker  0.00000000179069 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05588  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic component  29.36 
 
 		 454 aa  150  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001607  nitrate ABC transporter nitrate-binding protein  29.64 
 
 		 449 aa  150  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2504  nitrate-binding protein nrtA precursor, periplasmic  28.78 
 
 		 450 aa  150  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1153  nitrate transporter system, periplasmic component  27.16 
 
 		 461 aa  149  8e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3522  twin-arginine translocation pathway signal  28.81 
 
 		 414 aa  149  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0056  NO3-/NO2-ABC transporter  25.6 
 
 		 405 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2264  histidine kinase  28.89 
 
 		 470 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00574253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3267  twin-arginine translocation pathway signal  28.24 
 
 		 414 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1414  twin-arginine translocation pathway signal  28.17 
 
 		 414 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.922981 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4470  nitrate ABC transporter, substrate-binding protein  28.04 
 
 		 437 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.214365 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0381  putative nitrate transporter protein  30.34 
 
 		 420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.492425 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1785  nitrate-binding protein NasS, putative  31.92 
 
 		 403 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1605  nitrate-binding protein NasS  33.12 
 
 		 421 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2417  putative nitrate transport protein  28.13 
 
 		 466 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0665  nitrate-binding protein NrtA precursor, periplasmic  29.29 
 
 		 475 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0120522  decreased coverage  0.00176089 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4570  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  30.35 
 
 		 668 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.177412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1115  putative nitrate transport protein  27.27 
 
 		 491 aa  147  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2147  twin-arginine translocation pathway signal  28.07 
 
 		 414 aa  147  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0258  putative nitrate transporter protein  30.45 
 
 		 426 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.753989 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5674  ABC nitrate transporter, periplasmic ligand binding protein  32.19 
 
 		 383 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.679378 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0327  nitrate transporter periplasmic component  27.61 
 
 		 433 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2733  nitrate-binding proteint  30.03 
 
 		 419 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0237  putative nitrate transporter protein  30.45 
 
 		 426 aa  147  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23460  nitrate/nitrite transport system substrate-binding protein ; NasS  32.22 
 
 		 440 aa  146  6e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143963  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2831  twin-arginine translocation pathway signal  28.22 
 
 		 414 aa  146  6e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2497  nitrate-binding proteint  29.83 
 
 		 418 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.722347  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1672  putative regulatory protein  33.97 
 
 		 353 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0247  nitrate transport ATP-binding protein  33.97 
 
 		 353 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4496  twin-arginine translocation pathway signal  26.84 
 
 		 430 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1541  nitrate-binding proteint  29.61 
 
 		 419 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2320  twin-arginine translocation pathway signal  27.95 
 
 		 414 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1392  NO3-/NO2- ABC transporter  29.11 
 
 		 417 aa  145  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4396  nitrate transport protein  26.8 
 
 		 444 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4959  twin-arginine translocation pathway signal  26.97 
 
 		 430 aa  143  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4459  ABC transporter substrate binding protein (nitrate)  26.8 
 
 		 444 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.714854  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3316  putative nitrate ABC transporter, periplasmic nitrate-binding protein  28.53 
 
 		 461 aa  143  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.163343  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03654  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  28.33 
 
 		 469 aa  143  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2377  twin-arginine translocation pathway signal  27.37 
 
 		 426 aa  142  7e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>